Protein–RNA interactions for Protein: Q14D33

RTP5, Receptor-transporting protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 572 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTP5Q14D33 AIFM3-203ENST00000405089 2333 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
RTP5Q14D33 AKTIP-202ENST00000394657 2426 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
RTP5Q14D33 STOX1-201ENST00000298596 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
RTP5Q14D33 NF2-208ENST00000403435 2568 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
RTP5Q14D33 ASCC2-223ENST00000542393 2594 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
RTP5Q14D33 C17orf100-201ENST00000542475 1756 ntAPPRIS P1 BASIC14.8□□□□□ -0.04
RTP5Q14D33 DDHD1-201ENST00000323669 5503 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
RTP5Q14D33 VILL-207ENST00000465644 1857 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
RTP5Q14D33 ANXA8L1-208ENST00000622769 1861 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
RTP5Q14D33 AL162311.3-201ENST00000555918 2867 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
RTP5Q14D33 SLC44A3-206ENST00000527077 1943 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
RTP5Q14D33 RNF165-204ENST00000587853 2011 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
RTP5Q14D33 MYB-205ENST00000367814 3302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
RTP5Q14D33 FMNL1-201ENST00000328118 2330 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
RTP5Q14D33 LTBP4-205ENST00000396819 4764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
RTP5Q14D33 NEO1-202ENST00000339362 7342 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
RTP5Q14D33 CDC25A-201ENST00000302506 3783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
RTP5Q14D33 YIPF7-201ENST00000332990 937 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
RTP5Q14D33 RGS10-202ENST00000369103 804 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
RTP5Q14D33 AC012506.3-201ENST00000415245 892 ntTSL 3 BASIC14.8□□□□□ -0.04
RTP5Q14D33 POM121L10P-201ENST00000436994 1285 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
RTP5Q14D33 AC129492.3-201ENST00000498285 460 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.8□□□□□ -0.04
RTP5Q14D33 AC025183.2-201ENST00000503386 428 ntTSL 3 BASIC14.8□□□□□ -0.04
RTP5Q14D33 FBXL8-208ENST00000521920 574 ntTSL 4 BASIC14.8□□□□□ -0.04
RTP5Q14D33 AC104241.2-201ENST00000532748 789 ntTSL 3 BASIC14.8□□□□□ -0.04
RTP5Q14D33 GABARAPL1-217ENST00000545887 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.8□□□□□ -0.04
RTP5Q14D33 CHMP4BP1-201ENST00000556017 588 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
RTP5Q14D33 AC110285.1-205ENST00000572301 559 ntTSL 3 BASIC14.8□□□□□ -0.04
RTP5Q14D33 AC068152.1-201ENST00000575930 685 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
RTP5Q14D33 NDUFV2P1-201ENST00000596415 907 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
RTP5Q14D33 LINC00854-216ENST00000636331 718 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
RTP5Q14D33 ARID1B-222ENST00000637003 1290 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
RTP5Q14D33 ZNF416-201ENST00000196489 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
RTP5Q14D33 NTNG1-202ENST00000370065 1485 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
RTP5Q14D33 PBX2-201ENST00000375050 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
RTP5Q14D33 PHF23-202ENST00000454255 1662 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
RTP5Q14D33 IL18BP-204ENST00000393703 1788 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC14.8□□□□□ -0.04
RTP5Q14D33 PABPC1L-217ENST00000537323 1910 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
RTP5Q14D33 BFSP1-205ENST00000536626 2075 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
RTP5Q14D33 CDK11A-203ENST00000357760 2446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
RTP5Q14D33 CDK11A-204ENST00000358779 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
RTP5Q14D33 CDK11A-206ENST00000378638 2429 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
RTP5Q14D33 CDK11A-208ENST00000404249 2449 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
RTP5Q14D33 STX17-205ENST00000525640 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
RTP5Q14D33 AC084018.2-201ENST00000613093 2607 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
RTP5Q14D33 KDM4B-201ENST00000159111 5593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
RTP5Q14D33 PARD3B-206ENST00000462231 2968 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
RTP5Q14D33 RHOF-201ENST00000267205 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
RTP5Q14D33 ADGRB2-212ENST00000527361 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
