Protein–RNA interactions for Protein: Q16795

NDUFA9, NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 alpha subcomplex subunit 9, mitochondrial, humanhuman

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Length 377 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NDUFA9Q16795 ACRV1-201ENST00000315608 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
NDUFA9Q16795 DBNDD2-205ENST00000372717 1207 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
NDUFA9Q16795 CIB3-202ENST00000379859 467 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
NDUFA9Q16795 ZDHHC20-IT1-201ENST00000417513 440 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
NDUFA9Q16795 AC008278.1-201ENST00000431117 568 ntTSL 4 BASIC15.22■□□□□ 0.03
NDUFA9Q16795 HMGN1P19-201ENST00000436976 333 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
NDUFA9Q16795 LINC01160-202ENST00000450155 894 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
NDUFA9Q16795 TMEM176B-205ENST00000450753 1006 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
NDUFA9Q16795 IGFBP2-204ENST00000456764 846 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
NDUFA9Q16795 AL359815.1-201ENST00000457706 821 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
NDUFA9Q16795 CNOT8-210ENST00000519404 945 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
NDUFA9Q16795 CNOT8-214ENST00000520671 923 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
NDUFA9Q16795 CNOT8-218ENST00000521583 1151 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
NDUFA9Q16795 COQ9-214ENST00000567933 882 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
NDUFA9Q16795 NAA60-208ENST00000570819 833 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
NDUFA9Q16795 NFATC3-222ENST00000575270 3824 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
NDUFA9Q16795 AC011491.2-201ENST00000599584 447 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
NDUFA9Q16795 AL096865.1-201ENST00000606796 927 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
NDUFA9Q16795 AC105277.1-203ENST00000635492 1293 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
NDUFA9Q16795 XPO1-201ENST00000401558 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
NDUFA9Q16795 ADAM9-206ENST00000481513 2387 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
NDUFA9Q16795 SSFA2-205ENST00000431877 5150 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
NDUFA9Q16795 AC068831.3-201ENST00000553321 1858 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
NDUFA9Q16795 RAB9A-202ENST00000464506 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
NDUFA9Q16795 ATG13-216ENST00000530500 2030 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
NDUFA9Q16795 ABHD2-207ENST00000565973 2347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
NDUFA9Q16795 MECR-201ENST00000263702 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
NDUFA9Q16795 CANX-201ENST00000247461 4260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
NDUFA9Q16795 SLC17A9-201ENST00000370349 2594 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
NDUFA9Q16795 NDRG1-202ENST00000414097 3755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
NDUFA9Q16795 PDE4C-207ENST00000594617 4655 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
NDUFA9Q16795 TMTC2-203ENST00000548305 2682 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
NDUFA9Q16795 KRT76-201ENST00000332411 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
NDUFA9Q16795 ADCY7-203ENST00000537579 2090 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
NDUFA9Q16795 PPHLN1-204ENST00000358314 1643 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
NDUFA9Q16795 STK39-201ENST00000355999 3820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
NDUFA9Q16795 ZNF574-202ENST00000359044 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
NDUFA9Q16795 ELMO1-209ENST00000448602 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
NDUFA9Q16795 DAP-201ENST00000230895 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
NDUFA9Q16795 NOMO1-207ENST00000610363 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
NDUFA9Q16795 PCTP-201ENST00000268896 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
NDUFA9Q16795 IKBIP-201ENST00000299157 3189 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
NDUFA9Q16795 FAM92B-201ENST00000539556 1898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
NDUFA9Q16795 ZNF799-201ENST00000419318 3036 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
NDUFA9Q16795 CAMK2B-208ENST00000395747 1557 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
NDUFA9Q16795 BNIP3P1-202ENST00000550043 1585 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
NDUFA9Q16795 RAD23B-201ENST00000358015 4119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
NDUFA9Q16795 PTPN5-202ENST00000396166 2299 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
NDUFA9Q16795 TRIM27-202ENST00000377199 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
