Protein–RNA interactions for Protein: Q9NXS3

KLHL28, Kelch-like protein 28, humanhuman

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Length 571 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL28Q9NXS3 IZUMO4-201ENST00000395296 869 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
KLHL28Q9NXS3 AP1S3-202ENST00000396653 589 ntTSL 4 BASIC14.9□□□□□ -0.02
KLHL28Q9NXS3 PTGES3-204ENST00000448157 1017 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
KLHL28Q9NXS3 C8orf46-205ENST00000480005 865 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
KLHL28Q9NXS3 MLF1-210ENST00000484955 1247 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
KLHL28Q9NXS3 LEKR1-211ENST00000498839 616 ntTSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
KLHL28Q9NXS3 SEC24B-AS1-201ENST00000499359 957 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
KLHL28Q9NXS3 SEC24B-AS1-204ENST00000510971 554 ntTSL 4 BASIC14.9□□□□□ -0.02
KLHL28Q9NXS3 FAM227B-204ENST00000558594 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
KLHL28Q9NXS3 AC129926.1-201ENST00000581944 614 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
KLHL28Q9NXS3 AC006116.8-201ENST00000587004 987 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
KLHL28Q9NXS3 CITED2-204ENST00000618718 901 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
KLHL28Q9NXS3 PDCD6-214ENST00000628729 1073 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
KLHL28Q9NXS3 AL157832.3-201ENST00000635764 1005 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
KLHL28Q9NXS3 AC092902.6-201ENST00000641783 218 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
KLHL28Q9NXS3 AC009802.1-201ENST00000637973 1609 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
KLHL28Q9NXS3 RIC8B-213ENST00000638198 1611 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
KLHL28Q9NXS3 CCNY-201ENST00000265375 4768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
KLHL28Q9NXS3 YTHDF3-216ENST00000623280 5193 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
KLHL28Q9NXS3 IPO8-201ENST00000256079 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
KLHL28Q9NXS3 TRAF3-204ENST00000539721 1786 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
KLHL28Q9NXS3 NTNG1-203ENST00000370066 1443 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
KLHL28Q9NXS3 IFT140-201ENST00000361339 2987 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
KLHL28Q9NXS3 ARHGEF1-204ENST00000378152 2986 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
KLHL28Q9NXS3 WDR45-202ENST00000356463 1688 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
KLHL28Q9NXS3 AFF3-203ENST00000409579 4342 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
KLHL28Q9NXS3 SNAP47-213ENST00000617596 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
KLHL28Q9NXS3 TMEM225B-202ENST00000431679 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
KLHL28Q9NXS3 TLN1-201ENST00000314888 8823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
KLHL28Q9NXS3 ABHD3-201ENST00000289119 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
KLHL28Q9NXS3 FES-204ENST00000414248 2327 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
KLHL28Q9NXS3 ST6GAL2-204ENST00000409382 7275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
KLHL28Q9NXS3 ACP2-201ENST00000256997 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
KLHL28Q9NXS3 OTX1-201ENST00000282549 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
KLHL28Q9NXS3 MED19-201ENST00000337672 1637 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
KLHL28Q9NXS3 OTX1-202ENST00000366671 2861 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
KLHL28Q9NXS3 TMEM181-201ENST00000367090 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
KLHL28Q9NXS3 LOX-206ENST00000639739 1626 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
KLHL28Q9NXS3 CHRD-201ENST00000204604 3521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
KLHL28Q9NXS3 EML3-202ENST00000394773 3256 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
KLHL28Q9NXS3 NDUFA4L2-201ENST00000393825 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
KLHL28Q9NXS3 C6orf47-AS1-203ENST00000422049 673 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
KLHL28Q9NXS3 AC098859.1-201ENST00000502915 1238 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
KLHL28Q9NXS3 AC105233.2-201ENST00000523697 349 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
KLHL28Q9NXS3 AF228730.5-201ENST00000530288 346 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
KLHL28Q9NXS3 STT3A-AS1-201ENST00000530526 429 ntTSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
KLHL28Q9NXS3 RIMS4-202ENST00000541604 1036 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
KLHL28Q9NXS3 RARRES2P8-201ENST00000566335 367 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
