Protein–RNA interactions for Protein: Q3LHN1

KRTAP21-3, Keratin-associated protein 21-3, humanhuman

Predictions only

Length 58 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP21-3Q3LHN1 AC011450.1-202ENST00000358234 573 ntTSL 4 BASIC11.77□□□□□ -0.53
KRTAP21-3Q3LHN1 S100A13-203ENST00000392623 579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.77□□□□□ -0.53
KRTAP21-3Q3LHN1 AL157935.1-209ENST00000415141 1105 ntTSL 2 BASIC11.77□□□□□ -0.53
KRTAP21-3Q3LHN1 AP002856.2-201ENST00000416553 584 ntTSL 3 BASIC11.77□□□□□ -0.53
KRTAP21-3Q3LHN1 AC093106.1-201ENST00000437271 352 ntBASIC11.77□□□□□ -0.53
KRTAP21-3Q3LHN1 AL773545.2-201ENST00000442149 472 ntBASIC11.77□□□□□ -0.53
KRTAP21-3Q3LHN1 B9D1-206ENST00000461069 923 ntTSL 2 BASIC11.77□□□□□ -0.53
KRTAP21-3Q3LHN1 MAATS1-203ENST00000463700 939 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
KRTAP21-3Q3LHN1 SNHG4-204ENST00000507197 865 ntTSL 2 BASIC11.77□□□□□ -0.53
KRTAP21-3Q3LHN1 AC104964.1-201ENST00000520494 489 ntTSL 2 BASIC11.77□□□□□ -0.53
KRTAP21-3Q3LHN1 AC009055.1-201ENST00000562656 781 ntTSL 3 BASIC11.77□□□□□ -0.53
KRTAP21-3Q3LHN1 LINC02252-201ENST00000565706 487 ntTSL 3 BASIC11.77□□□□□ -0.53
KRTAP21-3Q3LHN1 MIR4683-201ENST00000579659 81 ntBASIC11.77□□□□□ -0.53
KRTAP21-3Q3LHN1 AC010754.1-201ENST00000582300 1061 ntTSL 3 BASIC11.77□□□□□ -0.53
KRTAP21-3Q3LHN1 CLPP-205ENST00000596605 646 ntTSL 2 BASIC11.77□□□□□ -0.53
KRTAP21-3Q3LHN1 AC017033.1-201ENST00000603720 708 ntTSL 2 BASIC11.77□□□□□ -0.53
KRTAP21-3Q3LHN1 AC087072.1-201ENST00000603727 421 ntBASIC11.77□□□□□ -0.53
KRTAP21-3Q3LHN1 AC097359.3-201ENST00000603982 1210 ntBASIC11.77□□□□□ -0.53
KRTAP21-3Q3LHN1 APOBEC3H-207ENST00000613996 465 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
KRTAP21-3Q3LHN1 ADAMTS9-AS1-216ENST00000626280 882 ntTSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.53
KRTAP21-3Q3LHN1 Z98259.2-201ENST00000641583 609 ntBASIC11.77□□□□□ -0.53
KRTAP21-3Q3LHN1 ANKRD33-201ENST00000301190 1935 ntTSL 2 BASIC11.77□□□□□ -0.53
KRTAP21-3Q3LHN1 SULT1A2-202ENST00000395630 1322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.53
KRTAP21-3Q3LHN1 RPL4P6-201ENST00000438116 1304 ntBASIC11.77□□□□□ -0.53
KRTAP21-3Q3LHN1 UQCC2-204ENST00000607484 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
KRTAP21-3Q3LHN1 RHNO1-202ENST00000461997 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.77□□□□□ -0.53
KRTAP21-3Q3LHN1 AC093462.1-201ENST00000621167 1683 ntBASIC11.77□□□□□ -0.53
KRTAP21-3Q3LHN1 SLC23A3-203ENST00000409878 2010 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.77□□□□□ -0.53
KRTAP21-3Q3LHN1 TBKBP1-204ENST00000622396 2010 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
KRTAP21-3Q3LHN1 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
KRTAP21-3Q3LHN1 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
KRTAP21-3Q3LHN1 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.53
KRTAP21-3Q3LHN1 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.53
KRTAP21-3Q3LHN1 APH1A-203ENST00000369109 1713 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
KRTAP21-3Q3LHN1 HSD17B6-207ENST00000555805 1722 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.53
KRTAP21-3Q3LHN1 AC005622.1-201ENST00000636801 1703 ntBASIC11.77□□□□□ -0.53
KRTAP21-3Q3LHN1 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC11.77□□□□□ -0.53
KRTAP21-3Q3LHN1 UGP2-202ENST00000394417 2136 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
KRTAP21-3Q3LHN1 CAMKK2-207ENST00000404169 2116 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
KRTAP21-3Q3LHN1 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
KRTAP21-3Q3LHN1 CELF2-206ENST00000608830 1892 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
KRTAP21-3Q3LHN1 TBX10-201ENST00000335385 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
KRTAP21-3Q3LHN1 GBA2-201ENST00000378088 1672 ntTSL 2 BASIC11.76□□□□□ -0.53
KRTAP21-3Q3LHN1 PDCD1-201ENST00000334409 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
KRTAP21-3Q3LHN1 MIR339-201ENST00000362153 94 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
KRTAP21-3Q3LHN1 PHACTR2-204ENST00000397980 745 ntTSL 3 BASIC11.76□□□□□ -0.53
KRTAP21-3Q3LHN1 SKOR2-201ENST00000400404 891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
KRTAP21-3Q3LHN1 AC147651.3-201ENST00000429872 731 ntTSL 2 BASIC11.76□□□□□ -0.53
KRTAP21-3Q3LHN1 HMGA1P2-201ENST00000430198 324 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
KRTAP21-3Q3LHN1 AC006372.2-201ENST00000433660 292 ntTSL 3 BASIC11.76□□□□□ -0.53
KRTAP21-3Q3LHN1 AC006328.1-201ENST00000437571 379 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
