Protein–RNA interactions for Protein: Q17R55

FAM187B, Protein FAM187B, humanhuman

Predictions only

Length 369 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM187BQ17R55 HS6ST2-201ENST00000370833 1938 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
FAM187BQ17R55 SEPT5-204ENST00000406395 1974 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
FAM187BQ17R55 ILF3-AS1-201ENST00000591501 1983 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
FAM187BQ17R55 AL365203.3-201ENST00000609742 2057 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
FAM187BQ17R55 PRRT2-214ENST00000637064 2153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
FAM187BQ17R55 PLEKHB1-202ENST00000354190 2380 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
FAM187BQ17R55 TRIM33-201ENST00000358465 8339 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
FAM187BQ17R55 PJA1-201ENST00000361478 2755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
FAM187BQ17R55 SUN1-204ENST00000403868 978 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
FAM187BQ17R55 AL691459.1-201ENST00000438589 407 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
FAM187BQ17R55 AL162726.2-201ENST00000438986 1017 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
FAM187BQ17R55 FUZ-207ENST00000526575 482 ntTSL 4 BASIC17.09■□□□□ 0.33
FAM187BQ17R55 ENPP7P5-201ENST00000541031 1031 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
FAM187BQ17R55 LYSMD2-204ENST00000560491 1026 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
FAM187BQ17R55 AC120045.2-201ENST00000567334 178 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
FAM187BQ17R55 MIF4GD-206ENST00000579119 856 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
FAM187BQ17R55 FXYD6-216ENST00000584230 566 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
FAM187BQ17R55 TBCB-211ENST00000589996 724 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
FAM187BQ17R55 ODF3-201ENST00000325113 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
FAM187BQ17R55 ADPRHL1-202ENST00000375418 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
FAM187BQ17R55 ATP6V1C2-201ENST00000272238 1565 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
FAM187BQ17R55 AC008770.3-201ENST00000590798 1562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
FAM187BQ17R55 CHIA-201ENST00000343320 1624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
FAM187BQ17R55 HPCAL1-207ENST00000620771 1941 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
FAM187BQ17R55 ARHGAP11A-201ENST00000361627 5898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
FAM187BQ17R55 DOC2GP-204ENST00000639052 2548 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
FAM187BQ17R55 AEBP1-206ENST00000450684 2571 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
FAM187BQ17R55 PPP4R3A-208ENST00000555462 3236 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
FAM187BQ17R55 COBL-201ENST00000265136 5291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
FAM187BQ17R55 ZNF804A-201ENST00000302277 4690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
FAM187BQ17R55 KCNB1-203ENST00000635465 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
FAM187BQ17R55 POLL-217ENST00000628479 1953 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
FAM187BQ17R55 AP005117.1-202ENST00000581724 1908 ntBASIC17.08■□□□□ 0.33
FAM187BQ17R55 FAM181A-201ENST00000267594 1816 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
FAM187BQ17R55 ARHGEF7-214ENST00000478679 1833 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
FAM187BQ17R55 BABAM1-201ENST00000359435 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
FAM187BQ17R55 DRD5P1-201ENST00000456605 1438 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
FAM187BQ17R55 KRT8P22-201ENST00000562317 1415 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
FAM187BQ17R55 PHLDA2-201ENST00000314222 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
FAM187BQ17R55 DERL3-204ENST00000406855 1063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
FAM187BQ17R55 AL136988.1-201ENST00000414640 1029 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
FAM187BQ17R55 AC105940.2-201ENST00000421055 380 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
FAM187BQ17R55 AC007389.4-201ENST00000454674 793 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
FAM187BQ17R55 VDAC1P7-201ENST00000462417 847 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
FAM187BQ17R55 NAA50-208ENST00000497255 789 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
FAM187BQ17R55 AP001360.1-202ENST00000526934 479 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
FAM187BQ17R55 LINC01220-201ENST00000558575 715 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
FAM187BQ17R55 SLC25A39-207ENST00000586016 1156 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
FAM187BQ17R55 AC005253.2-201ENST00000593791 432 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
