Protein–RNA interactions for Protein: Q96C24

SYTL4, Synaptotagmin-like protein 4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 671 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYTL4Q96C24 SLC47A2-202ENST00000350657 2285 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SYTL4Q96C24 PCTP-201ENST00000268896 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SYTL4Q96C24 FUT3-202ENST00000458379 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SYTL4Q96C24 ECHDC2-203ENST00000371522 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SYTL4Q96C24 NDUFV1-202ENST00000415352 1512 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
SYTL4Q96C24 RPS3-201ENST00000278572 907 ntTSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
SYTL4Q96C24 BOLA3-201ENST00000295326 444 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SYTL4Q96C24 CTNNBIP1-202ENST00000377258 852 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
SYTL4Q96C24 AC017104.1-201ENST00000415129 720 ntTSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
SYTL4Q96C24 KRT18P43-201ENST00000469825 1281 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
SYTL4Q96C24 HNRNPUP1-201ENST00000554987 333 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
SYTL4Q96C24 FOS-206ENST00000555347 1280 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
SYTL4Q96C24 AC009133.1-202ENST00000563806 494 ntTSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
SYTL4Q96C24 ANAPC11-215ENST00000578550 599 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
SYTL4Q96C24 KSR1-207ENST00000578981 748 ntTSL 4 BASIC20.45■□□□□ 0.86
SYTL4Q96C24 YIF1B-216ENST00000592694 1181 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SYTL4Q96C24 AC107373.2-201ENST00000607735 490 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
SYTL4Q96C24 LINC01515-215ENST00000608678 854 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
SYTL4Q96C24 SPATA21-206ENST00000612240 603 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
SYTL4Q96C24 AL008638.5-201ENST00000623814 1298 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
SYTL4Q96C24 IGSF8-201ENST00000314485 2343 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SYTL4Q96C24 STOX1-201ENST00000298596 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SYTL4Q96C24 ARHGAP27-214ENST00000532891 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
SYTL4Q96C24 ARHGAP22-205ENST00000417912 2352 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SYTL4Q96C24 GRN-222ENST00000639447 1314 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
SYTL4Q96C24 EPHX2-202ENST00000517536 1600 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
SYTL4Q96C24 ACOXL-201ENST00000340561 2188 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SYTL4Q96C24 U2AF2-201ENST00000308924 1698 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SYTL4Q96C24 RTN4IP1-201ENST00000369063 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SYTL4Q96C24 MAGEA2-202ENST00000598543 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SYTL4Q96C24 DRD5P1-201ENST00000456605 1438 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
SYTL4Q96C24 QPCTL-201ENST00000012049 2310 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
SYTL4Q96C24 ABHD18-206ENST00000611882 1493 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SYTL4Q96C24 POMT1-208ENST00000423007 3320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SYTL4Q96C24 SLC25A45-208ENST00000527174 2138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
SYTL4Q96C24 MIER1-206ENST00000371016 1802 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SYTL4Q96C24 WDR70-202ENST00000504564 1526 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SYTL4Q96C24 LRRC14-205ENST00000529022 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SYTL4Q96C24 CGB5-201ENST00000301408 841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SYTL4Q96C24 PFDN5-202ENST00000334478 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SYTL4Q96C24 TNFAIP8L2-201ENST00000368910 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SYTL4Q96C24 C9orf24-203ENST00000379126 496 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SYTL4Q96C24 AL049698.1-202ENST00000441716 757 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
SYTL4Q96C24 SPATA24-205ENST00000509959 641 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
SYTL4Q96C24 AC026410.3-201ENST00000514280 936 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
SYTL4Q96C24 ZSCAN32-210ENST00000573830 668 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
SYTL4Q96C24 AC000095.1-201ENST00000603208 874 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
SYTL4Q96C24 ZNFX1-AS1_1.1-201ENST00000615787 198 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
SYTL4Q96C24 AC233723.1-201ENST00000635921 386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
