Protein–RNA interactions for Protein: Q9NY47

CACNA2D2, Voltage-dependent calcium channel subunit alpha-2/delta-2, humanhuman

Predictions only

Length 1,150 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNA2D2Q9NY47 AIFM1-202ENST00000319908 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CACNA2D2Q9NY47 TLE2-203ENST00000443826 2238 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CACNA2D2Q9NY47 SLC17A7-204ENST00000600601 2237 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CACNA2D2Q9NY47 AC103702.1-201ENST00000548801 2630 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
CACNA2D2Q9NY47 TPCN1-201ENST00000335509 5274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CACNA2D2Q9NY47 PRR5-203ENST00000403581 2279 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CACNA2D2Q9NY47 IFRD1-202ENST00000403825 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CACNA2D2Q9NY47 ZMYM3-202ENST00000373978 1511 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CACNA2D2Q9NY47 FHL2-205ENST00000393353 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CACNA2D2Q9NY47 PTPRF-201ENST00000359947 7727 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CACNA2D2Q9NY47 C16orf71-201ENST00000299320 2722 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CACNA2D2Q9NY47 NTRK2-205ENST00000376208 8178 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CACNA2D2Q9NY47 PPP1R21-202ENST00000294952 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CACNA2D2Q9NY47 RUSC1-203ENST00000368349 1968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CACNA2D2Q9NY47 TMPRSS13-203ENST00000524993 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CACNA2D2Q9NY47 FAM53A-201ENST00000308132 2802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CACNA2D2Q9NY47 SLC9A5-201ENST00000299798 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CACNA2D2Q9NY47 ARHGEF28-211ENST00000512883 2936 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CACNA2D2Q9NY47 CCDC71L-202ENST00000523505 4232 ntAPPRIS P2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CACNA2D2Q9NY47 SPAG7-201ENST00000206020 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CACNA2D2Q9NY47 FLYWCH2-201ENST00000293981 915 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CACNA2D2Q9NY47 PQLC2L-201ENST00000312275 1201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CACNA2D2Q9NY47 SLC18B1-202ENST00000367918 472 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CACNA2D2Q9NY47 TRIM74-202ENST00000395244 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CACNA2D2Q9NY47 ESPNP-202ENST00000414828 571 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CACNA2D2Q9NY47 AL136311.1-206ENST00000416069 899 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CACNA2D2Q9NY47 TRIM73-204ENST00000447409 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CACNA2D2Q9NY47 AL356441.1-201ENST00000452618 492 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CACNA2D2Q9NY47 PKD2-202ENST00000502363 1222 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CACNA2D2Q9NY47 AP001107.3-201ENST00000534065 544 ntTSL 4 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CACNA2D2Q9NY47 TPRX2P-201ENST00000535362 881 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
CACNA2D2Q9NY47 TGIF2-C20orf24-201ENST00000558530 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CACNA2D2Q9NY47 ZNF586-205ENST00000598885 578 ntTSL 4 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CACNA2D2Q9NY47 SPIN2A-203ENST00000614076 966 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CACNA2D2Q9NY47 GNAS-212ENST00000371098 1719 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CACNA2D2Q9NY47 NPNT-201ENST00000305572 3003 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CACNA2D2Q9NY47 PI16-201ENST00000373674 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CACNA2D2Q9NY47 DNAJC10-210ENST00000616986 5783 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CACNA2D2Q9NY47 GDPD3-202ENST00000406256 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CACNA2D2Q9NY47 SLC7A15P-201ENST00000424028 1363 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
CACNA2D2Q9NY47 CDH15-201ENST00000289746 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CACNA2D2Q9NY47 LMF1-AS1-202ENST00000569574 1408 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CACNA2D2Q9NY47 PRICKLE1-211ENST00000639566 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CACNA2D2Q9NY47 AP1AR-201ENST00000274000 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CACNA2D2Q9NY47 PRKAG1-217ENST00000552212 1497 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CACNA2D2Q9NY47 TUBB6-211ENST00000591208 1492 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CACNA2D2Q9NY47 GRM5-205ENST00000455756 7927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CACNA2D2Q9NY47 HNRNPLL-212ENST00000608859 3035 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CACNA2D2Q9NY47 SLITRK2-202ENST00000370490 7672 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CACNA2D2Q9NY47 