Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0J9

BHLHE41, Class E basic helix-loop-helix protein 41, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 482 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BHLHE41Q9C0J9 GALNT9-208ENST00000541995 1001 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
BHLHE41Q9C0J9 AP000763.4-201ENST00000544674 752 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
BHLHE41Q9C0J9 MAX-210ENST00000555419 765 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
BHLHE41Q9C0J9 NAA38-207ENST00000576861 556 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
BHLHE41Q9C0J9 IL11-202ENST00000585513 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
BHLHE41Q9C0J9 FXYD1-208ENST00000589209 428 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
BHLHE41Q9C0J9 MTDHP5-201ENST00000598980 586 ntBASIC15.07■□□□□ 0
BHLHE41Q9C0J9 FXYD1-211ENST00000612146 690 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
BHLHE41Q9C0J9 AC023511.2-201ENST00000618803 211 ntBASIC15.07■□□□□ 0
BHLHE41Q9C0J9 NLGN4X-203ENST00000381093 5865 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
BHLHE41Q9C0J9 FLAD1-205ENST00000368431 1803 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
BHLHE41Q9C0J9 NOP14-201ENST00000314262 2889 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
BHLHE41Q9C0J9 MAU2-201ENST00000262815 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
BHLHE41Q9C0J9 CORO1A-208ENST00000565497 1348 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
BHLHE41Q9C0J9 TLE3-215ENST00000559048 2918 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
BHLHE41Q9C0J9 KCNJ14-201ENST00000342291 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
BHLHE41Q9C0J9 PPIC-201ENST00000306442 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
BHLHE41Q9C0J9 PABPC4-201ENST00000372856 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
BHLHE41Q9C0J9 INPPL1-207ENST00000538751 4656 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
BHLHE41Q9C0J9 PSD-201ENST00000020673 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
BHLHE41Q9C0J9 MLKL-202ENST00000308807 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
BHLHE41Q9C0J9 ANKMY2-201ENST00000306999 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
BHLHE41Q9C0J9 UVSSA-206ENST00000507531 2597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
BHLHE41Q9C0J9 KIF18B-203ENST00000590129 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
BHLHE41Q9C0J9 TAF15-205ENST00000603777 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
BHLHE41Q9C0J9 C3orf67-201ENST00000295966 2650 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
BHLHE41Q9C0J9 CNOT8-204ENST00000517876 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
BHLHE41Q9C0J9 UXT-AS1-201ENST00000590504 1525 ntBASIC15.07■□□□□ 0
BHLHE41Q9C0J9 PAXBP1-202ENST00000331923 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
BHLHE41Q9C0J9 ALDH2-202ENST00000416293 1572 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
BHLHE41Q9C0J9 AP3S2-216ENST00000617003 1561 ntBASIC15.07■□□□□ 0
BHLHE41Q9C0J9 ZC2HC1C-201ENST00000238686 2249 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
BHLHE41Q9C0J9 ING1-203ENST00000375774 2870 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
BHLHE41Q9C0J9 CHRD-201ENST00000204604 3521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
BHLHE41Q9C0J9 MGME1-203ENST00000377710 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
BHLHE41Q9C0J9 IQCF3-205ENST00000456080 1685 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
BHLHE41Q9C0J9 KRT8-215ENST00000552150 1687 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
BHLHE41Q9C0J9 ARMC5-204ENST00000538189 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
BHLHE41Q9C0J9 RPS19-206ENST00000598742 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
BHLHE41Q9C0J9 AC003986.2-201ENST00000419944 1711 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
BHLHE41Q9C0J9 LZTR1-201ENST00000215739 4572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
BHLHE41Q9C0J9 DUSP18-201ENST00000334679 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
BHLHE41Q9C0J9 MAGEA8-201ENST00000286482 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
BHLHE41Q9C0J9 RUNDC3B-202ENST00000338056 4099 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
BHLHE41Q9C0J9 DBET-201ENST00000630918 3363 ntBASIC15.06■□□□□ 0
BHLHE41Q9C0J9 DUSP6-202ENST00000308385 1959 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
BHLHE41Q9C0J9 MYLK2-201ENST00000375985 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
BHLHE41Q9C0J9 LINC00996-201ENST00000477392 2043 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
BHLHE41Q9C0J9 KLHL7-201ENST00000322275 969 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
BHLHE41Q9C0J9 HIST1H2BD-202ENST00000377777 496 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
