Protein–RNA interactions for Protein: Q5TDP6

LGSN, Lengsin, humanhuman

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Length 509 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LGSNQ5TDP6 SUMO2P17-202ENST00000508743 738 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
LGSNQ5TDP6 UNC93B6-202ENST00000528242 690 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
LGSNQ5TDP6 OTUB2-202ENST00000553723 708 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
LGSNQ5TDP6 NUBP2-214ENST00000568706 913 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
LGSNQ5TDP6 AC024267.1-201ENST00000582320 895 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
LGSNQ5TDP6 AL161645.1-201ENST00000622716 1255 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
LGSNQ5TDP6 FAM215A-202ENST00000632077 792 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
LGSNQ5TDP6 ETV2-205ENST00000479824 1342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
LGSNQ5TDP6 TP53INP2-201ENST00000374809 4018 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
LGSNQ5TDP6 LEMD3-201ENST00000308330 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
LGSNQ5TDP6 MED19-201ENST00000337672 1637 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
LGSNQ5TDP6 CRYM-AS1-201ENST00000338573 1661 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
LGSNQ5TDP6 KAT7-210ENST00000509773 1774 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
LGSNQ5TDP6 TBC1D1-201ENST00000261439 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
LGSNQ5TDP6 UCP2-201ENST00000310473 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
LGSNQ5TDP6 GORAB-202ENST00000367763 2189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
LGSNQ5TDP6 ANKRD23-201ENST00000318357 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
LGSNQ5TDP6 MIER1-208ENST00000401041 2552 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
LGSNQ5TDP6 COMP-203ENST00000542601 2707 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
LGSNQ5TDP6 ASH2L-212ENST00000545394 2808 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
LGSNQ5TDP6 RBFOX3-211ENST00000583458 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
LGSNQ5TDP6 SLC25A34-201ENST00000294454 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
LGSNQ5TDP6 BAG1-210ENST00000634734 3786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
LGSNQ5TDP6 CIC-207ENST00000575354 5473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
LGSNQ5TDP6 LHFPL4-201ENST00000287585 4880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
LGSNQ5TDP6 LRCH1-202ENST00000389797 3314 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
LGSNQ5TDP6 REPIN1-209ENST00000479668 3182 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
LGSNQ5TDP6 CYTH2-214ENST00000641098 2721 ntAPPRIS ALT1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
LGSNQ5TDP6 MECR-202ENST00000373791 2416 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
LGSNQ5TDP6 LAT2-202ENST00000344995 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
LGSNQ5TDP6 PKD2L2-205ENST00000508638 2333 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
LGSNQ5TDP6 SDCBP-201ENST00000260130 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
LGSNQ5TDP6 CPEB1-211ENST00000615198 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
LGSNQ5TDP6 CFLAR-204ENST00000341582 2056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
LGSNQ5TDP6 HYAL2-201ENST00000357750 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
LGSNQ5TDP6 AC112693.3-201ENST00000624819 1983 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
LGSNQ5TDP6 LINC01101-201ENST00000622953 1884 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
LGSNQ5TDP6 UNC5C-202ENST00000504962 1789 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
LGSNQ5TDP6 NFIC-203ENST00000443272 1716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
LGSNQ5TDP6 SIRT6-202ENST00000337491 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
LGSNQ5TDP6 PAX6-276ENST00000640684 1557 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
LGSNQ5TDP6 SEPT7-201ENST00000350320 4350 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
LGSNQ5TDP6 MECR-201ENST00000263702 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
LGSNQ5TDP6 AC093627.6-201ENST00000478759 1365 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
LGSNQ5TDP6 LIM2-201ENST00000221973 983 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
LGSNQ5TDP6 SWI5-201ENST00000320188 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
LGSNQ5TDP6 SLX1A-202ENST00000345535 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
LGSNQ5TDP6 SLX1B-202ENST00000351581 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
LGSNQ5TDP6 CHCHD1-201ENST00000372833 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
