Protein–RNA interactions for Protein: Q9P0J7

KCMF1, E3 ubiquitin-protein ligase KCMF1, humanhuman

Predictions only

Length 381 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCMF1Q9P0J7 YTHDF2-209ENST00000542507 2825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
KCMF1Q9P0J7 STK4-AS1-201ENST00000434401 2065 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
KCMF1Q9P0J7 NUDT4P1-201ENST00000322209 1206 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
KCMF1Q9P0J7 ASB12-201ENST00000362002 1289 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
KCMF1Q9P0J7 RETN-202ENST00000381324 249 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
KCMF1Q9P0J7 WDR53-203ENST00000429115 683 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
KCMF1Q9P0J7 AC055876.3-201ENST00000431496 288 ntBASIC15.06■□□□□ 0
KCMF1Q9P0J7 ZFAND2B-212ENST00000444522 1199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
KCMF1Q9P0J7 TIMM17B-208ENST00000495490 939 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
KCMF1Q9P0J7 SSBP1-214ENST00000498107 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
KCMF1Q9P0J7 AC093214.1-201ENST00000511688 1107 ntBASIC15.06■□□□□ 0
KCMF1Q9P0J7 LY6E-204ENST00000519546 971 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
KCMF1Q9P0J7 IGHV3-42-201ENST00000520410 361 ntBASIC15.06■□□□□ 0
KCMF1Q9P0J7 TGIF2-C20orf24-201ENST00000558530 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
KCMF1Q9P0J7 DUT-210ENST00000559935 569 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
KCMF1Q9P0J7 MZF1-202ENST00000594108 1110 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
KCMF1Q9P0J7 AC097359.3-201ENST00000603982 1210 ntBASIC15.06■□□□□ 0
KCMF1Q9P0J7 AC138649.4-201ENST00000612222 287 ntBASIC15.06■□□□□ 0
KCMF1Q9P0J7 FAM92A-219ENST00000620645 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
KCMF1Q9P0J7 SUCLA2-201ENST00000378654 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
KCMF1Q9P0J7 LINC02551-202ENST00000533812 2203 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
KCMF1Q9P0J7 PSMD9-201ENST00000261817 2307 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
KCMF1Q9P0J7 CDIP1-206ENST00000563507 1463 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
KCMF1Q9P0J7 ANXA11-203ENST00000422982 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
KCMF1Q9P0J7 BACE2-203ENST00000347667 8764 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
KCMF1Q9P0J7 ELAVL3-201ENST00000359227 4729 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
KCMF1Q9P0J7 DUSP14-204ENST00000613659 1559 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
KCMF1Q9P0J7 PAX6-276ENST00000640684 1557 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
KCMF1Q9P0J7 RAB5C-201ENST00000346213 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
KCMF1Q9P0J7 TMEM161A-206ENST00000587583 1654 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
KCMF1Q9P0J7 KLF11-201ENST00000305883 4030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
KCMF1Q9P0J7 SNAP47-AS1-201ENST00000413347 1708 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
KCMF1Q9P0J7 C5orf24-204ENST00000504727 2923 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
KCMF1Q9P0J7 ARL8B-201ENST00000256496 3005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
KCMF1Q9P0J7 ABCB6-201ENST00000265316 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
KCMF1Q9P0J7 TIPRL-202ENST00000367833 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
KCMF1Q9P0J7 ACSM2A-203ENST00000417235 1835 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
KCMF1Q9P0J7 NR6A1-205ENST00000487099 7031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
KCMF1Q9P0J7 FBXL5-201ENST00000341285 3385 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
KCMF1Q9P0J7 ARHGAP11B-210ENST00000622744 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
KCMF1Q9P0J7 VAV2-201ENST00000371850 4837 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
KCMF1Q9P0J7 ST14-201ENST00000278742 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
KCMF1Q9P0J7 AP003680.1-201ENST00000598970 3660 ntBASIC15.05■□□□□ 0
KCMF1Q9P0J7 INPP4A-202ENST00000409016 9996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
KCMF1Q9P0J7 FLII-221ENST00000578558 2377 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
KCMF1Q9P0J7 NR4A3-204ENST00000618101 5706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
KCMF1Q9P0J7 CADPS2-204ENST00000412584 4308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
KCMF1Q9P0J7 IMPA1-201ENST00000256108 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
KCMF1Q9P0J7 MAP4K1-208ENST00000589130 2654 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
