Protein–RNA interactions for Protein: Q9NUE0

ZDHHC18, Palmitoyltransferase ZDHHC18, humanhuman

Predictions only

Length 388 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZDHHC18Q9NUE0 AC026688.2-201ENST00000518984 1734 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ZDHHC18Q9NUE0 COMP-201ENST00000222271 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ZDHHC18Q9NUE0 SYP-201ENST00000263233 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ZDHHC18Q9NUE0 ANXA6-215ENST00000523714 2451 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ZDHHC18Q9NUE0 C20orf166-AS1-203ENST00000475015 2585 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ZDHHC18Q9NUE0 SPPL2B-207ENST00000610743 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ZDHHC18Q9NUE0 ADCYAP1-203ENST00000579794 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ZDHHC18Q9NUE0 TMCC2-202ENST00000330675 2780 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ZDHHC18Q9NUE0 LRRFIP1-201ENST00000244815 4370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ZDHHC18Q9NUE0 AQP12A-201ENST00000337801 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ZDHHC18Q9NUE0 GUK1-202ENST00000366716 940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ZDHHC18Q9NUE0 TMEM239-202ENST00000380585 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ZDHHC18Q9NUE0 SDR39U1-201ENST00000399395 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ZDHHC18Q9NUE0 PHKG1P2-201ENST00000457537 863 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
ZDHHC18Q9NUE0 AC122138.1-201ENST00000508799 646 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ZDHHC18Q9NUE0 KRT16P2-202ENST00000579062 563 ntTSL 4 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ZDHHC18Q9NUE0 AC243547.2-201ENST00000616257 234 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ZDHHC18Q9NUE0 CDC42BPG-201ENST00000342711 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ZDHHC18Q9NUE0 TRAF3-202ENST00000351691 2239 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ZDHHC18Q9NUE0 RCOR2-201ENST00000301459 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ZDHHC18Q9NUE0 C11orf16-202ENST00000525780 1685 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ZDHHC18Q9NUE0 KRT8-215ENST00000552150 1687 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ZDHHC18Q9NUE0 PPM1F-202ENST00000397495 1778 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ZDHHC18Q9NUE0 NID1-202ENST00000366595 5412 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ZDHHC18Q9NUE0 ADAM33-206ENST00000617732 1971 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ZDHHC18Q9NUE0 ANKRD20A5P-207ENST00000581935 2089 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ZDHHC18Q9NUE0 CCDC116-201ENST00000292779 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ZDHHC18Q9NUE0 NR3C1-209ENST00000503201 2594 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ZDHHC18Q9NUE0 IDH2-201ENST00000330062 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ZDHHC18Q9NUE0 LINC02495-201ENST00000508601 4167 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ZDHHC18Q9NUE0 KIF25-202ENST00000354419 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ZDHHC18Q9NUE0 ACTL6A-202ENST00000429709 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ZDHHC18Q9NUE0 SCNN1D-205ENST00000379116 3044 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ZDHHC18Q9NUE0 NEO1-207ENST00000560262 4315 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ZDHHC18Q9NUE0 RALGDS-201ENST00000372047 3598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ZDHHC18Q9NUE0 LRRC6-213ENST00000620350 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ZDHHC18Q9NUE0 UNC13A-206ENST00000552293 5314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ZDHHC18Q9NUE0 DMAC2-201ENST00000221943 1692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ZDHHC18Q9NUE0 PLPPR4-203ENST00000457765 4846 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ZDHHC18Q9NUE0 SRGAP2C-201ENST00000304465 1477 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ZDHHC18Q9NUE0 FBP1-201ENST00000375326 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ZDHHC18Q9NUE0 SRGAP2-201ENST00000419187 1477 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ZDHHC18Q9NUE0 SRGAP2B-205ENST00000619678 1477 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ZDHHC18Q9NUE0 INS-201ENST00000250971 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ZDHHC18Q9NUE0 DCTN3-201ENST00000259632 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ZDHHC18Q9NUE0 LINC01293-201ENST00000453951 1266 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ZDHHC18Q9NUE0 NPM2-204ENST00000518119 1190 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ZDHHC18Q9NUE0 MAP1LC3B-207ENST00000565788 625 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ZDHHC18Q9NUE0 PRSS8-206ENST00000568261 1214 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ZDHHC18Q9NUE0 H3F3B-208ENST00000589599 576 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ZDHHC18Q9NUE0 AL161645.1-201ENST00000622716 1255 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
