Protein–RNA interactions for Protein: Q9BSI4

TINF2, TERF1-interacting nuclear factor 2, humanhuman

Predictions only

Length 451 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TINF2Q9BSI4 ZDHHC23-201ENST00000330212 3778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
TINF2Q9BSI4 DIABLO-206ENST00000443649 2250 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
TINF2Q9BSI4 SPATA21-205ENST00000540400 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
TINF2Q9BSI4 RAB41-201ENST00000276066 1071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
TINF2Q9BSI4 DMAC2-202ENST00000301183 1134 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
TINF2Q9BSI4 C3orf22-201ENST00000318225 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
TINF2Q9BSI4 MUC1-202ENST00000338684 1107 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
TINF2Q9BSI4 CSHL1-203ENST00000346606 659 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
TINF2Q9BSI4 TNFAIP8L2-201ENST00000368910 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
TINF2Q9BSI4 RAB41-202ENST00000374473 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
TINF2Q9BSI4 CYB5R3-203ENST00000402438 1050 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
TINF2Q9BSI4 H2AFV-206ENST00000437072 589 ntTSL 4 BASIC17.62■□□□□ 0.41
TINF2Q9BSI4 Z93015.1-201ENST00000451718 390 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
TINF2Q9BSI4 MUC1-218ENST00000471283 635 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
TINF2Q9BSI4 EHF-205ENST00000527935 557 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
TINF2Q9BSI4 IL32-222ENST00000533097 814 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
TINF2Q9BSI4 AL355102.5-201ENST00000554769 572 ntTSL 4 BASIC17.62■□□□□ 0.41
TINF2Q9BSI4 AC009133.1-202ENST00000563806 494 ntTSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
TINF2Q9BSI4 HIRIP3-204ENST00000564026 988 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
TINF2Q9BSI4 TSR1-204ENST00000576112 1290 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
TINF2Q9BSI4 SPATA21-206ENST00000612240 603 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
TINF2Q9BSI4 IL32-201ENST00000008180 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
TINF2Q9BSI4 GRAMD1B-214ENST00000635736 2814 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
TINF2Q9BSI4 ST6GALNAC6-216ENST00000622357 2396 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
TINF2Q9BSI4 AHCYP2-201ENST00000430630 1300 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
TINF2Q9BSI4 KRT8P35-201ENST00000483942 1338 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
TINF2Q9BSI4 HCN1-201ENST00000303230 9885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
TINF2Q9BSI4 NRXN1-209ENST00000405581 5078 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
TINF2Q9BSI4 PANX2-201ENST00000159647 2964 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
TINF2Q9BSI4 NCK1-201ENST00000288986 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
TINF2Q9BSI4 TEAD4-203ENST00000397122 1396 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
TINF2Q9BSI4 LINC01168-201ENST00000461291 5254 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
TINF2Q9BSI4 BRPF1-203ENST00000424362 4712 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
TINF2Q9BSI4 SLC29A2-202ENST00000357440 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
TINF2Q9BSI4 SLC29A2-205ENST00000544554 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
TINF2Q9BSI4 CTSD-213ENST00000637915 1982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
TINF2Q9BSI4 UBE2Q2-201ENST00000267938 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
TINF2Q9BSI4 SNAP47-203ENST00000366760 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
TINF2Q9BSI4 RHNO1-209ENST00000618250 2070 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC17.62■□□□□ 0.41
TINF2Q9BSI4 PI16-201ENST00000373674 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
TINF2Q9BSI4 SACS-AS1-201ENST00000443092 2234 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
TINF2Q9BSI4 CALCB-202ENST00000523376 2258 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
TINF2Q9BSI4 KCNJ8-201ENST00000240662 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
TINF2Q9BSI4 PCDH7-206ENST00000543491 4457 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
TINF2Q9BSI4 AC080080.1-201ENST00000625121 2420 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
TINF2Q9BSI4 ZNF772-202ENST00000356584 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
TINF2Q9BSI4 GGNBP2-212ENST00000613102 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
TINF2Q9BSI4 RPL39L-201ENST00000296277 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
TINF2Q9BSI4 YARS2-201ENST00000324868 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
