Protein–RNA interactions for Protein: Q5VT98

PRAMEF20, PRAME family member 20, humanhuman

Predictions only

Length 475 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRAMEF20Q5VT98 COMMD5-203ENST00000450361 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
PRAMEF20Q5VT98 IDH3G-203ENST00000370093 1662 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
PRAMEF20Q5VT98 PITX2-204ENST00000394595 1693 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
PRAMEF20Q5VT98 IL11RA-202ENST00000441545 1700 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
PRAMEF20Q5VT98 MFSD4A-207ENST00000536357 1841 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
PRAMEF20Q5VT98 RRBP1-208ENST00000470422 2070 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
PRAMEF20Q5VT98 SLC25A45-201ENST00000294187 2196 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
PRAMEF20Q5VT98 KCNJ12-201ENST00000331718 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
PRAMEF20Q5VT98 RASGRP2-201ENST00000354024 2310 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
PRAMEF20Q5VT98 DAGLB-204ENST00000436575 2385 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
PRAMEF20Q5VT98 PCSK4-201ENST00000300954 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
PRAMEF20Q5VT98 PRAL-201ENST00000624952 3286 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
PRAMEF20Q5VT98 EPHB4-201ENST00000358173 4329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
PRAMEF20Q5VT98 NTRK2-205ENST00000376208 8178 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
PRAMEF20Q5VT98 CPSF1-213ENST00000620219 4462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
PRAMEF20Q5VT98 IKBIP-201ENST00000299157 3189 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
PRAMEF20Q5VT98 NPNT-201ENST00000305572 3003 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
PRAMEF20Q5VT98 GALNT6-201ENST00000356317 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
PRAMEF20Q5VT98 SH3BP5-202ENST00000383791 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
PRAMEF20Q5VT98 CAAP1-201ENST00000333916 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
PRAMEF20Q5VT98 ZBTB45-202ENST00000594051 2541 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
PRAMEF20Q5VT98 LOXL3-203ENST00000409249 2431 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
PRAMEF20Q5VT98 MYEOV-203ENST00000535407 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
PRAMEF20Q5VT98 LCK-201ENST00000333070 2166 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
PRAMEF20Q5VT98 NIN-203ENST00000382041 6496 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
PRAMEF20Q5VT98 CMKLR1-206ENST00000552995 1890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
PRAMEF20Q5VT98 ISPD-202ENST00000407010 5524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
PRAMEF20Q5VT98 AHSA1-201ENST00000216479 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
PRAMEF20Q5VT98 NCAPH2-202ENST00000395698 1388 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
PRAMEF20Q5VT98 FBN1-205ENST00000560355 4109 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
PRAMEF20Q5VT98 TOM1-201ENST00000382034 1300 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
PRAMEF20Q5VT98 CMA1-201ENST00000206446 633 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
PRAMEF20Q5VT98 MRPL55-202ENST00000336300 722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
PRAMEF20Q5VT98 TSPAN4-201ENST00000346501 882 ntTSL 3 BASIC14.53□□□□□ -0.08
PRAMEF20Q5VT98 MRPL55-206ENST00000366732 722 ntTSL 3 BASIC14.53□□□□□ -0.08
PRAMEF20Q5VT98 AC104135.1-201ENST00000418001 763 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
PRAMEF20Q5VT98 AC015922.1-201ENST00000421102 1152 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
PRAMEF20Q5VT98 TARDBPP1-201ENST00000442013 1203 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
PRAMEF20Q5VT98 CRB3P1-201ENST00000449338 276 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
PRAMEF20Q5VT98 AC092910.3-201ENST00000484076 969 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
PRAMEF20Q5VT98 AC009720.1-201ENST00000511867 586 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
PRAMEF20Q5VT98 AP002008.1-201ENST00000530283 1155 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
PRAMEF20Q5VT98 TPRX2P-201ENST00000535362 881 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
PRAMEF20Q5VT98 TIMM17BP1-201ENST00000545713 516 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
PRAMEF20Q5VT98 CDK4-206ENST00000549606 558 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
PRAMEF20Q5VT98 AP3S2-204ENST00000558011 738 ntTSL 3 BASIC14.53□□□□□ -0.08
PRAMEF20Q5VT98 NUBP2-208ENST00000565987 1049 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
PRAMEF20Q5VT98 PIMREG-202ENST00000570337 891 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