BHLHE41Q9C0J9 C21orf33-205ENST00000427803 1077 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
BHLHE41Q9C0J9 AL592309.1-201ENST00000443127 649 ntBASIC15.06■□□□□ 0
BHLHE41Q9C0J9 KIAA0930-215ENST00000496226 589 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
BHLHE41Q9C0J9 SMIM15-AS1-201ENST00000506902 796 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
BHLHE41Q9C0J9 CROCCP3-203ENST00000589964 255 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
BHLHE41Q9C0J9 MRPL34-205ENST00000600434 793 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
BHLHE41Q9C0J9 AC098484.3-202ENST00000603943 1011 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
BHLHE41Q9C0J9 AC073263.1-201ENST00000616370 494 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
BHLHE41Q9C0J9 AC055717.3-201ENST00000622967 595 ntBASIC15.06■□□□□ 0
BHLHE41Q9C0J9 CENPT-202ENST00000440851 2200 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
BHLHE41Q9C0J9 SYCE1-203ENST00000368517 1377 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
BHLHE41Q9C0J9 LINC02495-201ENST00000508601 4167 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
BHLHE41Q9C0J9 POLR2J4-203ENST00000326391 1422 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
BHLHE41Q9C0J9 PPL-201ENST00000345988 6238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
BHLHE41Q9C0J9 LRFN1-201ENST00000248668 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
BHLHE41Q9C0J9 SPRY1-207ENST00000610581 2608 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
BHLHE41Q9C0J9 AC004805.1-201ENST00000577662 1616 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
BHLHE41Q9C0J9 AC138035.3-201ENST00000622706 2791 ntBASIC15.06■□□□□ 0
BHLHE41Q9C0J9 C17orf74-201ENST00000333870 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
BHLHE41Q9C0J9 PYCR2-201ENST00000343818 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
BHLHE41Q9C0J9 TRPM2-208ENST00000621064 1669 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
BHLHE41Q9C0J9 IL11RA-202ENST00000441545 1700 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
BHLHE41Q9C0J9 ASAH1-240ENST00000636997 1774 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
BHLHE41Q9C0J9 TRA2B-205ENST00000453386 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
BHLHE41Q9C0J9 TVP23C-210ENST00000584811 2989 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
BHLHE41Q9C0J9 DUS2-202ENST00000432752 1864 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
BHLHE41Q9C0J9 PPP1R37-201ENST00000221462 3163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
BHLHE41Q9C0J9 SGK2-206ENST00000423407 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
BHLHE41Q9C0J9 SLC20A1-201ENST00000272542 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
BHLHE41Q9C0J9 AL162457.1-201ENST00000317652 2000 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
BHLHE41Q9C0J9 MLPH-203ENST00000409373 2031 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
BHLHE41Q9C0J9 STK4-AS1-201ENST00000434401 2065 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
BHLHE41Q9C0J9 TMED7-TICAM2-202ENST00000333314 3453 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
BHLHE41Q9C0J9 CDS2-203ENST00000460006 9298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
BHLHE41Q9C0J9 TOM1-209ENST00000447733 2317 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
BHLHE41Q9C0J9 PPIL6-207ENST00000521072 4128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
BHLHE41Q9C0J9 CAST-224ENST00000508830 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
BHLHE41Q9C0J9 TRAPPC11-202ENST00000357207 4435 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
BHLHE41Q9C0J9 PARP16-201ENST00000261888 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
BHLHE41Q9C0J9 AC100803.3-201ENST00000606664 2961 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
BHLHE41Q9C0J9 MRI1-202ENST00000319545 3027 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
BHLHE41Q9C0J9 PGR-210ENST00000619228 3038 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
BHLHE41Q9C0J9 RHOT1-203ENST00000358365 3297 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
BHLHE41Q9C0J9 ICA1L-201ENST00000358299 3457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
BHLHE41Q9C0J9 WIPF3-202ENST00000409123 3491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
BHLHE41Q9C0J9 EIF2AK4-208ENST00000559624 3548 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
BHLHE41Q9C0J9 GCLC-213ENST00000616923 3694 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
BHLHE41Q9C0J9 FCN3-201ENST00000270879 1030 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
BHLHE41Q9C0J9 TMEM270-201ENST00000320531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
BHLHE41Q9C0J9 NKX2-6-201ENST00000325017 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.2 ms