KLHL28Q9NXS3 AC027612.4-201ENST00000605371 583 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
KLHL28Q9NXS3 SLC9A3-AS1-205ENST00000606319 477 ntTSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
KLHL28Q9NXS3 E2F3-201ENST00000346618 4749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
KLHL28Q9NXS3 ATP11A-AS1-201ENST00000446442 2192 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
KLHL28Q9NXS3 AC007182.1-201ENST00000455232 2159 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
KLHL28Q9NXS3 AP4B1-204ENST00000369569 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
KLHL28Q9NXS3 NARF-206ENST00000457415 1668 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
KLHL28Q9NXS3 ABHD2-207ENST00000565973 2347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
KLHL28Q9NXS3 DBN1-202ENST00000309007 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
KLHL28Q9NXS3 PPP1R21-202ENST00000294952 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
KLHL28Q9NXS3 ATP6V1B2-201ENST00000276390 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
KLHL28Q9NXS3 HARS2-206ENST00000508522 1562 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
KLHL28Q9NXS3 KHNYN-201ENST00000251343 6725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
KLHL28Q9NXS3 KMT2E-202ENST00000311117 6874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
KLHL28Q9NXS3 HAUS3-204ENST00000506763 3166 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
KLHL28Q9NXS3 NFATC1-207ENST00000545796 3558 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
KLHL28Q9NXS3 TONSL-203ENST00000613741 1713 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
KLHL28Q9NXS3 ADSL-220ENST00000636714 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
KLHL28Q9NXS3 AHCY-201ENST00000217426 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
KLHL28Q9NXS3 ZFY-201ENST00000155093 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
KLHL28Q9NXS3 MRPS21-201ENST00000581066 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
KLHL28Q9NXS3 ARL6IP1-201ENST00000304414 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
KLHL28Q9NXS3 PRSS50-201ENST00000460241 2960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
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KLHL28Q9NXS3 GCLC-213ENST00000616923 3694 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
KLHL28Q9NXS3 CAMSAP1-203ENST00000409386 5730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
KLHL28Q9NXS3 SERAC1-201ENST00000367101 1907 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
KLHL28Q9NXS3 UNC5B-202ENST00000373192 6451 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
KLHL28Q9NXS3 DSEL-201ENST00000310045 9531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
KLHL28Q9NXS3 PHKG2-201ENST00000328273 1536 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
KLHL28Q9NXS3 SYDE1-204ENST00000600440 3058 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
KLHL28Q9NXS3 RASAL1-207ENST00000548055 2502 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
KLHL28Q9NXS3 GHDC-201ENST00000301671 2650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
KLHL28Q9NXS3 C9orf116-202ENST00000371789 1278 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
KLHL28Q9NXS3 CYTH4-203ENST00000405206 636 ntTSL 4 BASIC14.88□□□□□ -0.03
KLHL28Q9NXS3 MIPEPP3-202ENST00000424756 347 ntTSL 3 BASIC14.88□□□□□ -0.03
KLHL28Q9NXS3 AP000344.2-201ENST00000512987 629 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
KLHL28Q9NXS3 AC119403.1-201ENST00000520090 776 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
KLHL28Q9NXS3 AHSA1-202ENST00000535854 1173 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
KLHL28Q9NXS3 AC243562.2-201ENST00000561247 970 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
KLHL28Q9NXS3 HNRNPDL-206ENST00000602300 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
KLHL28Q9NXS3 AC106028.4-201ENST00000614509 607 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
KLHL28Q9NXS3 LINC01270-201ENST00000371639 2281 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
KLHL28Q9NXS3 PDP1-201ENST00000297598 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
KLHL28Q9NXS3 NFIC-203ENST00000443272 1716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
KLHL28Q9NXS3 TACR2-203ENST00000619173 1713 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
KLHL28Q9NXS3 ABCB6-201ENST00000265316 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
KLHL28Q9NXS3 ELP1-201ENST00000374647 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
KLHL28Q9NXS3 AP002360.1-202ENST00000530460 2462 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
KLHL28Q9NXS3 ZNF114-204ENST00000595607 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
KLHL28Q9NXS3 PPM1F-201ENST00000263212 5143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
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