KRTAP21-3Q3LHN1 BX276092.5-201ENST00000439926 886 ntTSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
KRTAP21-3Q3LHN1 ERP29P1-201ENST00000442902 706 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
KRTAP21-3Q3LHN1 LINC01502-203ENST00000447907 880 ntTSL 3 BASIC11.76□□□□□ -0.53
KRTAP21-3Q3LHN1 SNHG14-206ENST00000450809 677 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
KRTAP21-3Q3LHN1 AAMDC-207ENST00000527134 693 ntTSL 3 BASIC11.76□□□□□ -0.53
KRTAP21-3Q3LHN1 AC010183.1-201ENST00000552413 559 ntTSL 4 BASIC11.76□□□□□ -0.53
KRTAP21-3Q3LHN1 ACSM5-206ENST00000575584 1130 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
KRTAP21-3Q3LHN1 GLIS2-AS1-201ENST00000576080 340 ntTSL 2 BASIC11.76□□□□□ -0.53
KRTAP21-3Q3LHN1 AC145343.1-201ENST00000579629 650 ntTSL 3 BASIC11.76□□□□□ -0.53
KRTAP21-3Q3LHN1 C17orf62-234ENST00000584503 584 ntTSL 2 BASIC11.76□□□□□ -0.53
KRTAP21-3Q3LHN1 AC005746.2-201ENST00000585765 470 ntTSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
KRTAP21-3Q3LHN1 AC003006.1-202ENST00000594684 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
KRTAP21-3Q3LHN1 AP000229.1-202ENST00000609365 559 ntTSL 4 BASIC11.76□□□□□ -0.53
KRTAP21-3Q3LHN1 PDCD6-213ENST00000618970 931 ntTSL 3 BASIC11.76□□□□□ -0.53
KRTAP21-3Q3LHN1 RPL13A-213ENST00000621674 1098 ntTSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
KRTAP21-3Q3LHN1 MIR6819-201ENST00000622122 61 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
KRTAP21-3Q3LHN1 STMN1-203ENST00000399728 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.76□□□□□ -0.53
KRTAP21-3Q3LHN1 CENPT-235ENST00000626059 1737 ntTSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
KRTAP21-3Q3LHN1 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
KRTAP21-3Q3LHN1 WBP2-215ENST00000591399 2225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
KRTAP21-3Q3LHN1 ATP6V1D-201ENST00000216442 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
KRTAP21-3Q3LHN1 APOBEC3A-201ENST00000249116 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
KRTAP21-3Q3LHN1 FN1-208ENST00000426059 2388 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
KRTAP21-3Q3LHN1 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
KRTAP21-3Q3LHN1 CCT5-205ENST00000506600 1939 ntTSL 2 BASIC11.76□□□□□ -0.53
KRTAP21-3Q3LHN1 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
KRTAP21-3Q3LHN1 ANKDD1A-202ENST00000395720 1518 ntTSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
KRTAP21-3Q3LHN1 RBFOX3-203ENST00000580155 1519 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.76□□□□□ -0.53
KRTAP21-3Q3LHN1 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
KRTAP21-3Q3LHN1 PSMC5-201ENST00000310144 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
KRTAP21-3Q3LHN1 CST9-201ENST00000376971 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
KRTAP21-3Q3LHN1 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
KRTAP21-3Q3LHN1 FAM13C-204ENST00000468840 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.75□□□□□ -0.53
KRTAP21-3Q3LHN1 AGAP4-201ENST00000311652 2715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
KRTAP21-3Q3LHN1 CD55-201ENST00000314754 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
KRTAP21-3Q3LHN1 AC244394.1-201ENST00000435000 1665 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
KRTAP21-3Q3LHN1 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
KRTAP21-3Q3LHN1 ERICH5-201ENST00000318528 1761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
KRTAP21-3Q3LHN1 MFSD4A-207ENST00000536357 1841 ntTSL 2 BASIC11.75□□□□□ -0.53
KRTAP21-3Q3LHN1 S100B-201ENST00000291700 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
KRTAP21-3Q3LHN1 SMIM4-201ENST00000307106 274 ntTSL 2 BASIC11.75□□□□□ -0.53
KRTAP21-3Q3LHN1 MAL-202ENST00000349807 705 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
KRTAP21-3Q3LHN1 ANG-202ENST00000397990 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
KRTAP21-3Q3LHN1 AC007319.1-202ENST00000412276 829 ntTSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
KRTAP21-3Q3LHN1 LINC01022-201ENST00000415652 394 ntTSL 3 BASIC11.75□□□□□ -0.53
KRTAP21-3Q3LHN1 BX284668.5-201ENST00000422124 406 ntTSL 2 BASIC11.75□□□□□ -0.53
KRTAP21-3Q3LHN1 AC103702.2-203ENST00000425510 379 ntTSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
KRTAP21-3Q3LHN1 RPL15-208ENST00000435882 1063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.75□□□□□ -0.53
KRTAP21-3Q3LHN1 AC098934.1-203ENST00000442868 1262 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.7 ms