Protein–RNA interactions for Protein: Q6R2W3

ZBED9, SCAN domain-containing protein 3, humanhuman

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Length 1,325 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZBED9Q6R2W3 MED15-202ENST00000292733 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
ZBED9Q6R2W3 ATP6V0D1-201ENST00000290949 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
ZBED9Q6R2W3 PRRT2-207ENST00000572820 2403 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
ZBED9Q6R2W3 ATP2A2-204ENST00000539276 4094 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
ZBED9Q6R2W3 TRMT10C-201ENST00000309922 1819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
ZBED9Q6R2W3 VAV2-201ENST00000371850 4837 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
ZBED9Q6R2W3 CIAPIN1-201ENST00000394391 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
ZBED9Q6R2W3 ALG9-201ENST00000398006 2345 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
ZBED9Q6R2W3 CDH7-203ENST00000536984 3766 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
ZBED9Q6R2W3 TYROBP-201ENST00000262629 568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
ZBED9Q6R2W3 LRRC28-202ENST00000331450 752 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
ZBED9Q6R2W3 HRAS-202ENST00000397594 1099 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
ZBED9Q6R2W3 AP000347.1-202ENST00000435868 847 ntBASIC20.89■□□□□ 0.93
ZBED9Q6R2W3 AC069335.1-201ENST00000489972 472 ntBASIC20.89■□□□□ 0.93
ZBED9Q6R2W3 BANF1P1-201ENST00000553684 263 ntBASIC20.89■□□□□ 0.93
ZBED9Q6R2W3 TYROBP-205ENST00000585901 620 ntTSL 3 BASIC20.89■□□□□ 0.93
ZBED9Q6R2W3 AC005330.1-201ENST00000590086 1238 ntTSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
ZBED9Q6R2W3 AL662799.1-201ENST00000630418 496 ntTSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
ZBED9Q6R2W3 MCHR2-201ENST00000281806 2368 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
ZBED9Q6R2W3 GPKOW-201ENST00000156109 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
ZBED9Q6R2W3 KCTD1-203ENST00000417602 1705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
ZBED9Q6R2W3 GLMP-213ENST00000612353 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
ZBED9Q6R2W3 GLMP-215ENST00000622703 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
ZBED9Q6R2W3 TMEM115-201ENST00000266025 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
ZBED9Q6R2W3 KREMEN1-203ENST00000407188 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
ZBED9Q6R2W3 SIX5-204ENST00000622857 1401 ntTSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
ZBED9Q6R2W3 RPTOR-203ENST00000570891 2286 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
ZBED9Q6R2W3 TAF6-201ENST00000344095 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
ZBED9Q6R2W3 ARVCF-202ENST00000401994 2700 ntTSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
ZBED9Q6R2W3 SAFB-205ENST00000588852 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
ZBED9Q6R2W3 MCM7-202ENST00000343023 1968 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
ZBED9Q6R2W3 MAPKAP1-201ENST00000265960 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
ZBED9Q6R2W3 PRKACG-201ENST00000377276 1585 ntAPPRIS P1 BASIC20.88■□□□□ 0.93
ZBED9Q6R2W3 MARCH2-208ENST00000602117 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
ZBED9Q6R2W3 DZIP1-204ENST00000376829 3738 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
ZBED9Q6R2W3 TMEM147-201ENST00000222284 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
ZBED9Q6R2W3 PDLIM7-201ENST00000355572 977 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
ZBED9Q6R2W3 IGHV3-15-201ENST00000390603 437 ntAPPRIS P1 BASIC20.88■□□□□ 0.93
ZBED9Q6R2W3 GUK1-210ENST00000391865 990 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
ZBED9Q6R2W3 GRM5-203ENST00000393294 1268 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
ZBED9Q6R2W3 LINC00029-202ENST00000414668 1117 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
ZBED9Q6R2W3 AL034550.1-201ENST00000442179 986 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
ZBED9Q6R2W3 SLC25A39P2-201ENST00000537614 270 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
ZBED9Q6R2W3 MAX-210ENST00000555419 765 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
ZBED9Q6R2W3 AC009053.3-201ENST00000567148 574 ntTSL 4 BASIC20.88■□□□□ 0.93
ZBED9Q6R2W3 KDM6A-213ENST00000611820 5924 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
ZBED9Q6R2W3 CORO1A-208ENST00000565497 1348 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
ZBED9Q6R2W3 LRRC6-213ENST00000620350 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
ZBED9Q6R2W3 FXYD6-201ENST00000260282 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
ZBED9Q6R2W3 PPP4R3A-205ENST00000554684 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
