Protein–RNA interactions for Protein: Q969T4

UBE2E3, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 E3, humanhuman

Predictions only

Length 207 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE2E3Q969T4 AQP12B-206ENST00000621682 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
UBE2E3Q969T4 C17orf74-201ENST00000333870 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
UBE2E3Q969T4 NKX3-1-201ENST00000380871 3271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
UBE2E3Q969T4 LCOR-202ENST00000356016 4834 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
UBE2E3Q969T4 SEC63-201ENST00000369002 6411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
UBE2E3Q969T4 ARFGAP1-210ENST00000519273 3176 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
UBE2E3Q969T4 ARAP2-201ENST00000303965 7514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
UBE2E3Q969T4 FGD4-212ENST00000534526 2977 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
UBE2E3Q969T4 CAMKV-217ENST00000620470 1485 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
UBE2E3Q969T4 ARVCF-201ENST00000263207 4041 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
UBE2E3Q969T4 DCAF17-202ENST00000375255 5828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
UBE2E3Q969T4 MEX3C-204ENST00000616921 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
UBE2E3Q969T4 DNAJC2-203ENST00000379263 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
UBE2E3Q969T4 WARS-232ENST00000556645 2508 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
UBE2E3Q969T4 RFX1-201ENST00000254325 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
UBE2E3Q969T4 PMS1-213ENST00000441310 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
UBE2E3Q969T4 ADAM15-208ENST00000447332 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
UBE2E3Q969T4 AC018892.3-201ENST00000623986 2499 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
UBE2E3Q969T4 KCNH3-201ENST00000257981 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
UBE2E3Q969T4 TFPI2-201ENST00000222543 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
UBE2E3Q969T4 STK4-AS1-201ENST00000434401 2065 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
UBE2E3Q969T4 CPEB2-209ENST00000538197 6878 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
UBE2E3Q969T4 IL11RA-215ENST00000602473 1388 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
UBE2E3Q969T4 PLXNB2-214ENST00000614805 1387 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
UBE2E3Q969T4 MRPL49-201ENST00000279242 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
UBE2E3Q969T4 ZNF382-202ENST00000423582 2657 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
UBE2E3Q969T4 TPD52L2-204ENST00000351424 2302 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
UBE2E3Q969T4 SNRK-204ENST00000454177 2961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
UBE2E3Q969T4 DNASE2-201ENST00000222219 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
UBE2E3Q969T4 TMUB2-209ENST00000587989 1969 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
UBE2E3Q969T4 PCDHGA12-202ENST00000613314 2634 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
UBE2E3Q969T4 PDXK-202ENST00000327574 2583 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
UBE2E3Q969T4 MYEF2-215ENST00000610570 2591 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
UBE2E3Q969T4 ZSWIM8-221ENST00000604729 6075 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
UBE2E3Q969T4 SPAG7-201ENST00000206020 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
UBE2E3Q969T4 POLR1C-201ENST00000304004 1280 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
UBE2E3Q969T4 PAM16-201ENST00000318059 587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
UBE2E3Q969T4 NUDT4P1-201ENST00000322209 1206 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
UBE2E3Q969T4 FAM24B-201ENST00000368896 704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
UBE2E3Q969T4 IZUMO4-201ENST00000395296 869 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
UBE2E3Q969T4 RNF183-202ENST00000416588 849 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
UBE2E3Q969T4 AC136604.1-201ENST00000418535 575 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
UBE2E3Q969T4 PLAC9P1-202ENST00000433290 400 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
UBE2E3Q969T4 MUSTN1-201ENST00000446157 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
UBE2E3Q969T4 NDUFAF5-203ENST00000463598 991 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
UBE2E3Q969T4 AC008406.2-201ENST00000507058 532 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
UBE2E3Q969T4 FAM172A-207ENST00000509739 1031 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
UBE2E3Q969T4 AL079307.3-201ENST00000556114 283 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
UBE2E3Q969T4 MIR6069-201ENST00000620069 79 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
