Protein–RNA interactions for Protein: Q5SW79

CEP170, Centrosomal protein of 170 kDa, humanhuman

Predictions only

Length 1,584 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CEP170Q5SW79 MEI1-215ENST00000540833 2326 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
CEP170Q5SW79 OBSL1-201ENST00000289656 2274 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
CEP170Q5SW79 B4GALT3-201ENST00000319769 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CEP170Q5SW79 POLD3-208ENST00000532497 1700 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CEP170Q5SW79 MCM9-201ENST00000316068 2442 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CEP170Q5SW79 AHRR-203ENST00000505113 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CEP170Q5SW79 OSCP1-204ENST00000433045 1381 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
CEP170Q5SW79 LINC01529-205ENST00000637365 2000 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
CEP170Q5SW79 ACSS3-201ENST00000261206 2666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CEP170Q5SW79 ADAD1-201ENST00000296513 1961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
CEP170Q5SW79 SUMO1-204ENST00000409181 784 ntTSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
CEP170Q5SW79 SUMO1-207ENST00000409498 779 ntTSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
CEP170Q5SW79 AC069277.1-202ENST00000414438 761 ntTSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
CEP170Q5SW79 AC068134.1-201ENST00000441266 481 ntTSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
CEP170Q5SW79 ZNF528-AS1-202ENST00000596746 929 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
CEP170Q5SW79 CNOT7-213ENST00000628418 432 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
CEP170Q5SW79 SIGLEC6-205ENST00000425629 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
CEP170Q5SW79 SERPING1-204ENST00000378324 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
CEP170Q5SW79 ALOX12-AS1-201ENST00000399540 1730 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
CEP170Q5SW79 ZNF598-204ENST00000563630 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CEP170Q5SW79 NRP1-204ENST00000374822 2213 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CEP170Q5SW79 WASH3P-204ENST00000558784 1644 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
CEP170Q5SW79 ZSCAN10-201ENST00000252463 2463 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CEP170Q5SW79 TRPV4-207ENST00000541794 2475 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CEP170Q5SW79 ZDHHC4-204ENST00000396709 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
CEP170Q5SW79 ZNF514-201ENST00000295208 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CEP170Q5SW79 MIR648-201ENST00000385046 94 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
CEP170Q5SW79 TEX33-202ENST00000402860 986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CEP170Q5SW79 LINC01006-202ENST00000418309 640 ntTSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
CEP170Q5SW79 IKBKB-212ENST00000519735 1166 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CEP170Q5SW79 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CEP170Q5SW79 WDR83-201ENST00000418543 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CEP170Q5SW79 PNMA6E-202ENST00000633844 2596 ntTSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
CEP170Q5SW79 SCOC-208ENST00000510586 2193 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
CEP170Q5SW79 AP001094.4-201ENST00000579008 2176 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
CEP170Q5SW79 TIMM44-201ENST00000270538 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CEP170Q5SW79 PPP1R15A-201ENST00000200453 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CEP170Q5SW79 AC005253.1-201ENST00000597411 2001 ntTSL 4 BASIC24.74■■□□□ 1.55
CEP170Q5SW79 DACT2-201ENST00000366795 2942 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
CEP170Q5SW79 BUD31-202ENST00000403633 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CEP170Q5SW79 AL139339.1-201ENST00000411906 657 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
CEP170Q5SW79 AL109767.1-201ENST00000429450 564 ntTSL 4 BASIC24.74■■□□□ 1.55
CEP170Q5SW79 VDAC1P1-201ENST00000439229 848 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
CEP170Q5SW79 LINC01481-204ENST00000550216 494 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
CEP170Q5SW79 MAP3K14-AS1-210ENST00000592422 831 ntTSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
CEP170Q5SW79 AL132994.2-201ENST00000603120 687 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
CEP170Q5SW79 AC007881.3-201ENST00000608897 607 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
CEP170Q5SW79 AC242376.2-201ENST00000619355 883 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
CEP170Q5SW79 AL603764.1-201ENST00000636452 321 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