ZBED9Q6R2W3 POM121-203ENST00000434423 3750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
ZBED9Q6R2W3 RAPSN-202ENST00000352508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
ZBED9Q6R2W3 FAM131A-203ENST00000383847 1483 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
ZBED9Q6R2W3 SLC35A3-221ENST00000640600 3341 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
ZBED9Q6R2W3 KANK2-207ENST00000589894 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
ZBED9Q6R2W3 PDE6G-204ENST00000573076 1505 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
ZBED9Q6R2W3 CD40-207ENST00000620709 1522 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
ZBED9Q6R2W3 TGFB1-201ENST00000221930 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
ZBED9Q6R2W3 TMEM92-201ENST00000300433 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
ZBED9Q6R2W3 ZNF18-201ENST00000322748 2767 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
ZBED9Q6R2W3 SCRN1-205ENST00000425819 1552 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
ZBED9Q6R2W3 INPP5K-201ENST00000320345 2880 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
ZBED9Q6R2W3 ZNF557-201ENST00000252840 2268 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
ZBED9Q6R2W3 PYCR2-201ENST00000343818 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
ZBED9Q6R2W3 ANKMY1-203ENST00000373318 2449 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
ZBED9Q6R2W3 PCK2-203ENST00000545054 2505 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
ZBED9Q6R2W3 DCBLD1-202ENST00000338728 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
ZBED9Q6R2W3 AC232323.1-201ENST00000540724 2099 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
ZBED9Q6R2W3 REXO1L5P-201ENST00000622260 2098 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
ZBED9Q6R2W3 PXN-201ENST00000228307 3785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
ZBED9Q6R2W3 TMEM270-201ENST00000320531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
ZBED9Q6R2W3 MAPK15-202ENST00000395107 834 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
ZBED9Q6R2W3 PAEP-208ENST00000479141 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
ZBED9Q6R2W3 RARRES2P9-201ENST00000565168 469 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
ZBED9Q6R2W3 LAMTOR5-208ENST00000614544 846 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
ZBED9Q6R2W3 RAI2-204ENST00000451717 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
ZBED9Q6R2W3 LLGL2-209ENST00000578363 1393 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
ZBED9Q6R2W3 MEG9-201ENST00000429368 2638 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
ZBED9Q6R2W3 ARHGAP23-221ENST00000620417 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
ZBED9Q6R2W3 C6orf120-201ENST00000332290 2667 ntAPPRIS P1 BASIC20.87■□□□□ 0.93
ZBED9Q6R2W3 COCH-203ENST00000460581 2688 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
ZBED9Q6R2W3 CENPT-235ENST00000626059 1737 ntTSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
ZBED9Q6R2W3 GIT2-202ENST00000354574 5387 ntTSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
ZBED9Q6R2W3 SLC9A2-201ENST00000233969 5410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
ZBED9Q6R2W3 ZNF385A-205ENST00000546970 2494 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
ZBED9Q6R2W3 PTPRN2-201ENST00000389413 4723 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
ZBED9Q6R2W3 AC007191.1-201ENST00000623179 2995 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
ZBED9Q6R2W3 MFSD14B-201ENST00000375344 3420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
ZBED9Q6R2W3 GPHB5-201ENST00000314140 393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
ZBED9Q6R2W3 C11orf88-201ENST00000332814 795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
ZBED9Q6R2W3 EVA1A-203ENST00000410010 696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
ZBED9Q6R2W3 AC023274.1-201ENST00000418278 595 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
ZBED9Q6R2W3 AL359915.2-201ENST00000425884 745 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
ZBED9Q6R2W3 AL807752.7-201ENST00000471521 989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
ZBED9Q6R2W3 RPL8-207ENST00000528957 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
ZBED9Q6R2W3 SUOX-214ENST00000551841 906 ntTSL 3 BASIC20.86■□□□□ 0.93
ZBED9Q6R2W3 SEC23A-206ENST00000553970 574 ntTSL 4 BASIC20.86■□□□□ 0.93
ZBED9Q6R2W3 TNNT1-211ENST00000588426 683 ntTSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
ZBED9Q6R2W3 AC120114.3-201ENST00000611923 658 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
ZBED9Q6R2W3 LINC00466-208ENST00000635218 1217 ntTSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
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