SYTL4Q96C24 AC244452.3-201ENST00000636814 210 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
SYTL4Q96C24 TNIP1-211ENST00000521591 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SYTL4Q96C24 LINC00595-204ENST00000434974 2692 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
SYTL4Q96C24 KRT35-202ENST00000393989 1670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
SYTL4Q96C24 IRAK1-204ENST00000393687 2049 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SYTL4Q96C24 CRAMP1-202ENST00000397412 7772 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
SYTL4Q96C24 STK4-AS1-201ENST00000434401 2065 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
SYTL4Q96C24 PDGFB-201ENST00000331163 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SYTL4Q96C24 ITGA6-201ENST00000264107 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SYTL4Q96C24 SNX31-201ENST00000311812 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
SYTL4Q96C24 FAM214B-206ENST00000603301 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SYTL4Q96C24 RAPSN-202ENST00000352508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SYTL4Q96C24 SPDEF-201ENST00000374037 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SYTL4Q96C24 ASH1L-207ENST00000548830 1862 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
SYTL4Q96C24 UQCC3-202ENST00000531323 2288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
SYTL4Q96C24 MGAT1-203ENST00000393340 3077 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
SYTL4Q96C24 C9orf62-201ENST00000623103 1924 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SYTL4Q96C24 RSPO1-204ENST00000615459 2331 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
SYTL4Q96C24 LGI4-202ENST00000392225 2891 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
SYTL4Q96C24 CROCC2-201ENST00000443866 5382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
SYTL4Q96C24 TPM1-201ENST00000267996 1670 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SYTL4Q96C24 AC006001.1-201ENST00000325130 474 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
SYTL4Q96C24 EMC3-AS1-202ENST00000366264 559 ntTSL 4 BASIC20.43■□□□□ 0.86
SYTL4Q96C24 DUSP23-202ENST00000368108 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SYTL4Q96C24 TEX30-203ENST00000376022 828 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
SYTL4Q96C24 TMEM52-203ENST00000378602 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SYTL4Q96C24 ITPA-201ENST00000380113 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SYTL4Q96C24 KNCN-202ENST00000396314 608 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC20.43■□□□□ 0.86
SYTL4Q96C24 ITPA-202ENST00000399838 897 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SYTL4Q96C24 AC136604.1-201ENST00000418535 575 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
SYTL4Q96C24 DUSP13-205ENST00000464872 684 ntTSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
SYTL4Q96C24 LCN10-206ENST00000527229 615 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SYTL4Q96C24 GABARAPL1-217ENST00000545887 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
SYTL4Q96C24 AC007333.1-201ENST00000568286 630 ntTSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
SYTL4Q96C24 AC106872.11-201ENST00000605838 421 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
SYTL4Q96C24 AC005695.3-201ENST00000614522 232 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
SYTL4Q96C24 AC243829.4-204ENST00000616926 1115 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
SYTL4Q96C24 ARID1B-222ENST00000637003 1290 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
SYTL4Q96C24 JMJD4-201ENST00000366758 2595 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SYTL4Q96C24 FAM49B-223ENST00000522746 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SYTL4Q96C24 LSS-205ENST00000457828 4390 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SYTL4Q96C24 TSNARE1-201ENST00000307180 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
SYTL4Q96C24 POTEE-204ENST00000613282 1926 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
SYTL4Q96C24 POTEI-202ENST00000615053 1926 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
SYTL4Q96C24 ANKRD23-202ENST00000331001 2455 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
SYTL4Q96C24 MAP3K3-202ENST00000361733 3529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SYTL4Q96C24 COL9A1-201ENST00000320755 3059 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
SYTL4Q96C24 TBL2-205ENST00000432538 1573 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
SYTL4Q96C24 LINC01118-203ENST00000479311 1588 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
SYTL4Q96C24 PAPOLB-201ENST00000404991 4262 ntAPPRIS P1 BASIC20.42■□□□□ 0.86
SYTL4Q96C24 SEPHS1-201ENST00000327347 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.3 ms