NDUFA9Q16795 ZSCAN2-205ENST00000379358 906 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
NDUFA9Q16795 FOLR3-201ENST00000442948 805 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
NDUFA9Q16795 AL161908.2-201ENST00000457964 394 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
NDUFA9Q16795 SPCS2P1-201ENST00000561636 679 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
NDUFA9Q16795 SSH2-210ENST00000582084 560 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
NDUFA9Q16795 LINC00207-204ENST00000605505 666 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
NDUFA9Q16795 AC073263.1-201ENST00000616370 494 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
NDUFA9Q16795 HOTAIRM1_1.1-201ENST00000622675 125 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
NDUFA9Q16795 ANKK1-201ENST00000303941 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
NDUFA9Q16795 OLA1-202ENST00000344357 1656 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
NDUFA9Q16795 MANSC1-201ENST00000396349 2220 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
NDUFA9Q16795 CD40-207ENST00000620709 1522 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
NDUFA9Q16795 CDIP1-209ENST00000567695 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
NDUFA9Q16795 NPBWR2-201ENST00000369768 1352 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.02
NDUFA9Q16795 TPD52L2-204ENST00000351424 2302 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.02
NDUFA9Q16795 DYRK3-201ENST00000367106 2329 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
NDUFA9Q16795 MAGEA8-201ENST00000286482 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
NDUFA9Q16795 HM13-202ENST00000340852 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
NDUFA9Q16795 ING5-213ENST00000636051 4199 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
NDUFA9Q16795 INA-201ENST00000369849 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
NDUFA9Q16795 ZNF425-201ENST00000378061 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
NDUFA9Q16795 SRGAP2C-201ENST00000304465 1477 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
NDUFA9Q16795 SRGAP2-201ENST00000419187 1477 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
NDUFA9Q16795 SRGAP2B-205ENST00000619678 1477 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
NDUFA9Q16795 H2BFM-201ENST00000355016 1882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
NDUFA9Q16795 CHD4-210ENST00000544040 6514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
NDUFA9Q16795 AXIN2-202ENST00000375702 2541 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
NDUFA9Q16795 TSPEAR-202ENST00000397916 2114 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
NDUFA9Q16795 AC104640.1-201ENST00000562617 2109 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
NDUFA9Q16795 TACR2-203ENST00000619173 1713 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
NDUFA9Q16795 ADSL-220ENST00000636714 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
NDUFA9Q16795 MGRN1-201ENST00000262370 3968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
NDUFA9Q16795 ZBTB7C-204ENST00000586438 4899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
NDUFA9Q16795 DNASE2-201ENST00000222219 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
NDUFA9Q16795 NUDT16-203ENST00000537561 5943 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
NDUFA9Q16795 GDF2-201ENST00000581492 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
NDUFA9Q16795 AC022144.1-201ENST00000602255 1580 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
NDUFA9Q16795 GSAP-201ENST00000257626 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
NDUFA9Q16795 TTLL11-201ENST00000321582 3250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
NDUFA9Q16795 FAM104A-202ENST00000405159 2865 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
NDUFA9Q16795 ASB10-201ENST00000275838 1820 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
NDUFA9Q16795 UAP1L1-202ENST00000409858 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
NDUFA9Q16795 NHS-201ENST00000380060 8761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
NDUFA9Q16795 GRIN2A-201ENST00000330684 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
NDUFA9Q16795 MGME1-202ENST00000377709 1936 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
NDUFA9Q16795 SALL4-203ENST00000395997 1918 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
NDUFA9Q16795 PRICKLE1-211ENST00000639566 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
NDUFA9Q16795 ZNF76-202ENST00000339411 2447 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
NDUFA9Q16795 AC012485.3-201ENST00000637634 2424 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
NDUFA9Q16795 JTB-201ENST00000271843 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
NDUFA9Q16795 LCE5A-201ENST00000334269 819 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
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