Protein–RNA interactions for Protein: Q96JQ2

CLMN, Calmin, humanhuman

Predictions only

Length 1,002 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLMNQ96JQ2 Z98749.3-201ENST00000400206 1770 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CLMNQ96JQ2 GPBAR1-204ENST00000522678 2003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CLMNQ96JQ2 BRI3BP-201ENST00000341446 6648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CLMNQ96JQ2 CYP2R1-207ENST00000532378 1746 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CLMNQ96JQ2 CENPT-235ENST00000626059 1737 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CLMNQ96JQ2 WHAMMP3-203ENST00000621139 4494 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CLMNQ96JQ2 MOCS1-206ENST00000425303 1920 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CLMNQ96JQ2 CACNA2D2-201ENST00000266039 5476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CLMNQ96JQ2 PRPF19-201ENST00000227524 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CLMNQ96JQ2 SPAST-202ENST00000345662 5116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CLMNQ96JQ2 METTL21A-203ENST00000411432 4805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CLMNQ96JQ2 LGMN-202ENST00000393218 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CLMNQ96JQ2 MEF2A-204ENST00000557785 2854 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CLMNQ96JQ2 BRSK2-204ENST00000526678 2091 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CLMNQ96JQ2 MB-205ENST00000406324 582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CLMNQ96JQ2 EPDR1-203ENST00000425345 947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CLMNQ96JQ2 RNA5SP486-201ENST00000515961 83 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
CLMNQ96JQ2 HIRIP3-204ENST00000564026 988 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CLMNQ96JQ2 AC110285.1-205ENST00000572301 559 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CLMNQ96JQ2 AC008805.2-201ENST00000590069 435 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CLMNQ96JQ2 AC020914.3-201ENST00000594712 304 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
CLMNQ96JQ2 HIST2H2AA4-201ENST00000607355 564 ntAPPRIS P1 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CLMNQ96JQ2 AL445288.1-201ENST00000610846 654 ntTSL 4 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CLMNQ96JQ2 AC132938.4-201ENST00000623835 848 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
CLMNQ96JQ2 AC015818.8-201ENST00000587907 1519 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
CLMNQ96JQ2 PARVG-206ENST00000444313 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CLMNQ96JQ2 TRPV4-207ENST00000541794 2475 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CLMNQ96JQ2 VKORC1L1-201ENST00000360768 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CLMNQ96JQ2 ENPP1-201ENST00000360971 7442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CLMNQ96JQ2 STX2-201ENST00000261653 3331 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CLMNQ96JQ2 RABL6-203ENST00000371663 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CLMNQ96JQ2 PYGL-201ENST00000216392 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CLMNQ96JQ2 EML3-201ENST00000278845 3017 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CLMNQ96JQ2 TMEM183A-201ENST00000367242 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CLMNQ96JQ2 SLC29A1-208ENST00000393844 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CLMNQ96JQ2 RNF169-201ENST00000299563 7823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CLMNQ96JQ2 PCDHA8-202ENST00000531613 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CLMNQ96JQ2 CTNNAL1-201ENST00000325551 2490 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CLMNQ96JQ2 POLR3E-202ENST00000359210 2469 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CLMNQ96JQ2 AP001372.2-201ENST00000526036 2493 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CLMNQ96JQ2 TCEA1-208ENST00000521604 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CLMNQ96JQ2 KRT8P35-201ENST00000483942 1338 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
CLMNQ96JQ2 PCK2-205ENST00000558096 2433 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CLMNQ96JQ2 ARHGEF28-214ENST00000545377 6351 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CLMNQ96JQ2 HSFX1-201ENST00000370416 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CLMNQ96JQ2 MOG-215ENST00000376888 1529 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CLMNQ96JQ2 ELP5-202ENST00000356683 2197 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CLMNQ96JQ2 USP7-201ENST00000344836 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CLMNQ96JQ2 CLIC1-206ENST00000375779 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CLMNQ96JQ2 AL662890.1-201ENST00000396818 632 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