TINF2Q9BSI4 HIST1H2AH-201ENST00000377459 387 ntAPPRIS P1 BASIC17.61■□□□□ 0.41
TINF2Q9BSI4 AC007952.1-202ENST00000399083 1173 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
TINF2Q9BSI4 AC012640.1-201ENST00000509915 688 ntTSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
TINF2Q9BSI4 HYAL3-206ENST00000513170 636 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
TINF2Q9BSI4 NAALADL1-207ENST00000526799 959 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
TINF2Q9BSI4 AP001258.2-201ENST00000529891 490 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
TINF2Q9BSI4 TUBB8-202ENST00000562809 820 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
TINF2Q9BSI4 AC139099.3-201ENST00000572850 472 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
TINF2Q9BSI4 AC011510.1-201ENST00000598541 286 ntTSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
TINF2Q9BSI4 AL022328.3-201ENST00000607943 679 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
TINF2Q9BSI4 BX539320.1-201ENST00000623759 877 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
TINF2Q9BSI4 AC106017.2-201ENST00000631194 1173 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
TINF2Q9BSI4 SEMA6B-201ENST00000586582 3986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
TINF2Q9BSI4 KLHDC3-203ENST00000332245 1494 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
TINF2Q9BSI4 CKMT2-201ENST00000254035 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
TINF2Q9BSI4 LINC01978-202ENST00000574526 1540 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
TINF2Q9BSI4 ZNF286A-204ENST00000464847 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
TINF2Q9BSI4 WDR45-202ENST00000356463 1688 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
TINF2Q9BSI4 FADS2-210ENST00000522056 1689 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
TINF2Q9BSI4 YY1-201ENST00000262238 6697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
TINF2Q9BSI4 RABL6-201ENST00000311502 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
TINF2Q9BSI4 NMD3-202ENST00000460469 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
TINF2Q9BSI4 PIKFYVE-204ENST00000407449 1898 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
TINF2Q9BSI4 LINC00847-201ENST00000501855 1871 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
TINF2Q9BSI4 PSMD13-212ENST00000532097 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
TINF2Q9BSI4 SLC22A11-203ENST00000377585 2124 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
TINF2Q9BSI4 TRPC6-202ENST00000348423 2448 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
TINF2Q9BSI4 ZSWIM8-213ENST00000603114 5919 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
TINF2Q9BSI4 ZNF711-201ENST00000276123 2887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
TINF2Q9BSI4 CASKIN2-201ENST00000321617 5015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
TINF2Q9BSI4 GYPC-201ENST00000259254 1246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
TINF2Q9BSI4 CRABP1-201ENST00000299529 772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
TINF2Q9BSI4 EIF4EBP3-201ENST00000310331 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
TINF2Q9BSI4 KLK11-201ENST00000319720 1198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
TINF2Q9BSI4 ZNRD1-201ENST00000332435 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
TINF2Q9BSI4 AC104306.2-201ENST00000451877 341 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
TINF2Q9BSI4 BTNL8-205ENST00000505126 1294 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
TINF2Q9BSI4 AC104596.1-201ENST00000507826 579 ntTSL 4 BASIC17.6■□□□□ 0.41
TINF2Q9BSI4 SELENOW-201ENST00000509570 881 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
TINF2Q9BSI4 RNA5SP486-201ENST00000515961 83 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
TINF2Q9BSI4 HBS1L-208ENST00000525067 582 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
TINF2Q9BSI4 AC084859.1-201ENST00000533002 670 ntTSL 4 BASIC17.6■□□□□ 0.41
TINF2Q9BSI4 AP006621.2-201ENST00000533938 284 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
TINF2Q9BSI4 AL133523.1-201ENST00000554537 331 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
TINF2Q9BSI4 HNRNPA1P48-202ENST00000565308 961 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
TINF2Q9BSI4 MIR4313-201ENST00000580760 101 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
TINF2Q9BSI4 KLK3-211ENST00000597483 810 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
TINF2Q9BSI4 PRKN-211ENST00000615065 261 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
TINF2Q9BSI4 SNHG20-204ENST00000566583 1338 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
TINF2Q9BSI4 SULT2B1-202ENST00000323090 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
TINF2Q9BSI4 PARVB-203ENST00000404989 1591 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.5 ms