UBE2E3Q969T4 ZBTB17-216ENST00000537142 2511 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
UBE2E3Q969T4 DUSP14-204ENST00000613659 1559 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
UBE2E3Q969T4 AL121845.3-201ENST00000490623 3119 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
UBE2E3Q969T4 ACSS1-201ENST00000323482 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
UBE2E3Q969T4 IMPDH1P4-201ENST00000445028 1534 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
UBE2E3Q969T4 RAI2-206ENST00000545871 2421 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.26■□□□□ 0.03
UBE2E3Q969T4 TIPRL-202ENST00000367833 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
UBE2E3Q969T4 C9orf78-201ENST00000372447 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
UBE2E3Q969T4 RECQL4-209ENST00000617875 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
UBE2E3Q969T4 C5orf24-204ENST00000504727 2923 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
UBE2E3Q969T4 PDE1C-201ENST00000321453 2898 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
UBE2E3Q969T4 AC046158.3-201ENST00000624947 2558 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
UBE2E3Q969T4 NIPA2-204ENST00000398014 3130 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
UBE2E3Q969T4 SMARCD1-202ENST00000394963 3658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
UBE2E3Q969T4 GLS2-217ENST00000623608 2518 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
UBE2E3Q969T4 CCDC144A-202ENST00000340621 2214 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
UBE2E3Q969T4 AC132872.4-202ENST00000622924 2756 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
UBE2E3Q969T4 AL162727.3-201ENST00000635661 2787 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
UBE2E3Q969T4 WDR81-204ENST00000419248 3315 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
UBE2E3Q969T4 CCHCR1-202ENST00000396263 2490 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
UBE2E3Q969T4 GLMP-213ENST00000612353 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
UBE2E3Q969T4 GLMP-215ENST00000622703 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
UBE2E3Q969T4 CDKN2AIP-203ENST00000504169 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
UBE2E3Q969T4 DNAAF2-201ENST00000298292 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
UBE2E3Q969T4 SYT13-201ENST00000020926 5144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
UBE2E3Q969T4 RPN1-207ENST00000497289 2137 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
UBE2E3Q969T4 BANK1-207ENST00000508653 2115 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
UBE2E3Q969T4 RCN2-203ENST00000394885 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
UBE2E3Q969T4 PIGP-207ENST00000464265 3437 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
UBE2E3Q969T4 CPSF1-213ENST00000620219 4462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
UBE2E3Q969T4 PCDHB6-202ENST00000622991 2608 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
UBE2E3Q969T4 FBLN1-202ENST00000327858 2896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
UBE2E3Q969T4 TMPO-AS1-202ENST00000548760 3357 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
UBE2E3Q969T4 FAM109A-203ENST00000547838 2846 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC15.25■□□□□ 0.03
UBE2E3Q969T4 KLK8-202ENST00000320838 456 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
UBE2E3Q969T4 LCE5A-201ENST00000334269 819 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
UBE2E3Q969T4 C1QA-201ENST00000374642 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
UBE2E3Q969T4 C6orf52-202ENST00000379586 430 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
UBE2E3Q969T4 PRORY-201ENST00000382764 878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
UBE2E3Q969T4 AZGP1P1-201ENST00000411909 902 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
UBE2E3Q969T4 AL121753.1-201ENST00000444717 529 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
UBE2E3Q969T4 TPT1-AS1-219ENST00000523506 574 ntTSL 4 BASIC15.25■□□□□ 0.03
UBE2E3Q969T4 CYB561D1-209ENST00000533024 913 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
UBE2E3Q969T4 OBP2A-206ENST00000539850 914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
UBE2E3Q969T4 AC069503.2-201ENST00000546333 576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
UBE2E3Q969T4 HNRNPUP1-201ENST00000554987 333 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
UBE2E3Q969T4 UBE2Q2L-201ENST00000558195 498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
UBE2E3Q969T4 AC004449.1-201ENST00000564240 433 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
UBE2E3Q969T4 BORCS8-206ENST00000585679 801 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
UBE2E3Q969T4 PDCD2L-203ENST00000587065 492 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
UBE2E3Q969T4 AC026803.2-201ENST00000599784 819 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.9 ms