Protein–RNA interactions for Protein: Q15116

PDCD1, Programmed cell death protein 1, humanhuman

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Length 288 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDCD1Q15116 PGBD2-201ENST00000329291 2136 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
PDCD1Q15116 NEK11-210ENST00000510769 2149 ntTSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
PDCD1Q15116 SERHL2-203ENST00000340239 1315 ntTSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
PDCD1Q15116 SALL3-201ENST00000536229 3997 ntTSL 3 BASIC13.67□□□□□ -0.22
PDCD1Q15116 MTRF1L-201ENST00000367230 3431 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
PDCD1Q15116 DNASE2-201ENST00000222219 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
PDCD1Q15116 PGAP2-205ENST00000396993 1566 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
PDCD1Q15116 GPR61-206ENST00000616874 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
PDCD1Q15116 ZNF804B-201ENST00000333190 4659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
PDCD1Q15116 PLTP-204ENST00000420868 1420 ntTSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
PDCD1Q15116 KCP-208ENST00000620378 4515 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
PDCD1Q15116 C10orf107-201ENST00000330194 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
PDCD1Q15116 MFGE8-215ENST00000566497 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
PDCD1Q15116 SERAC1-201ENST00000367101 1907 ntTSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
PDCD1Q15116 C2orf54-202ENST00000388934 1911 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
PDCD1Q15116 SEMA4F-201ENST00000339773 2177 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
PDCD1Q15116 DNAJC2-203ENST00000379263 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
PDCD1Q15116 SHH-201ENST00000297261 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
PDCD1Q15116 SLC2A13-201ENST00000280871 7003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
PDCD1Q15116 ALOX15-205ENST00000574640 2422 ntTSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
PDCD1Q15116 AC021188.1-201ENST00000421534 740 ntTSL 3 BASIC13.67□□□□□ -0.22
PDCD1Q15116 AL645939.2-201ENST00000427340 991 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
PDCD1Q15116 ADH5P3-201ENST00000433842 1137 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
PDCD1Q15116 LINC01143-201ENST00000449073 625 ntTSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
PDCD1Q15116 SPINK2-203ENST00000506738 763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
PDCD1Q15116 SERF1A-207ENST00000512649 846 ntTSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
PDCD1Q15116 AL133467.1-201ENST00000554161 993 ntTSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
PDCD1Q15116 RAMP2-205ENST00000589683 858 ntTSL 3 BASIC13.67□□□□□ -0.22
PDCD1Q15116 AC022145.2-201ENST00000598203 171 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
PDCD1Q15116 AC010503.2-201ENST00000599292 296 ntTSL 3 BASIC13.67□□□□□ -0.22
PDCD1Q15116 AC108010.1-201ENST00000605862 1107 ntTSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
PDCD1Q15116 AC004832.1-201ENST00000610936 1005 ntTSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
PDCD1Q15116 LINC00623-204ENST00000617702 746 ntTSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
PDCD1Q15116 F10-202ENST00000375559 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
PDCD1Q15116 REPIN1-209ENST00000479668 3182 ntTSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
PDCD1Q15116 KMT2E-201ENST00000257745 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
PDCD1Q15116 FAF1-202ENST00000396153 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
PDCD1Q15116 PCDHA4-203ENST00000530339 5251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
PDCD1Q15116 AC105339.1-201ENST00000440089 1362 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
PDCD1Q15116 SCLT1-205ENST00000503401 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.67□□□□□ -0.22
PDCD1Q15116 PRR19-204ENST00000598490 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
PDCD1Q15116 NR4A3-201ENST00000330847 4982 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
PDCD1Q15116 INTS4P1-202ENST00000587624 2985 ntTSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
PDCD1Q15116 TTC6-206ENST00000553443 5833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
PDCD1Q15116 ORAOV1-201ENST00000279147 2478 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
PDCD1Q15116 APAF1-203ENST00000359972 7029 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
PDCD1Q15116 ATP6V0E2-212ENST00000611515 2565 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
PDCD1Q15116 HMGA2-210ENST00000541363 8094 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
PDCD1Q15116 ALOX15B-205ENST00000573359 1809 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