FAM187BQ17R55 SLC9A3-AS1-206ENST00000607005 435 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
FAM187BQ17R55 AC073389.2-202ENST00000607450 441 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
FAM187BQ17R55 LINC01002-214ENST00000632102 561 ntTSL 4 BASIC17.08■□□□□ 0.32
FAM187BQ17R55 ABBA01031660.1-201ENST00000635219 756 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
FAM187BQ17R55 ZSCAN10-201ENST00000252463 2463 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
FAM187BQ17R55 NOMO1-208ENST00000620755 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
FAM187BQ17R55 GFM1-208ENST00000478576 2147 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
FAM187BQ17R55 EPHX2-201ENST00000380476 2064 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
FAM187BQ17R55 SYNC-202ENST00000409190 3398 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
FAM187BQ17R55 RAB22A-201ENST00000244040 8670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
FAM187BQ17R55 NIPAL3-204ENST00000374399 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
FAM187BQ17R55 GLDC-201ENST00000321612 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
FAM187BQ17R55 GINS2-201ENST00000253462 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
FAM187BQ17R55 ADAM15-228ENST00000531455 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
FAM187BQ17R55 SOCS7-201ENST00000612932 7857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
FAM187BQ17R55 CLYBL-203ENST00000376355 6771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
FAM187BQ17R55 NR4A3-202ENST00000338488 2588 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
FAM187BQ17R55 DIABLO-208ENST00000464942 2569 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
FAM187BQ17R55 PLCB2-201ENST00000260402 4616 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
FAM187BQ17R55 NRXN2-202ENST00000301894 3535 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
FAM187BQ17R55 KRT9-202ENST00000588431 1493 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
FAM187BQ17R55 AC012485.3-201ENST00000637634 2424 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
FAM187BQ17R55 LUC7L3-202ENST00000393227 2284 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
FAM187BQ17R55 SLC44A1-203ENST00000374724 3088 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
FAM187BQ17R55 NPY-201ENST00000242152 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
FAM187BQ17R55 MRPL53-201ENST00000258105 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
FAM187BQ17R55 LDLRAD1-201ENST00000371360 785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
FAM187BQ17R55 AL513303.2-201ENST00000413339 536 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
FAM187BQ17R55 U91328.1-201ENST00000437528 223 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
FAM187BQ17R55 MDH2-205ENST00000461263 648 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
FAM187BQ17R55 AC106886.1-201ENST00000568660 600 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
FAM187BQ17R55 AC016727.1-204ENST00000578974 420 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
FAM187BQ17R55 AC011497.1-201ENST00000596781 561 ntTSL 4 BASIC17.07■□□□□ 0.32
FAM187BQ17R55 LCN8-205ENST00000612714 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
FAM187BQ17R55 SPIN2A-203ENST00000614076 966 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
FAM187BQ17R55 GABBR1-205ENST00000377034 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
FAM187BQ17R55 SHQ1-201ENST00000325599 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
FAM187BQ17R55 DNM2-202ENST00000359692 3588 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
FAM187BQ17R55 NAP1L4-201ENST00000380542 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
FAM187BQ17R55 LRRC57-204ENST00000563454 2407 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
FAM187BQ17R55 CPXM1-201ENST00000380605 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
FAM187BQ17R55 COX6B2-201ENST00000326529 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
FAM187BQ17R55 CTSO-201ENST00000433477 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
FAM187BQ17R55 CHRNG-202ENST00000389494 2262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
FAM187BQ17R55 RAB1A-204ENST00000409892 2254 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
FAM187BQ17R55 SUV39H1-202ENST00000376687 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
FAM187BQ17R55 PGAP2-205ENST00000396993 1566 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
FAM187BQ17R55 MFF-204ENST00000353339 2186 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
FAM187BQ17R55 GPAT2-201ENST00000359548 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
FAM187BQ17R55 MED17-201ENST00000251871 5142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
FAM187BQ17R55 ZP3-201ENST00000336517 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64.9 ms