Protein–RNA interactions for Protein: Q16518

RPE65, Retinoid isomerohydrolase, humanhuman

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Length 533 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPE65Q16518 IDH3G-212ENST00000619865 1339 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RPE65Q16518 CCDC136-212ENST00000487361 2268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RPE65Q16518 MAGED4-211ENST00000599522 2669 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RPE65Q16518 CENPT-235ENST00000626059 1737 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RPE65Q16518 MANSC1-202ENST00000535902 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RPE65Q16518 COQ8A-202ENST00000366778 2743 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RPE65Q16518 CAPZB-204ENST00000375144 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RPE65Q16518 LINC01215-201ENST00000607746 2592 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RPE65Q16518 NPRL3-201ENST00000399953 2784 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RPE65Q16518 MRPL57-201ENST00000309594 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RPE65Q16518 ATG10-202ENST00000355178 1438 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RPE65Q16518 PPP1R18-206ENST00000615892 1448 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RPE65Q16518 FRA10AC1-201ENST00000359204 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RPE65Q16518 SHQ1-201ENST00000325599 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RPE65Q16518 MDGA1-203ENST00000434837 10736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RPE65Q16518 PCDHGA11-202ENST00000518882 2263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RPE65Q16518 UNC5D-203ENST00000416672 3532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RPE65Q16518 NDRG2-209ENST00000397853 2079 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RPE65Q16518 TRIM9-202ENST00000338969 3312 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RPE65Q16518 PRKD2-216ENST00000601806 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RPE65Q16518 ITGAV-202ENST00000374907 6903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RPE65Q16518 BATF2-201ENST00000301887 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RPE65Q16518 ZNF135-202ENST00000359978 2120 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RPE65Q16518 MFAP2-201ENST00000375534 970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RPE65Q16518 AQP7-204ENST00000379506 1062 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RPE65Q16518 TMEM26-AS1-201ENST00000389640 863 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RPE65Q16518 TMEM176B-202ENST00000429904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RPE65Q16518 DUSP13-205ENST00000464872 684 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RPE65Q16518 PRKAG2-AS1-202ENST00000467458 1064 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RPE65Q16518 C8orf88-201ENST00000517562 894 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RPE65Q16518 AP005018.1-201ENST00000525475 301 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
RPE65Q16518 C11orf98-202ENST00000525675 405 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RPE65Q16518 AC009163.1-201ENST00000530512 573 ntTSL 4 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RPE65Q16518 AP001107.3-201ENST00000534065 544 ntTSL 4 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RPE65Q16518 TMEM101-204ENST00000587529 965 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RPE65Q16518 DUSP13-212ENST00000605915 1015 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RPE65Q16518 AL158212.4-201ENST00000624062 1286 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
RPE65Q16518 AC011270.2-201ENST00000624293 2550 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
RPE65Q16518 FEM1C-201ENST00000274457 5816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RPE65Q16518 TUBA3E-201ENST00000312988 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RPE65Q16518 POMK-203ENST00000614426 1527 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RPE65Q16518 ZMYND12-201ENST00000372565 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RPE65Q16518 DVL1-202ENST00000378891 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RPE65Q16518 RBM33-205ENST00000392759 1580 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RPE65Q16518 SCRN1-205ENST00000425819 1552 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RPE65Q16518 LINC01529-205ENST00000637365 2000 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RPE65Q16518 BTD-207ENST00000449107 1820 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RPE65Q16518 ING4-202ENST00000396807 1393 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RPE65Q16518 PCDHA3-201ENST00000522353 5260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RPE65Q16518 WASHC2C-204ENST00000374362 4623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RPE65Q16518 EPHX2-202ENST00000517536 1600 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RPE65Q16518 DIABLO-208ENST00000464942 2569 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RPE65Q16518 HLF-201ENST00000226067 5547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RPE65Q16518 ARMC5-203ENST00000457010 4844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RPE65Q16518 LRRC57-204ENST00000563454 2407 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RPE65Q16518 AC012485.3-201ENST00000637634 2424 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RPE65Q16518 LINC00221-202ENST00000619530 1499 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RPE65Q16518 JAK3-201ENST00000458235 5432 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RPE65Q16518 TSC2-201ENST00000219476 6156 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RPE65Q16518 MLLT6-210ENST00000620609 2714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RPE65Q16518 DENR-201ENST00000280557 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RPE65Q16518 AQP10-203ENST00000484864 2262 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RPE65Q16518 PLAA-205ENST00000520884 2041 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RPE65Q16518 NEO1-207ENST00000560262 4315 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RPE65Q16518 YBEY-202ENST00000339195 890 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RPE65Q16518 PXMP4-202ENST00000344022 989 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RPE65Q16518 YBEY-203ENST00000397691 764 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RPE65Q16518 EVA1A-203ENST00000410010 696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RPE65Q16518 STMN1-204ENST00000426559 948 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RPE65Q16518 AL161785.3-201ENST00000435157 395 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RPE65Q16518 AC093459.1-202ENST00000438963 768 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RPE65Q16518 MOGAT3-203ENST00000440203 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
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RPE65Q16518 CMC2-214ENST00000565925 640 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RPE65Q16518 RRP7BP-205ENST00000566851 833 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
RPE65Q16518 COMMD4-217ENST00000567195 677 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RPE65Q16518 IFT20-209ENST00000579419 787 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RPE65Q16518 AC008494.3-201ENST00000606615 944 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
RPE65Q16518 AC131235.3-202ENST00000608135 362 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RPE65Q16518 AL391069.4-201ENST00000609583 481 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
RPE65Q16518 C12orf65-201ENST00000253233 2073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RPE65Q16518 MON1B-203ENST00000545553 1814 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RPE65Q16518 CACNA1H-206ENST00000565831 7815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RPE65Q16518 MGRN1-201ENST00000262370 3968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RPE65Q16518 DGKZ-201ENST00000318201 3213 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RPE65Q16518 SCAF1-201ENST00000360565 4306 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RPE65Q16518 PCDHA1-201ENST00000378133 2726 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
RPE65Q16518 CDC42BPG-201ENST00000342711 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RPE65Q16518 EIF4G1-204ENST00000352767 5484 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RPE65Q16518 SAP130-203ENST00000357702 4173 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RPE65Q16518 AP003680.1-201ENST00000598970 3660 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
RPE65Q16518 CALCB-202ENST00000523376 2258 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
RPE65Q16518 AC138969.3-201ENST00000546612 1459 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
RPE65Q16518 AC138932.2-201ENST00000548268 1459 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
RPE65Q16518 AC126755.4-201ENST00000549796 1459 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
RPE65Q16518 RAP1GDS1-203ENST00000380158 2085 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RPE65Q16518 DIRC2-201ENST00000261038 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RPE65Q16518 RDX-201ENST00000343115 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RPE65Q16518 PIEZO1-201ENST00000301015 8072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RPE65Q16518 ANKRD24-202ENST00000318934 3906 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
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