Protein–RNA interactions for Protein: Q15628

TRADD, Tumor necrosis factor receptor type 1-associated DEATH domain protein, humanhuman

Predictions only

Length 312 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRADDQ15628 GPAT2-202ENST00000434632 3061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
TRADDQ15628 ZNF276-201ENST00000289816 4589 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
TRADDQ15628 UGT3A1-204ENST00000507113 1650 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
TRADDQ15628 TRMT2B-201ENST00000372935 2921 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
TRADDQ15628 SYNGR2-207ENST00000590201 2239 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
TRADDQ15628 MARCKS-201ENST00000612661 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
TRADDQ15628 MRPS22-212ENST00000495075 1547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
TRADDQ15628 XRCC1-202ENST00000543982 1994 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
TRADDQ15628 GPAT3-201ENST00000264409 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
TRADDQ15628 FYN-202ENST00000354650 3628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
TRADDQ15628 LPAR5-201ENST00000329858 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
TRADDQ15628 PCCB-204ENST00000462637 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
TRADDQ15628 ISCU-201ENST00000311893 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
TRADDQ15628 KCNAB2-205ENST00000378092 1202 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
TRADDQ15628 CYCS-202ENST00000409409 974 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
TRADDQ15628 SAPCD1-209ENST00000425424 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
TRADDQ15628 AC018712.1-201ENST00000455767 687 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
TRADDQ15628 AC080013.1-203ENST00000468242 720 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
TRADDQ15628 KRT18P34-201ENST00000488218 1270 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
TRADDQ15628 AC073648.2-201ENST00000510116 352 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
TRADDQ15628 MTUS1-215ENST00000519066 567 ntTSL 4 BASIC16.46■□□□□ 0.23
TRADDQ15628 BRICD5-202ENST00000562360 783 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
TRADDQ15628 RMI2-205ENST00000576027 818 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
TRADDQ15628 CD7-202ENST00000578509 925 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
TRADDQ15628 PRR29-207ENST00000580752 458 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
TRADDQ15628 AL445228.2-201ENST00000605589 952 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
TRADDQ15628 AC012313.10-201ENST00000623509 926 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
TRADDQ15628 UBE2I-201ENST00000325437 2832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
TRADDQ15628 N4BP1-201ENST00000262384 7106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
TRADDQ15628 C21orf58-204ENST00000397682 2941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
TRADDQ15628 GOLGA2P9-201ENST00000596977 1937 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
TRADDQ15628 PIGT-246ENST00000639499 2021 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
TRADDQ15628 FOXJ2-201ENST00000162391 5523 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
TRADDQ15628 HPSE-207ENST00000513463 1458 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
TRADDQ15628 SLC38A5-212ENST00000619100 2100 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
TRADDQ15628 SLC38A5-214ENST00000622196 2100 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
TRADDQ15628 AC053503.2-201ENST00000420563 1598 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
TRADDQ15628 PAX6-276ENST00000640684 1557 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
TRADDQ15628 CEP19-202ENST00000409690 2201 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
TRADDQ15628 AC004706.4-201ENST00000634965 3537 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
TRADDQ15628 FLJ16779-201ENST00000612722 7638 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
TRADDQ15628 MGME1-203ENST00000377710 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
TRADDQ15628 PCDH19-202ENST00000373034 9756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
TRADDQ15628 EVPL-201ENST00000301607 6614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
TRADDQ15628 EIF4A1-201ENST00000293831 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
TRADDQ15628 PEPD-202ENST00000397032 1754 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.22
TRADDQ15628 ITSN1-210ENST00000399353 3913 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
TRADDQ15628 AAMP-201ENST00000248450 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
TRADDQ15628 NRBF2-201ENST00000277746 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
TRADDQ15628 INTS14-204ENST00000442903 1863 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.22
TRADDQ15628 PSD-209ENST00000611678 3382 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
TRADDQ15628 NFE2L1-214ENST00000582155 1998 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.22
TRADDQ15628 FAM186B-201ENST00000257894 2944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
TRADDQ15628 PCDHA7-201ENST00000356878 2922 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.46■□□□□ 0.22
TRADDQ15628 PTGES3L-AARSD1-204ENST00000421990 2150 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
TRADDQ15628 FIP1L1-207ENST00000507922 1335 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TRADDQ15628 NR3C1-209ENST00000503201 2594 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TRADDQ15628 CACTIN-203ENST00000429344 3612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TRADDQ15628 SLC26A11-202ENST00000411502 2872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
TRADDQ15628 IL9R-202ENST00000369423 2032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TRADDQ15628 PIP5K1A-202ENST00000368888 2134 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TRADDQ15628 IL21R-AS1-201ENST00000563191 2615 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
TRADDQ15628 ELMSAN1-201ENST00000286523 8091 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TRADDQ15628 STAT1-203ENST00000392323 2723 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
TRADDQ15628 PRKD2-206ENST00000595515 3012 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
TRADDQ15628 PATZ1-204ENST00000405309 3711 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TRADDQ15628 LIM2-201ENST00000221973 983 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TRADDQ15628 TM2D1-201ENST00000294613 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TRADDQ15628 TM2D1-204ENST00000371180 1248 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
TRADDQ15628 LCN8-201ENST00000371688 867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TRADDQ15628 UNC93B7-201ENST00000509439 705 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
TRADDQ15628 BAX-213ENST00000539787 458 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TRADDQ15628 QPRT-203ENST00000562473 579 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
TRADDQ15628 AC009133.1-203ENST00000569039 589 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
TRADDQ15628 LINC00910-203ENST00000587874 544 ntTSL 4 BASIC16.45■□□□□ 0.22
TRADDQ15628 AC022150.1-201ENST00000599222 640 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
TRADDQ15628 TM2D1-212ENST00000606498 969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
TRADDQ15628 GULP1-209ENST00000410051 1595 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TRADDQ15628 GFRA2-208ENST00000524240 4921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TRADDQ15628 C10orf107-201ENST00000330194 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TRADDQ15628 DUSP13-203ENST00000372702 1778 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TRADDQ15628 SPATC1-202ENST00000447830 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TRADDQ15628 AC148477.4-201ENST00000613430 1793 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
TRADDQ15628 STRN-202ENST00000379213 2254 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
TRADDQ15628 SCAMP4-202ENST00000409472 2394 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
TRADDQ15628 MEGF10-206ENST00000508365 2365 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TRADDQ15628 AC079336.5-201ENST00000581360 2480 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
TRADDQ15628 SLC22A7-202ENST00000372585 2555 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
TRADDQ15628 RNFT2-203ENST00000392549 2896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
TRADDQ15628 FAM53B-202ENST00000337318 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TRADDQ15628 TOM1L2-202ENST00000379504 2418 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
TRADDQ15628 CYP26A1-202ENST00000371531 2245 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
TRADDQ15628 GTF3C5-204ENST00000372108 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TRADDQ15628 PCBP4-205ENST00000461554 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TRADDQ15628 FXYD6-201ENST00000260282 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TRADDQ15628 SIRT6-202ENST00000337491 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TRADDQ15628 DYNC1LI2-203ENST00000443351 1502 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
TRADDQ15628 PLTP-204ENST00000420868 1420 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
TRADDQ15628 ATG9B-212ENST00000639579 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TRADDQ15628 SPHK2-202ENST00000340932 2492 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
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