ZDHHC18Q9NUE0 KDM6A-202ENST00000382899 5789 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ZDHHC18Q9NUE0 QRICH2-205ENST00000636395 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ZDHHC18Q9NUE0 TBC1D9B-202ENST00000356834 5173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ZDHHC18Q9NUE0 ANP32A-203ENST00000465139 2440 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ZDHHC18Q9NUE0 DIAPH2-204ENST00000373054 3376 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ZDHHC18Q9NUE0 GOSR2-211ENST00000623037 1814 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ZDHHC18Q9NUE0 AC025674.2-201ENST00000522622 2971 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ZDHHC18Q9NUE0 HNF4G-201ENST00000354370 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ZDHHC18Q9NUE0 ARHGEF26-AS1-204ENST00000491862 2598 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ZDHHC18Q9NUE0 HNF1B-201ENST00000613727 1546 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ZDHHC18Q9NUE0 RAB3IP-204ENST00000378815 2386 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ZDHHC18Q9NUE0 PPM1B-204ENST00000378551 3877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ZDHHC18Q9NUE0 FAM83G-202ENST00000388995 5266 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ZDHHC18Q9NUE0 FSIP1-201ENST00000350221 2805 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ZDHHC18Q9NUE0 PHF12-205ENST00000577226 7679 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ZDHHC18Q9NUE0 NPM1-201ENST00000296930 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ZDHHC18Q9NUE0 ARHGEF28-201ENST00000296794 5246 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ZDHHC18Q9NUE0 PRODH2-201ENST00000301175 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ZDHHC18Q9NUE0 TRAPPC8-210ENST00000582513 3205 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ZDHHC18Q9NUE0 FER1L4-210ENST00000615531 5998 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
ZDHHC18Q9NUE0 NDOR1-202ENST00000371521 2497 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ZDHHC18Q9NUE0 FOXO3-202ENST00000406360 7341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ZDHHC18Q9NUE0 TMEM19-201ENST00000266673 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ZDHHC18Q9NUE0 TRMT10C-201ENST00000309922 1819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ZDHHC18Q9NUE0 CICP4-201ENST00000447359 2812 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
ZDHHC18Q9NUE0 NPB-201ENST00000333383 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ZDHHC18Q9NUE0 ASTL-201ENST00000342380 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ZDHHC18Q9NUE0 GSTO1-202ENST00000369713 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ZDHHC18Q9NUE0 COPS7B-207ENST00000410024 1103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ZDHHC18Q9NUE0 LINC00398-201ENST00000414407 906 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ZDHHC18Q9NUE0 CRCP-205ENST00000431089 942 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ZDHHC18Q9NUE0 CCDC74BP1-201ENST00000508880 1123 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
ZDHHC18Q9NUE0 HNRNPUP1-201ENST00000554987 333 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
ZDHHC18Q9NUE0 Z97055.2-201ENST00000563715 859 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ZDHHC18Q9NUE0 NBPF14-202ENST00000593495 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ZDHHC18Q9NUE0 PRKN-208ENST00000610470 531 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ZDHHC18Q9NUE0 PRKN-209ENST00000612485 225 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ZDHHC18Q9NUE0 SMN2-213ENST00000614240 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ZDHHC18Q9NUE0 AC116407.3-201ENST00000623905 1129 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
ZDHHC18Q9NUE0 LRRC42-201ENST00000319223 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ZDHHC18Q9NUE0 UCKL1-AS1-201ENST00000623569 3602 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
ZDHHC18Q9NUE0 PI4K2B-201ENST00000264864 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ZDHHC18Q9NUE0 YY1-201ENST00000262238 6697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ZDHHC18Q9NUE0 DDX50-206ENST00000610822 2510 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ZDHHC18Q9NUE0 RNFT2-203ENST00000392549 2896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ZDHHC18Q9NUE0 SLC22A16-202ENST00000368919 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ZDHHC18Q9NUE0 LINC01107-201ENST00000446979 1975 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ZDHHC18Q9NUE0 MYOZ1-201ENST00000359322 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ZDHHC18Q9NUE0 CYP2U1-201ENST00000332884 4944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39 ms