KCMF1Q9P0J7 BTC-201ENST00000395743 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
KCMF1Q9P0J7 ACSL3-201ENST00000357430 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
KCMF1Q9P0J7 SMARCD1-202ENST00000394963 3658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
KCMF1Q9P0J7 GBA2-202ENST00000378094 3757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
KCMF1Q9P0J7 SPAG7-201ENST00000206020 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
KCMF1Q9P0J7 DYNLL1-201ENST00000242577 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
KCMF1Q9P0J7 TMEM120A-203ENST00000439537 1161 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
KCMF1Q9P0J7 FOLR3-201ENST00000442948 805 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
KCMF1Q9P0J7 AC008406.2-201ENST00000507058 532 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
KCMF1Q9P0J7 CNOT8-210ENST00000519404 945 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
KCMF1Q9P0J7 CNOT8-214ENST00000520671 923 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
KCMF1Q9P0J7 CNOT8-218ENST00000521583 1151 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
KCMF1Q9P0J7 AL139349.1-201ENST00000530479 577 ntTSL 4 BASIC15.05■□□□□ -0
KCMF1Q9P0J7 DCUN1D5-209ENST00000531543 1030 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
KCMF1Q9P0J7 AL928654.4-206ENST00000551180 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
KCMF1Q9P0J7 AC116003.1-201ENST00000578340 536 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
KCMF1Q9P0J7 ARMC7-205ENST00000584947 445 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
KCMF1Q9P0J7 ZNF667-AS1-204ENST00000588158 921 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
KCMF1Q9P0J7 RAB3D-202ENST00000589655 924 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
KCMF1Q9P0J7 AC016168.1-201ENST00000591422 722 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
KCMF1Q9P0J7 LINC00237-203ENST00000593272 630 ntTSL 4 BASIC15.05■□□□□ -0
KCMF1Q9P0J7 AL390955.2-201ENST00000603032 514 ntBASIC15.05■□□□□ -0
KCMF1Q9P0J7 AL590560.3-201ENST00000623350 461 ntBASIC15.05■□□□□ -0
KCMF1Q9P0J7 CLN3-246ENST00000636228 1224 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
KCMF1Q9P0J7 AL033527.5-202ENST00000641632 1098 ntBASIC15.05■□□□□ -0
KCMF1Q9P0J7 KIF26A-201ENST00000315264 6714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
KCMF1Q9P0J7 UGT8-201ENST00000310836 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
KCMF1Q9P0J7 NPBWR2-201ENST00000369768 1352 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
KCMF1Q9P0J7 HACE1-201ENST00000262903 4576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
KCMF1Q9P0J7 PITX2-204ENST00000394595 1693 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
KCMF1Q9P0J7 IL11RA-202ENST00000441545 1700 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
KCMF1Q9P0J7 TRIM17-205ENST00000456946 1731 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
KCMF1Q9P0J7 CLEC18B-201ENST00000339953 1865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
KCMF1Q9P0J7 CLEC18C-202ENST00000536907 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
KCMF1Q9P0J7 SLC34A1-204ENST00000512593 1912 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
KCMF1Q9P0J7 C14orf93-207ENST00000397382 1986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
KCMF1Q9P0J7 CERNA1-202ENST00000560518 1972 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
KCMF1Q9P0J7 ABHD3-201ENST00000289119 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
KCMF1Q9P0J7 PLEKHN1-201ENST00000379407 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
KCMF1Q9P0J7 IQSEC3-203ENST00000538872 7094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
KCMF1Q9P0J7 CHMP1A-201ENST00000397901 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
KCMF1Q9P0J7 GPR61-206ENST00000616874 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
KCMF1Q9P0J7 PLXNC1-201ENST00000258526 7346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
KCMF1Q9P0J7 DYNLL2-201ENST00000579991 6805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
KCMF1Q9P0J7 AFAP1L2-202ENST00000369271 3964 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
KCMF1Q9P0J7 MX1-210ENST00000455164 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
KCMF1Q9P0J7 ANKK1-201ENST00000303941 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
KCMF1Q9P0J7 FAM218A-201ENST00000513876 2175 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
KCMF1Q9P0J7 NT5C3A-204ENST00000405342 1759 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
KCMF1Q9P0J7 USP42-201ENST00000306177 5155 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
KCMF1Q9P0J7 ALOX12-AS1-201ENST00000399540 1730 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.8 ms