RTP5Q14D33 FLYWCH1-203ENST00000416288 4963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
RTP5Q14D33 GATAD2A-202ENST00000360315 5671 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
RTP5Q14D33 SLC39A14-201ENST00000240095 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
RTP5Q14D33 EIF2AK4-201ENST00000263791 5499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
RTP5Q14D33 ISG20-201ENST00000306072 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
RTP5Q14D33 XRCC3-201ENST00000352127 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
RTP5Q14D33 MYOZ1-201ENST00000359322 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
RTP5Q14D33 EPM2A-201ENST00000367519 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
RTP5Q14D33 GABARAPL2-201ENST00000037243 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
RTP5Q14D33 CLDN19-202ENST00000372539 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
RTP5Q14D33 PTPRU-202ENST00000373779 5579 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
RTP5Q14D33 CYB5R3-203ENST00000402438 1050 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
RTP5Q14D33 PSTK-202ENST00000405485 1047 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
RTP5Q14D33 AC083949.1-201ENST00000422013 657 ntTSL 3 BASIC14.79□□□□□ -0.04
RTP5Q14D33 AL157902.1-202ENST00000425010 763 ntTSL 3 BASIC14.79□□□□□ -0.04
RTP5Q14D33 LINC01762-204ENST00000434879 436 ntTSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
RTP5Q14D33 GNA13-201ENST00000439174 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
RTP5Q14D33 BMS1P17-203ENST00000444357 552 ntTSL 4 BASIC14.79□□□□□ -0.04
RTP5Q14D33 AP001790.1-201ENST00000511947 570 ntTSL 4 BASIC14.79□□□□□ -0.04
RTP5Q14D33 AC126915.1-201ENST00000522847 1038 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
RTP5Q14D33 LINC02449-203ENST00000536034 451 ntTSL 3 BASIC14.79□□□□□ -0.04
RTP5Q14D33 PDE2A-226ENST00000544570 3119 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
RTP5Q14D33 TBL3-205ENST00000568546 6803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
RTP5Q14D33 MIR4706-201ENST00000582134 82 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
RTP5Q14D33 AP1M1-211ENST00000590756 1705 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
RTP5Q14D33 PSENEN-203ENST00000591949 833 ntTSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
RTP5Q14D33 BMS1P22-203ENST00000609679 552 ntTSL 4 BASIC14.79□□□□□ -0.04
RTP5Q14D33 DIO1-215ENST00000610607 796 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
RTP5Q14D33 AC008894.3-201ENST00000624324 3103 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
RTP5Q14D33 PARD3-206ENST00000374776 3389 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
RTP5Q14D33 PRR18-201ENST00000322583 3084 ntAPPRIS P2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
RTP5Q14D33 SYTL3-203ENST00000367081 2692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
RTP5Q14D33 TLE2-219ENST00000591529 2483 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
RTP5Q14D33 SH2D3C-213ENST00000629203 2478 ntTSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
RTP5Q14D33 ST6GALNAC6-202ENST00000373141 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
RTP5Q14D33 PPP1R16A-202ENST00000435887 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
RTP5Q14D33 CHTOP-203ENST00000368690 2165 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
RTP5Q14D33 ZBTB11-202ENST00000461821 2115 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
RTP5Q14D33 PACRGL-202ENST00000360916 2073 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
RTP5Q14D33 FAM83A-201ENST00000276699 1858 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
RTP5Q14D33 MFSD4A-207ENST00000536357 1841 ntTSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
RTP5Q14D33 TAB1-202ENST00000331454 1660 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
RTP5Q14D33 RASL10B-201ENST00000603017 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
RTP5Q14D33 CYP2U1-202ENST00000508453 3125 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
RTP5Q14D33 ZC2HC1C-202ENST00000439583 1509 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
RTP5Q14D33 PLCB2-202ENST00000456256 4242 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
RTP5Q14D33 SEC13-201ENST00000337354 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
RTP5Q14D33 FRMD4A-203ENST00000357447 6821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
RTP5Q14D33 RGR-201ENST00000358110 1349 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
RTP5Q14D33 KRT8P35-201ENST00000483942 1338 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
RTP5Q14D33 LBX1-AS1-201ENST00000430651 2553 ntTSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.2 ms