Protein–RNA interactions for Protein: Q8N7C7

RNF148, RING finger protein 148, humanhuman

Predictions only

Length 305 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF148Q8N7C7 AC090164.4-201ENST00000632451 313 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
RNF148Q8N7C7 PTPN11-207ENST00000639857 801 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
RNF148Q8N7C7 AC009961.1-203ENST00000607836 2520 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
RNF148Q8N7C7 AC018892.3-201ENST00000623986 2499 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
RNF148Q8N7C7 TRIM45-201ENST00000256649 3515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
RNF148Q8N7C7 DIXDC1-201ENST00000440460 5897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
RNF148Q8N7C7 ARHGEF28-202ENST00000296799 4424 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
RNF148Q8N7C7 STIP1-201ENST00000305218 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
RNF148Q8N7C7 GORASP2-201ENST00000234160 3173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
RNF148Q8N7C7 SFXN3-202ENST00000393459 3098 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
RNF148Q8N7C7 TNS2-201ENST00000314250 5010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
RNF148Q8N7C7 RNFT2-203ENST00000392549 2896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
RNF148Q8N7C7 NRAS-201ENST00000369535 4449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
RNF148Q8N7C7 MTRF1L-202ENST00000367231 3539 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
RNF148Q8N7C7 DIP2A-201ENST00000400274 7023 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
RNF148Q8N7C7 MBOAT2-201ENST00000305997 7751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
RNF148Q8N7C7 PRDM4-201ENST00000228437 4210 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
RNF148Q8N7C7 GABRD-218ENST00000640949 1684 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
RNF148Q8N7C7 LTBP3-221ENST00000532932 3327 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
RNF148Q8N7C7 FGD5P1-202ENST00000614866 2498 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
RNF148Q8N7C7 AC112229.3-201ENST00000603767 3202 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
RNF148Q8N7C7 AC013271.1-201ENST00000640669 3202 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
RNF148Q8N7C7 LINC00839-202ENST00000429940 2253 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
RNF148Q8N7C7 INTS4P1-202ENST00000587624 2985 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
RNF148Q8N7C7 GCAT-201ENST00000248924 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
RNF148Q8N7C7 SLC26A1-201ENST00000361661 3660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
RNF148Q8N7C7 IMPDH1-201ENST00000338791 2881 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
RNF148Q8N7C7 IMPDH1-217ENST00000626419 2862 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
RNF148Q8N7C7 AC015656.1-201ENST00000624209 3578 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
RNF148Q8N7C7 GAS2L2-203ENST00000618498 2655 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
RNF148Q8N7C7 ISCU-205ENST00000535729 1330 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
RNF148Q8N7C7 TRIM36-203ENST00000379618 693 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
RNF148Q8N7C7 GYG2P1-204ENST00000382966 639 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
RNF148Q8N7C7 RNU1-129P-201ENST00000384064 167 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
RNF148Q8N7C7 EEF1D-202ENST00000395119 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
RNF148Q8N7C7 SMAGP-202ENST00000398453 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
RNF148Q8N7C7 CRELD2-202ENST00000403427 1242 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
RNF148Q8N7C7 LSM5-204ENST00000409909 740 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
RNF148Q8N7C7 AC093724.1-201ENST00000448659 1027 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
RNF148Q8N7C7 FGFR3P6-201ENST00000457012 610 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
RNF148Q8N7C7 REXO2-206ENST00000539275 710 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
RNF148Q8N7C7 U1.21-201ENST00000580816 167 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
RNF148Q8N7C7 AC008992.1-201ENST00000591132 446 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
RNF148Q8N7C7 AC025062.2-201ENST00000605477 670 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
RNF148Q8N7C7 AC021097.1-201ENST00000607902 574 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
RNF148Q8N7C7 ZNF445-205ENST00000617032 1291 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
RNF148Q8N7C7 LARGE1-201ENST00000354992 4409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
RNF148Q8N7C7 JAKMIP1-205ENST00000410077 1835 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
RNF148Q8N7C7 KIF26B-202ENST00000407071 7287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