PDCD1Q15116 MAPKAP1-201ENST00000265960 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
PDCD1Q15116 KANK2-201ENST00000586659 5162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
PDCD1Q15116 SNED1-202ENST00000342631 1930 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
PDCD1Q15116 KCTD15-201ENST00000284006 4918 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
PDCD1Q15116 AC092127.1-201ENST00000567093 3455 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
PDCD1Q15116 OASL-204ENST00000620239 1695 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
PDCD1Q15116 SCAP-215ENST00000545718 2950 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
PDCD1Q15116 SLC12A5-209ENST00000616201 2955 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
PDCD1Q15116 EIF4G1-206ENST00000392537 5229 ntTSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
PDCD1Q15116 JAKMIP1-204ENST00000409831 2371 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
PDCD1Q15116 KCNK9-203ENST00000520439 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
PDCD1Q15116 ATP11B-201ENST00000323116 7325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
PDCD1Q15116 SIRT6-203ENST00000594279 1507 ntTSL 3 BASIC13.66□□□□□ -0.22
PDCD1Q15116 PIGT-201ENST00000279035 1880 ntTSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
PDCD1Q15116 ASAH1-249ENST00000637528 2215 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
PDCD1Q15116 DZIP1-204ENST00000376829 3738 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
PDCD1Q15116 TSSC2-204ENST00000529482 2337 ntTSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
PDCD1Q15116 KIAA0895-207ENST00000436884 1952 ntTSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
PDCD1Q15116 C6orf99-202ENST00000367073 769 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
PDCD1Q15116 BLOC1S2-202ENST00000370372 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
PDCD1Q15116 PRUNE2-202ENST00000376713 1069 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
PDCD1Q15116 CRIP1-203ENST00000409393 677 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.66□□□□□ -0.22
PDCD1Q15116 AC004461.1-201ENST00000412461 403 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
PDCD1Q15116 HHATL-AS1-201ENST00000423165 557 ntTSL 4 BASIC13.66□□□□□ -0.22
PDCD1Q15116 AL137003.1-201ENST00000423260 491 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
PDCD1Q15116 OST4-202ENST00000447619 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
PDCD1Q15116 CYMP-203ENST00000474680 1263 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
PDCD1Q15116 SLC30A5-203ENST00000502979 681 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
PDCD1Q15116 AC119403.1-201ENST00000520090 776 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
PDCD1Q15116 RPL8-207ENST00000528957 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
PDCD1Q15116 RFPL4AP1-201ENST00000530883 850 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
PDCD1Q15116 GALNT9-208ENST00000541995 1001 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
PDCD1Q15116 COX14-202ENST00000548985 677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
PDCD1Q15116 OTUB2-202ENST00000553723 708 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
PDCD1Q15116 AL135744.1-201ENST00000565098 629 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
PDCD1Q15116 LINC00668-203ENST00000579012 605 ntTSL 3 BASIC13.66□□□□□ -0.22
PDCD1Q15116 AC005330.1-201ENST00000590086 1238 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
PDCD1Q15116 FHL2-212ENST00000607522 759 ntTSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
PDCD1Q15116 SBK3-202ENST00000612221 1270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
PDCD1Q15116 RAB9A-203ENST00000618931 737 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
PDCD1Q15116 HNRNPH1-250ENST00000630639 123 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
PDCD1Q15116 CYP4F3-202ENST00000585846 2056 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
PDCD1Q15116 ARHGAP45-212ENST00000590577 3218 ntTSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
PDCD1Q15116 NFIC-203ENST00000443272 1716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
PDCD1Q15116 MAP4K1-203ENST00000586296 1363 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
PDCD1Q15116 AC007182.1-201ENST00000455232 2159 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
PDCD1Q15116 SYBU-219ENST00000528647 2995 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
PDCD1Q15116 CES1-202ENST00000361503 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
PDCD1Q15116 NSUN5-203ENST00000428206 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
PDCD1Q15116 PEX5-206ENST00000434354 2253 ntTSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
PDCD1Q15116 FHAD1-205ENST00000375997 1459 ntTSL 3 BASIC13.66□□□□□ -0.22
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