COLGALT2-201ENST00000361927 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CACNA2D2Q9NY47 SREBF1-201ENST00000261646 4178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CACNA2D2Q9NY47 GALE-216ENST00000617979 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CACNA2D2Q9NY47 PRR19-204ENST00000598490 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CACNA2D2Q9NY47 SLC29A1-209ENST00000427851 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CACNA2D2Q9NY47 KLHL36-204ENST00000564996 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CACNA2D2Q9NY47 TBRG4-203ENST00000395655 2225 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CACNA2D2Q9NY47 PHF23-202ENST00000454255 1662 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CACNA2D2Q9NY47 VEPH1-218ENST00000494677 1714 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CACNA2D2Q9NY47 TPD52L2-204ENST00000351424 2302 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CACNA2D2Q9NY47 MGME1-201ENST00000377704 1781 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CACNA2D2Q9NY47 PITPNM1-201ENST00000356404 4225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CACNA2D2Q9NY47 TYSND1-201ENST00000287078 3644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CACNA2D2Q9NY47 CD1E-213ENST00000444681 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CACNA2D2Q9NY47 CHST3-201ENST00000373115 6970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CACNA2D2Q9NY47 MRPL13-201ENST00000306185 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CACNA2D2Q9NY47 AC098614.1-201ENST00000368528 745 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
CACNA2D2Q9NY47 SSR4-204ENST00000370087 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CACNA2D2Q9NY47 RAC2-203ENST00000405484 842 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CACNA2D2Q9NY47 AP006294.1-201ENST00000415407 339 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
CACNA2D2Q9NY47 AC068898.1-201ENST00000440750 335 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CACNA2D2Q9NY47 AC008406.2-201ENST00000507058 532 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CACNA2D2Q9NY47 SERF1B-208ENST00000515588 792 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CACNA2D2Q9NY47 RPL10P19-202ENST00000520582 722 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CACNA2D2Q9NY47 SCN4B-204ENST00000529878 566 ntTSL 4 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CACNA2D2Q9NY47 AC023310.3-201ENST00000557027 670 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
CACNA2D2Q9NY47 AC100756.1-201ENST00000562736 682 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
CACNA2D2Q9NY47 AC020978.5-201ENST00000564147 533 ntTSL 4 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CACNA2D2Q9NY47 AC138749.3-201ENST00000567691 622 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
CACNA2D2Q9NY47 AC007216.4-201ENST00000574364 562 ntTSL 4 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CACNA2D2Q9NY47 SNHG15-207ENST00000582727 1039 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CACNA2D2Q9NY47 AC116165.1-201ENST00000611806 668 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
CACNA2D2Q9NY47 5S_rRNA.22-201ENST00000614916 106 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
CACNA2D2Q9NY47 HIST1H2AB-201ENST00000615868 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CACNA2D2Q9NY47 MIR6799-201ENST00000620297 69 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
CACNA2D2Q9NY47 INHBB-201ENST00000295228 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CACNA2D2Q9NY47 FOLH1-201ENST00000256999 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CACNA2D2Q9NY47 SASH3-201ENST00000356892 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CACNA2D2Q9NY47 LGALS3BP-218ENST00000591778 1961 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CACNA2D2Q9NY47 KLK8-211ENST00000600767 1324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CACNA2D2Q9NY47 ATP6AP2-233ENST00000638153 1303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CACNA2D2Q9NY47 SOX30-202ENST00000311371 2716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CACNA2D2Q9NY47 MYOC-201ENST00000037502 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CACNA2D2Q9NY47 RASGRF1-203ENST00000558480 6237 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CACNA2D2Q9NY47 MGAT1-201ENST00000307826 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CACNA2D2Q9NY47 BBS5-201ENST00000295240 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CACNA2D2Q9NY47 TPD52L2-209ENST00000611972 2197 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CACNA2D2Q9NY47 TSPAN12-202ENST00000415871 1495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CACNA2D2Q9NY47 PRKX-201ENST00000262848 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CACNA2D2Q9NY47 RFWD2-204ENST00000367669 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CACNA2D2Q9NY47 TCP10-201ENST00000366827 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.8 ms