RNF148Q8N7C7 PRRT2-207ENST00000572820 2403 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
RNF148Q8N7C7 C15orf62-201ENST00000344320 2370 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
RNF148Q8N7C7 C4A-259ENST00000498271 5269 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
RNF148Q8N7C7 FAM84A-201ENST00000295092 6355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
RNF148Q8N7C7 IGDCC3-201ENST00000327987 4479 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
RNF148Q8N7C7 TMEM117-201ENST00000266534 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
RNF148Q8N7C7 UNC5A-201ENST00000329542 3812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
RNF148Q8N7C7 TANK-202ENST00000392749 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
RNF148Q8N7C7 AC073082.1-201ENST00000602369 2103 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
RNF148Q8N7C7 KIAA0391-202ENST00000321130 1589 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
RNF148Q8N7C7 GPR17-201ENST00000272644 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
RNF148Q8N7C7 BRSK2-204ENST00000526678 2091 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
RNF148Q8N7C7 VWCE-202ENST00000335613 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
RNF148Q8N7C7 DCUN1D3-201ENST00000324344 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
RNF148Q8N7C7 WIZ-207ENST00000599910 4609 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
RNF148Q8N7C7 CCDC189-204ENST00000541260 1531 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
RNF148Q8N7C7 AMZ1-201ENST00000312371 5516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
RNF148Q8N7C7 CCP110-201ENST00000381396 5446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
RNF148Q8N7C7 REEP4-202ENST00000334530 1476 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
RNF148Q8N7C7 CLEC16A-203ENST00000409790 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
RNF148Q8N7C7 KLC4-204ENST00000453940 1945 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
RNF148Q8N7C7 BTN1A1-201ENST00000244513 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
RNF148Q8N7C7 FEM1B-201ENST00000306917 7122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
RNF148Q8N7C7 GLMP-214ENST00000614643 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
RNF148Q8N7C7 RASAL2-AS1-202ENST00000421505 2329 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
RNF148Q8N7C7 LRIG3-201ENST00000320743 4070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
RNF148Q8N7C7 TGOLN2-205ENST00000409232 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
RNF148Q8N7C7 ST3GAL3-209ENST00000361400 2195 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
RNF148Q8N7C7 BBS2-201ENST00000245157 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
RNF148Q8N7C7 GGT1-204ENST00000401885 968 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
RNF148Q8N7C7 POM121L12-201ENST00000408890 1283 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.04
RNF148Q8N7C7 TMEM210-201ENST00000413619 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
RNF148Q8N7C7 AL022314.1-201ENST00000414203 464 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
RNF148Q8N7C7 ARPC4-203ENST00000433034 926 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
RNF148Q8N7C7 PHGR1-201ENST00000448599 436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
RNF148Q8N7C7 AC021739.5-201ENST00000558637 494 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
RNF148Q8N7C7 AC027682.5-201ENST00000567122 530 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
RNF148Q8N7C7 PAM16-208ENST00000573553 722 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
RNF148Q8N7C7 DBP-204ENST00000599385 709 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
RNF148Q8N7C7 FAM25C-201ENST00000617224 319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
RNF148Q8N7C7 DHRS4L2-211ENST00000621761 1049 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
RNF148Q8N7C7 LINC01666-201ENST00000623794 845 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
RNF148Q8N7C7 TK2-221ENST00000620035 5060 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
RNF148Q8N7C7 LINC01010-201ENST00000431422 2069 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
RNF148Q8N7C7 TMPRSS6-202ENST00000381792 3260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
RNF148Q8N7C7 CD14-202ENST00000401743 1648 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.03
RNF148Q8N7C7 PPFIBP1-216ENST00000545334 2805 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
RNF148Q8N7C7 SLC26A11-203ENST00000546047 2807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
RNF148Q8N7C7 USP36-201ENST00000312010 5234 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
RNF148Q8N7C7 KMT2E-201ENST00000257745 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
RNF148Q8N7C7 DUOXA1-210ENST00000559014 1965 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64.6 ms