Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0F1

CEP44, Centrosomal protein of 44 kDa, humanhuman

Predictions only

Length 390 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CEP44Q9C0F1 MAP9-202ENST00000379248 1165 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CEP44Q9C0F1 NUDT1-205ENST00000397048 783 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CEP44Q9C0F1 AL035633.1-201ENST00000406139 838 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
CEP44Q9C0F1 LINC00475-203ENST00000417983 703 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CEP44Q9C0F1 AC093004.1-201ENST00000508850 424 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
CEP44Q9C0F1 LINC01184-209ENST00000514573 609 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CEP44Q9C0F1 CHMP4A-204ENST00000530996 967 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CEP44Q9C0F1 RAB26-202ENST00000541451 944 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CEP44Q9C0F1 TIMM17BP1-201ENST00000545713 516 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
CEP44Q9C0F1 AC190387.1-201ENST00000551683 408 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
CEP44Q9C0F1 TUBB3-203ENST00000553967 736 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CEP44Q9C0F1 AL391261.2-201ENST00000554907 773 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CEP44Q9C0F1 AP3S2-204ENST00000558011 738 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CEP44Q9C0F1 AC009065.5-201ENST00000565937 596 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CEP44Q9C0F1 ARL16-202ENST00000570561 768 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CEP44Q9C0F1 AC129507.1-201ENST00000570711 1013 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CEP44Q9C0F1 COX11-202ENST00000571584 1108 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CEP44Q9C0F1 ZNF324B-203ENST00000594214 564 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CEP44Q9C0F1 RRBP1-208ENST00000470422 2070 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CEP44Q9C0F1 AADAT-201ENST00000337664 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CEP44Q9C0F1 CYTH2-214ENST00000641098 2721 ntAPPRIS ALT1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CEP44Q9C0F1 LOH12CR2-201ENST00000381800 1540 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CEP44Q9C0F1 FAM76B-201ENST00000358780 3952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CEP44Q9C0F1 AFAP1L2-202ENST00000369271 3964 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CEP44Q9C0F1 PRPS2-203ENST00000398491 1348 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CEP44Q9C0F1 HCFC1-201ENST00000310441 8869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CEP44Q9C0F1 GABRB3-215ENST00000622697 5876 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CEP44Q9C0F1 CACNA1A-221ENST00000636012 7500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CEP44Q9C0F1 COMMD5-203ENST00000450361 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CEP44Q9C0F1 POLG2-201ENST00000539111 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CEP44Q9C0F1 TBC1D9B-202ENST00000356834 5173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CEP44Q9C0F1 C14orf93-202ENST00000341470 2221 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CEP44Q9C0F1 DIO3OS-208ENST00000556120 2473 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CEP44Q9C0F1 GRN-214ENST00000589265 1632 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CEP44Q9C0F1 SLC2A6-201ENST00000371897 2301 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CEP44Q9C0F1 PLK2-215ENST00000617412 2792 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CEP44Q9C0F1 EIF4E1B-203ENST00000504597 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CEP44Q9C0F1 SLCO2B1-205ENST00000525650 2121 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CEP44Q9C0F1 CTCF-201ENST00000264010 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CEP44Q9C0F1 SART1-201ENST00000312397 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CEP44Q9C0F1 FUK-207ENST00000571514 3054 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CEP44Q9C0F1 ALOX15-205ENST00000574640 2422 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CEP44Q9C0F1 H2BFWT-201ENST00000217926 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CEP44Q9C0F1 LINC00266-1-201ENST00000279067 928 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CEP44Q9C0F1 FLYWCH2-201ENST00000293981 915 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CEP44Q9C0F1 MRPL16-201ENST00000300151 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CEP44Q9C0F1 CUTA-202ENST00000374496 762 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CEP44Q9C0F1 AC104135.1-201ENST00000418001 763 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CEP44Q9C0F1 MEP1AP4-201ENST00000423244 1087 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
