Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYE7

PCGF6, Polycomb group RING finger protein 6, humanhuman

Predictions only

Length 350 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCGF6Q9BYE7 DMTN-207ENST00000517305 2551 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
PCGF6Q9BYE7 BEND4-202ENST00000504360 8692 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
PCGF6Q9BYE7 ATP6V0D1-201ENST00000290949 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
PCGF6Q9BYE7 ADHFE1-203ENST00000396623 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
PCGF6Q9BYE7 WASH6P-202ENST00000359512 1437 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
PCGF6Q9BYE7 ABCG1-203ENST00000361802 3034 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
PCGF6Q9BYE7 IGLL3P-201ENST00000412472 434 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
PCGF6Q9BYE7 CRB3-204ENST00000600229 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
PCGF6Q9BYE7 AL009183.1-201ENST00000603760 355 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
PCGF6Q9BYE7 ANKRD50-202ENST00000515641 4212 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.53
PCGF6Q9BYE7 ZNF79-201ENST00000342483 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
PCGF6Q9BYE7 TMPRSS6-202ENST00000381792 3260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
PCGF6Q9BYE7 OSBP2-201ENST00000332585 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
PCGF6Q9BYE7 STAT1-203ENST00000392323 2723 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.53
PCGF6Q9BYE7 AC126365.1-201ENST00000578585 1514 ntBASIC24.64■■□□□ 1.53
PCGF6Q9BYE7 CNNM2-203ENST00000433628 3857 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.53
PCGF6Q9BYE7 CD300LG-204ENST00000539718 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
PCGF6Q9BYE7 PDIA4-201ENST00000286091 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
PCGF6Q9BYE7 FURIN-207ENST00000618099 4345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
PCGF6Q9BYE7 BTN1A1-201ENST00000244513 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
PCGF6Q9BYE7 MLLT10-203ENST00000377072 5126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
PCGF6Q9BYE7 TOX3-201ENST00000219746 3233 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
PCGF6Q9BYE7 GPR17-201ENST00000272644 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
PCGF6Q9BYE7 RNF168-201ENST00000318037 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
PCGF6Q9BYE7 PCDHA7-201ENST00000356878 2922 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
PCGF6Q9BYE7 CATSPER4-202ENST00000456354 1912 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
PCGF6Q9BYE7 FAM208B-201ENST00000328090 8626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
PCGF6Q9BYE7 DMTN-205ENST00000432128 2508 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
PCGF6Q9BYE7 USP35-203ENST00000529308 4216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
PCGF6Q9BYE7 IL21R-AS1-201ENST00000563191 2615 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
PCGF6Q9BYE7 ZNHIT1-201ENST00000305105 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
PCGF6Q9BYE7 RWDD3-202ENST00000370202 1235 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
PCGF6Q9BYE7 KRT18P34-201ENST00000488218 1270 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
PCGF6Q9BYE7 RAP1B-229ENST00000543393 874 ntTSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
PCGF6Q9BYE7 AAMP-201ENST00000248450 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
PCGF6Q9BYE7 SPHK2-202ENST00000340932 2492 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
PCGF6Q9BYE7 HYAL1-209ENST00000618175 2225 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
PCGF6Q9BYE7 CLDN6-201ENST00000328796 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
PCGF6Q9BYE7 REC8-209ENST00000611366 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
PCGF6Q9BYE7 ZNF365-205ENST00000395254 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
PCGF6Q9BYE7 SLC26A11-201ENST00000361193 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
PCGF6Q9BYE7 FIP1L1-207ENST00000507922 1335 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
PCGF6Q9BYE7 SLC38A5-212ENST00000619100 2100 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
PCGF6Q9BYE7 SLC38A5-214ENST00000622196 2100 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
PCGF6Q9BYE7 C21orf58-204ENST00000397682 2941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
PCGF6Q9BYE7 NR3C1-209ENST00000503201 2594 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
PCGF6Q9BYE7 FAM149B1-201ENST00000242505 5408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
PCGF6Q9BYE7 PTHLH-209ENST00000545234 1544 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
PCGF6Q9BYE7 RNFT2-203ENST00000392549 2896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