PRAMEF20Q5VT98 ARL16-202ENST00000570561 768 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
PRAMEF20Q5VT98 PIMREG-203ENST00000571373 1002 ntTSL 3 BASIC14.53□□□□□ -0.08
PRAMEF20Q5VT98 COX11-202ENST00000571584 1108 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
PRAMEF20Q5VT98 C1QTNF1-212ENST00000583904 1129 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.53□□□□□ -0.08
PRAMEF20Q5VT98 CD300LG-205ENST00000586233 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
PRAMEF20Q5VT98 ZNF586-205ENST00000598885 578 ntTSL 4 BASIC14.53□□□□□ -0.08
PRAMEF20Q5VT98 DUSP13-214ENST00000607131 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
PRAMEF20Q5VT98 FOLR3-204ENST00000611028 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
PRAMEF20Q5VT98 LRRN2-203ENST00000367177 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
PRAMEF20Q5VT98 BTBD1-201ENST00000261721 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
PRAMEF20Q5VT98 PRR18-201ENST00000322583 3084 ntAPPRIS P2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
PRAMEF20Q5VT98 SIN3B-202ENST00000379803 5129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
PRAMEF20Q5VT98 ARL8B-201ENST00000256496 3005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
PRAMEF20Q5VT98 ZNF134-201ENST00000396161 4914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
PRAMEF20Q5VT98 PIAS3-201ENST00000369298 2761 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
PRAMEF20Q5VT98 CARD11-203ENST00000396946 4366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
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PRAMEF20Q5VT98 AC006019.1-201ENST00000425591 2470 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
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PRAMEF20Q5VT98 BAP1-202ENST00000460680 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
PRAMEF20Q5VT98 ZNF18-204ENST00000580306 2330 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
PRAMEF20Q5VT98 IFRD1-202ENST00000403825 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
PRAMEF20Q5VT98 CLEC18A-209ENST00000615430 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
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PRAMEF20Q5VT98 FNDC1-201ENST00000297267 6552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
PRAMEF20Q5VT98 TAP2-205ENST00000620123 5676 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
PRAMEF20Q5VT98 ANKRD26-201ENST00000376087 6591 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
PRAMEF20Q5VT98 SNRPD3-201ENST00000215829 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
PRAMEF20Q5VT98 POLR1D-207ENST00000621089 1606 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
PRAMEF20Q5VT98 ZNF418-208ENST00000599852 2501 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.08
PRAMEF20Q5VT98 FBXL5-201ENST00000341285 3385 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
PRAMEF20Q5VT98 ALK-201ENST00000389048 6220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
PRAMEF20Q5VT98 CPXM1-201ENST00000380605 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
PRAMEF20Q5VT98 NSUN5-203ENST00000428206 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.08
PRAMEF20Q5VT98 ZSCAN2-203ENST00000334141 993 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
PRAMEF20Q5VT98 CALY-202ENST00000368555 783 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
PRAMEF20Q5VT98 TCEAL3-202ENST00000372627 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
PRAMEF20Q5VT98 LRCOL1-201ENST00000376608 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
PRAMEF20Q5VT98 CCL25-203ENST00000390669 924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
PRAMEF20Q5VT98 SLC35B4-204ENST00000470969 1033 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
PRAMEF20Q5VT98 PSEN2-206ENST00000472139 1163 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
PRAMEF20Q5VT98 TAF8-206ENST00000472818 719 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
PRAMEF20Q5VT98 TMEM176B-206ENST00000492607 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
PRAMEF20Q5VT98 AC139713.2-206ENST00000499587 566 ntTSL 4 BASIC14.52□□□□□ -0.09
PRAMEF20Q5VT98 AC123777.1-201ENST00000534827 1247 ntTSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.09
PRAMEF20Q5VT98 HNRNPUP1-201ENST00000554987 333 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
PRAMEF20Q5VT98 AL096870.1-201ENST00000555591 930 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.52□□□□□ -0.09
PRAMEF20Q5VT98 AC091544.3-201ENST00000556424 531 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
PRAMEF20Q5VT98 AC087741.1-202ENST00000573346 801 ntTSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.09
PRAMEF20Q5VT98 GFOD1-203ENST00000379287 8751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
PRAMEF20Q5VT98 ADRB1-201ENST00000369295 2853 ntAPPRIS P1 BASIC14.52□□□□□ -0.09
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