CEP44Q9C0F1 DFFBP1-201ENST00000433250 979 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
CEP44Q9C0F1 APOA1-AS-201ENST00000444200 563 ntTSL 4 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CEP44Q9C0F1 CRB3P1-201ENST00000449338 276 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
CEP44Q9C0F1 LINC02242-201ENST00000507298 641 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CEP44Q9C0F1 SPDYE18-201ENST00000510091 1050 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
CEP44Q9C0F1 EHF-205ENST00000527935 557 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CEP44Q9C0F1 AC084125.2-203ENST00000532766 821 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CEP44Q9C0F1 LINC02387-201ENST00000541749 868 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CEP44Q9C0F1 HNRNPUP1-201ENST00000554987 333 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
CEP44Q9C0F1 AC026471.2-201ENST00000569782 655 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CEP44Q9C0F1 TK2-207ENST00000544898 3441 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CEP44Q9C0F1 BCAT2-202ENST00000402551 2041 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CEP44Q9C0F1 YARS-201ENST00000373477 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CEP44Q9C0F1 PCDHA6-203ENST00000529310 5374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CEP44Q9C0F1 PEX5-206ENST00000434354 2253 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CEP44Q9C0F1 GLS2-216ENST00000610413 2296 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CEP44Q9C0F1 ASAH1-223ENST00000636171 2283 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CEP44Q9C0F1 TMEM53-204ENST00000372243 1579 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CEP44Q9C0F1 UEVLD-203ENST00000379387 1848 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CEP44Q9C0F1 SHISA5-210ENST00000444115 2081 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CEP44Q9C0F1 DNAAF2-202ENST00000406043 2819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CEP44Q9C0F1 TPPP-201ENST00000360578 6022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CEP44Q9C0F1 AL391825.1-201ENST00000457671 1364 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
CEP44Q9C0F1 SNHG22-201ENST00000589499 1615 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CEP44Q9C0F1 HFE2-205ENST00000497365 1419 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CEP44Q9C0F1 ACSF3-204ENST00000406948 2247 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CEP44Q9C0F1 ASAH1-254ENST00000637636 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CEP44Q9C0F1 TNKS-211ENST00000520408 1964 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CEP44Q9C0F1 SSPN-201ENST00000242729 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CEP44Q9C0F1 LRRFIP1-201ENST00000244815 4370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CEP44Q9C0F1 EWSR1-201ENST00000331029 2267 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CEP44Q9C0F1 RBM6-210ENST00000442092 2260 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CEP44Q9C0F1 HLF-201ENST00000226067 5547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CEP44Q9C0F1 GRAMD2B-217ENST00000515200 3109 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CEP44Q9C0F1 ICMT-201ENST00000343813 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CEP44Q9C0F1 C1R-202ENST00000536053 2347 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CEP44Q9C0F1 IDH3B-201ENST00000380843 1545 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CEP44Q9C0F1 FTH1-201ENST00000273550 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CEP44Q9C0F1 NPM2-201ENST00000289820 1100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CEP44Q9C0F1 NPM2-202ENST00000381530 925 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CEP44Q9C0F1 STPG3-201ENST00000388931 1207 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CEP44Q9C0F1 FAM159B-201ENST00000389074 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CEP44Q9C0F1 KRTAP6-3-201ENST00000391624 636 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CEP44Q9C0F1 FAM166B-201ENST00000399742 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CEP44Q9C0F1 NCBP2-203ENST00000422610 676 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CEP44Q9C0F1 AL353779.1-201ENST00000434793 351 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
CEP44Q9C0F1 TARDBPP1-201ENST00000442013 1203 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
CEP44Q9C0F1 LINC00229-201ENST00000443783 500 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CEP44Q9C0F1 COX20P2-201ENST00000452636 358 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
CEP44Q9C0F1 FTH1-202ENST00000526640 786 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CEP44Q9C0F1 AC087741.1-202ENST00000573346 801 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.4 ms