LGSNQ5TDP6 AC140658.5-201ENST00000438532 169 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
LGSNQ5TDP6 SMCO4-204ENST00000527149 472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
LGSNQ5TDP6 TMIGD2-203ENST00000600114 489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
LGSNQ5TDP6 TMEM114-205ENST00000624696 560 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
LGSNQ5TDP6 PGLYRP1-201ENST00000008938 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
LGSNQ5TDP6 PATZ1-202ENST00000266269 3781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
LGSNQ5TDP6 GTF2IRD1-205ENST00000476977 5868 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
LGSNQ5TDP6 SLC2A13-201ENST00000280871 7003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
LGSNQ5TDP6 NATD1-201ENST00000611551 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
LGSNQ5TDP6 C18orf15-201ENST00000623680 2534 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
LGSNQ5TDP6 GPD1L-201ENST00000282541 4060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
LGSNQ5TDP6 CXorf40A-209ENST00000441248 2411 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
LGSNQ5TDP6 SLC24A3-201ENST00000328041 3929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
LGSNQ5TDP6 KCNT1-211ENST00000491806 3678 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
LGSNQ5TDP6 SERPINE2-202ENST00000409304 2161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
LGSNQ5TDP6 SEZ6L-209ENST00000529632 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
LGSNQ5TDP6 CAMSAP1-203ENST00000409386 5730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
LGSNQ5TDP6 KCNJ14-201ENST00000342291 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
LGSNQ5TDP6 TONSL-203ENST00000613741 1713 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
LGSNQ5TDP6 TRAK1-203ENST00000396175 5033 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
LGSNQ5TDP6 IL12RB2-206ENST00000544434 3782 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
LGSNQ5TDP6 CYP4F22-201ENST00000269703 2641 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
LGSNQ5TDP6 FOXH1-201ENST00000377317 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
LGSNQ5TDP6 POR-201ENST00000394893 2532 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
LGSNQ5TDP6 TNRC18-202ENST00000399434 1459 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
LGSNQ5TDP6 ABCB7-201ENST00000253577 2377 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
LGSNQ5TDP6 CHAF1A-201ENST00000301280 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
LGSNQ5TDP6 CNDP2-201ENST00000324262 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
LGSNQ5TDP6 TEX13C-201ENST00000632600 5095 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
LGSNQ5TDP6 GPRASP1-205ENST00000537097 5980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
LGSNQ5TDP6 CHTF18-205ENST00000455171 3172 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
LGSNQ5TDP6 GLI2-203ENST00000361492 6768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
LGSNQ5TDP6 LRRFIP1P1-201ENST00000498774 2246 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
LGSNQ5TDP6 RNF151-201ENST00000321392 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
LGSNQ5TDP6 ICOSLG-201ENST00000344330 1009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
LGSNQ5TDP6 TCEAL3-203ENST00000372628 1221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
LGSNQ5TDP6 AL133467.1-201ENST00000554161 993 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
LGSNQ5TDP6 AL512357.1-201ENST00000557687 518 ntTSL 4 BASIC16.05■□□□□ 0.16
LGSNQ5TDP6 AC023355.1-201ENST00000560323 752 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
LGSNQ5TDP6 AC133550.1-201ENST00000563565 295 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
LGSNQ5TDP6 PMF1-BGLAP-204ENST00000567140 655 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
LGSNQ5TDP6 RNF151-203ENST00000569714 796 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
LGSNQ5TDP6 PAM16-215ENST00000577031 548 ntTSL 4 BASIC16.05■□□□□ 0.16
LGSNQ5TDP6 RPL19-204ENST00000579260 1051 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
LGSNQ5TDP6 SLC26A1-205ENST00000622731 1057 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
LGSNQ5TDP6 MEIOC-201ENST00000409122 4604 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
LGSNQ5TDP6 FBXL19-202ENST00000380310 3796 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
LGSNQ5TDP6 TKT-202ENST00000423516 2075 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
LGSNQ5TDP6 TMEM50A-201ENST00000374358 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
LGSNQ5TDP6 AL035460.1-201ENST00000380593 1866 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
LGSNQ5TDP6 SEPT8-205ENST00000378701 1817 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
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