CEP170Q5SW79 TTLL12-201ENST00000216129 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CEP170Q5SW79 SERF2-201ENST00000249786 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CEP170Q5SW79 ADAM6-201ENST00000606026 1843 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
CEP170Q5SW79 ZNF7-218ENST00000544249 2125 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
CEP170Q5SW79 SUMO3-203ENST00000397898 1779 ntTSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
CEP170Q5SW79 TC2N-206ENST00000556018 1770 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
CEP170Q5SW79 TGFB1I1-214ENST00000567607 1770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CEP170Q5SW79 CCDC121-202ENST00000394775 1472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CEP170Q5SW79 SPSB4-201ENST00000310546 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CEP170Q5SW79 C16orf71-204ENST00000590191 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
CEP170Q5SW79 FBXL17-201ENST00000359660 4510 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CEP170Q5SW79 CTNNAL1-201ENST00000325551 2490 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CEP170Q5SW79 C11orf16-201ENST00000326053 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CEP170Q5SW79 DCAF4-201ENST00000353777 1940 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CEP170Q5SW79 SLCO6A1-207ENST00000513675 1611 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CEP170Q5SW79 DIABLO-204ENST00000413918 1859 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CEP170Q5SW79 SLCO2B1-205ENST00000525650 2121 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CEP170Q5SW79 LINC00680-205ENST00000450081 1593 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CEP170Q5SW79 MAGEA9-201ENST00000243314 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CEP170Q5SW79 MGAT1-203ENST00000393340 3077 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CEP170Q5SW79 TMSB10-201ENST00000233143 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CEP170Q5SW79 MRPL23-204ENST00000397297 613 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CEP170Q5SW79 HLA-K-203ENST00000430151 1046 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
CEP170Q5SW79 TUBB8P8-201ENST00000458717 1058 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
CEP170Q5SW79 SIRT3-210ENST00000529382 1225 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CEP170Q5SW79 AC141586.1-203ENST00000567242 366 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
CEP170Q5SW79 AC127024.2-201ENST00000581019 789 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CEP170Q5SW79 AC011825.3-201ENST00000583184 565 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CEP170Q5SW79 GLIDR-205ENST00000640674 884 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CEP170Q5SW79 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CEP170Q5SW79 TRPV4-205ENST00000537083 2436 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CEP170Q5SW79 BATF2-201ENST00000301887 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CEP170Q5SW79 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CEP170Q5SW79 GPR149-201ENST00000389740 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CEP170Q5SW79 UBL7-AS1-203ENST00000564621 1612 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CEP170Q5SW79 AP003356.1-202ENST00000517910 2770 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CEP170Q5SW79 CTNNAL1-204ENST00000374595 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CEP170Q5SW79 SAR1B-208ENST00000507419 2287 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CEP170Q5SW79 FAM49B-201ENST00000401979 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CEP170Q5SW79 PARVB-203ENST00000404989 1591 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CEP170Q5SW79 MAEA-207ENST00000505177 1340 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CEP170Q5SW79 ARL6IP6-201ENST00000326446 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CEP170Q5SW79 GPANK1-203ENST00000375896 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CEP170Q5SW79 OR9I1-201ENST00000302610 945 ntAPPRIS P1 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CEP170Q5SW79 GTF2A2-205ENST00000396064 633 ntTSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CEP170Q5SW79 APOL3-207ENST00000424878 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CEP170Q5SW79 DNAJB1P1-201ENST00000429417 1024 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
CEP170Q5SW79 PFN2-205ENST00000461868 613 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CEP170Q5SW79 GTF2A2-208ENST00000484743 408 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CEP170Q5SW79 AC004066.1-201ENST00000502488 802 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
CEP170Q5SW79 PRSS30P-205ENST00000506153 699 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 115.6 ms