CLMNQ96JQ2 GGCT-203ENST00000409144 836 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CLMNQ96JQ2 BANF1-202ENST00000445560 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CLMNQ96JQ2 GAPDHP40-201ENST00000505218 1006 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
CLMNQ96JQ2 KRT18P25-201ENST00000508931 1278 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
CLMNQ96JQ2 AC012640.1-201ENST00000509915 688 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CLMNQ96JQ2 AC226118.1-201ENST00000515213 2146 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CLMNQ96JQ2 GGCT-201ENST00000005374 1032 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CLMNQ96JQ2 ANAPC15-214ENST00000543587 883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CLMNQ96JQ2 CHMP4BP1-201ENST00000556017 588 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
CLMNQ96JQ2 TRAPPC2L-206ENST00000564365 1060 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CLMNQ96JQ2 CYBA-208ENST00000567174 1085 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CLMNQ96JQ2 AL451050.2-201ENST00000606967 682 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
CLMNQ96JQ2 ETV2-208ENST00000621247 941 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CLMNQ96JQ2 AC006453.4-201ENST00000636949 1252 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
CLMNQ96JQ2 GALNT11-205ENST00000430044 2727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CLMNQ96JQ2 VWA1-203ENST00000476993 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CLMNQ96JQ2 ZNF711-201ENST00000276123 2887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CLMNQ96JQ2 JADE3-204ENST00000614628 4934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CLMNQ96JQ2 ACTR2-205ENST00000542850 1429 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CLMNQ96JQ2 C12orf66-204ENST00000544871 2441 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CLMNQ96JQ2 CDK16-223ENST00000622098 2968 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CLMNQ96JQ2 MAP3K8-207ENST00000542547 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CLMNQ96JQ2 PCDHGC5-202ENST00000610789 2763 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CLMNQ96JQ2 CERNA1-202ENST00000560518 1972 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CLMNQ96JQ2 NOTCH3-201ENST00000263388 8666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CLMNQ96JQ2 MAP4K2-202ENST00000377350 2931 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CLMNQ96JQ2 LGI4-202ENST00000392225 2891 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CLMNQ96JQ2 FBXO8-202ENST00000503293 1546 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CLMNQ96JQ2 RDM1-224ENST00000619262 1535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CLMNQ96JQ2 AIFM1-201ENST00000287295 2260 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CLMNQ96JQ2 PRDM5-212ENST00000515109 2259 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CLMNQ96JQ2 RGR-201ENST00000358110 1349 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CLMNQ96JQ2 RNPS1-202ENST00000320225 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CLMNQ96JQ2 AC099398.1-201ENST00000567919 2776 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
CLMNQ96JQ2 DMAC2-204ENST00000438807 1454 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CLMNQ96JQ2 LINC02370-201ENST00000428272 2009 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CLMNQ96JQ2 EWSR1-203ENST00000332050 2552 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CLMNQ96JQ2 ITGA8-201ENST00000378076 6755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CLMNQ96JQ2 CCNI2-201ENST00000378731 2355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CLMNQ96JQ2 P2RY6-202ENST00000393590 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CLMNQ96JQ2 PNLDC1-202ENST00000392167 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CLMNQ96JQ2 RAB41-201ENST00000276066 1071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CLMNQ96JQ2 TSPO-201ENST00000329563 955 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CLMNQ96JQ2 AC091046.1-201ENST00000331871 207 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
CLMNQ96JQ2 RAB41-202ENST00000374473 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CLMNQ96JQ2 OSM-202ENST00000403389 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CLMNQ96JQ2 FXNP2-201ENST00000411625 547 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
CLMNQ96JQ2 AC012506.3-201ENST00000415245 892 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CLMNQ96JQ2 AL451065.1-201ENST00000428958 238 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CLMNQ96JQ2 AC106786.1-201ENST00000442777 792 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 71.8 ms