PCGF6Q9BYE7 PGAP3-211ENST00000619169 2094 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
PCGF6Q9BYE7 KRT27-201ENST00000301656 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
PCGF6Q9BYE7 SETD7-204ENST00000506866 1602 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
PCGF6Q9BYE7 PTPMT1-201ENST00000326656 928 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
PCGF6Q9BYE7 RPUSD3-201ENST00000383820 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
PCGF6Q9BYE7 AC093151.3-201ENST00000425554 623 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
PCGF6Q9BYE7 KRT18P56-201ENST00000507275 550 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
PCGF6Q9BYE7 MTUS1-215ENST00000519066 567 ntTSL 4 BASIC24.62■■□□□ 1.53
PCGF6Q9BYE7 FHL2-212ENST00000607522 759 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
PCGF6Q9BYE7 ZNF365-207ENST00000410046 3379 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
PCGF6Q9BYE7 STIP1-207ENST00000538945 1900 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
PCGF6Q9BYE7 FOXP3-206ENST00000557224 1371 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
PCGF6Q9BYE7 LINC01230-201ENST00000625222 3017 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
PCGF6Q9BYE7 SLC22A7-202ENST00000372585 2555 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
PCGF6Q9BYE7 LINC02167-203ENST00000566900 1489 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
PCGF6Q9BYE7 DYNLL2-201ENST00000579991 6805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
PCGF6Q9BYE7 TFE3-201ENST00000315869 3415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
PCGF6Q9BYE7 BNIP3P1-202ENST00000550043 1585 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
PCGF6Q9BYE7 AC148477.4-201ENST00000613430 1793 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
PCGF6Q9BYE7 TIMP2-201ENST00000262768 3652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
PCGF6Q9BYE7 AMIGO2-201ENST00000266581 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
PCGF6Q9BYE7 NTNG1-208ENST00000370074 3048 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
PCGF6Q9BYE7 KIF17-201ENST00000247986 3969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
PCGF6Q9BYE7 MRPS22-212ENST00000495075 1547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
PCGF6Q9BYE7 PCCB-204ENST00000462637 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
PCGF6Q9BYE7 DNAJC10-210ENST00000616986 5783 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
PCGF6Q9BYE7 RNF182-208ENST00000544682 3495 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.61■■□□□ 1.53
PCGF6Q9BYE7 CEP19-202ENST00000409690 2201 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
PCGF6Q9BYE7 PNPLA5-201ENST00000216177 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
PCGF6Q9BYE7 RNASEH2A-201ENST00000221486 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
PCGF6Q9BYE7 FAM3A-205ENST00000393572 1041 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
PCGF6Q9BYE7 AC092474.2-201ENST00000424288 719 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
PCGF6Q9BYE7 AP000688.1-201ENST00000535199 1221 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
PCGF6Q9BYE7 BAX-213ENST00000539787 458 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
PCGF6Q9BYE7 BRICD5-202ENST00000562360 783 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
PCGF6Q9BYE7 QPRT-203ENST00000562473 579 ntTSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
PCGF6Q9BYE7 CD7-202ENST00000578509 925 ntTSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
PCGF6Q9BYE7 AC012615.5-201ENST00000592720 581 ntTSL 4 BASIC24.61■■□□□ 1.53
PCGF6Q9BYE7 TMTC1-206ENST00000551659 4228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
PCGF6Q9BYE7 AC053503.2-201ENST00000420563 1598 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
PCGF6Q9BYE7 PEPD-202ENST00000397032 1754 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
PCGF6Q9BYE7 DNAJC7-202ENST00000426588 1774 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
PCGF6Q9BYE7 SCAMP4-202ENST00000409472 2394 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
PCGF6Q9BYE7 PAPOLA-223ENST00000557320 3264 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
PCGF6Q9BYE7 RAF1-201ENST00000251849 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
PCGF6Q9BYE7 AMACR-203ENST00000382072 2919 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
PCGF6Q9BYE7 TOM1L2-202ENST00000379504 2418 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
PCGF6Q9BYE7 PIP5K1A-202ENST00000368888 2134 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
PCGF6Q9BYE7 PIGT-246ENST00000639499 2021 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
PCGF6Q9BYE7 GOLGA2P9-201ENST00000596977 1937 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
PCGF6Q9BYE7 BEND6-203ENST00000370748 3497 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.5 ms