Protein–RNA interactions for Protein: Q14973

SLC10A1, Sodium/bile acid cotransporter, humanhuman

Predictions only

Length 349 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC10A1Q14973 SLC44A3-206ENST00000527077 1943 ntTSL 2 BASIC14.38□□□□□ -0.11
SLC10A1Q14973 ASB7-202ENST00000343276 1694 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
SLC10A1Q14973 ACTL9-201ENST00000324436 1426 ntAPPRIS P1 BASIC14.38□□□□□ -0.11
SLC10A1Q14973 GLDC-201ENST00000321612 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
SLC10A1Q14973 HPS1-202ENST00000338546 1580 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
SLC10A1Q14973 COMMD5-203ENST00000450361 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
SLC10A1Q14973 WAC-203ENST00000354911 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
SLC10A1Q14973 SLFNL1-201ENST00000302946 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
SLC10A1Q14973 ELFN2-208ENST00000430883 1970 ntTSL 2 BASIC14.38□□□□□ -0.11
SLC10A1Q14973 REXO1L1P-202ENST00000608646 1974 ntBASIC14.38□□□□□ -0.11
SLC10A1Q14973 TRIM46-209ENST00000543729 1703 ntTSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
SLC10A1Q14973 AP1AR-201ENST00000274000 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
SLC10A1Q14973 GRN-214ENST00000589265 1632 ntTSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
SLC10A1Q14973 MAP3K3-202ENST00000361733 3529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
SLC10A1Q14973 CDK16-202ENST00000357227 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
SLC10A1Q14973 PI16-201ENST00000373674 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
SLC10A1Q14973 MAPK7-201ENST00000299612 2715 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
SLC10A1Q14973 PCBP1-201ENST00000303577 1750 ntAPPRIS P1 BASIC14.37□□□□□ -0.11
SLC10A1Q14973 DIRC2-201ENST00000261038 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
SLC10A1Q14973 SNX31-201ENST00000311812 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.37□□□□□ -0.11
SLC10A1Q14973 AP000787.1-201ENST00000501356 1926 ntTSL 2 BASIC14.37□□□□□ -0.11
SLC10A1Q14973 TMEM30A-201ENST00000230461 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
SLC10A1Q14973 MAGED4-211ENST00000599522 2669 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
SLC10A1Q14973 C12orf10-201ENST00000267103 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
SLC10A1Q14973 TFF2-201ENST00000291526 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
SLC10A1Q14973 BLCAP-202ENST00000397131 633 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.37□□□□□ -0.11
SLC10A1Q14973 BLCAP-203ENST00000397134 566 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.37□□□□□ -0.11
SLC10A1Q14973 IFT74-203ENST00000433700 2119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
SLC10A1Q14973 TMEM247-204ENST00000434431 680 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
SLC10A1Q14973 TARDBPP1-201ENST00000442013 1203 ntBASIC14.37□□□□□ -0.11
SLC10A1Q14973 HMGB2-203ENST00000446922 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
SLC10A1Q14973 RHOA-206ENST00000454011 889 ntTSL 2 BASIC14.37□□□□□ -0.11
SLC10A1Q14973 AC095060.1-201ENST00000502455 549 ntTSL 4 BASIC14.37□□□□□ -0.11
SLC10A1Q14973 COMMD4-217ENST00000567195 677 ntTSL 2 BASIC14.37□□□□□ -0.11
SLC10A1Q14973 AC011499.1-201ENST00000586012 581 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.37□□□□□ -0.11
SLC10A1Q14973 NOP53-AS1-201ENST00000602048 540 ntTSL 4 BASIC14.37□□□□□ -0.11
SLC10A1Q14973 FAM66A-202ENST00000602658 546 ntTSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
SLC10A1Q14973 AC093726.1-201ENST00000608064 963 ntBASIC14.37□□□□□ -0.11
SLC10A1Q14973 MALAT1-213ENST00000618227 593 ntTSL 3 BASIC14.37□□□□□ -0.11
SLC10A1Q14973 PRF1-203ENST00000638674 1080 ntTSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
SLC10A1Q14973 OXA1L-203ENST00000412791 1440 ntTSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
SLC10A1Q14973 NSFL1C-201ENST00000216879 3568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
SLC10A1Q14973 BCAN-202ENST00000361588 2563 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
SLC10A1Q14973 SLC9A5-201ENST00000299798 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
SLC10A1Q14973 CMKLR1-204ENST00000550402 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
SLC10A1Q14973 ALG12-201ENST00000330817 5350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
SLC10A1Q14973 FAM120AOS-201ENST00000375412 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
SLC10A1Q14973 AL731569.1-201ENST00000428940 3058 ntTSL 2 BASIC14.37□□□□□ -0.11
SLC10A1Q14973 TMEM237-202ENST00000409444 5592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
SLC10A1Q14973 GDF11-201ENST00000257868 8657 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
SLC10A1Q14973 URAHP-202ENST00000409873 1349 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
SLC10A1Q14973 RPS28-203ENST00000600659 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
SLC10A1Q14973 LZTR1-201ENST00000215739 4572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
SLC10A1Q14973 CHST10-201ENST00000264249 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
SLC10A1Q14973 UHMK1-202ENST00000489294 8478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
SLC10A1Q14973 ARID4B-202ENST00000349213 5811 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
SLC10A1Q14973 ELFN2-207ENST00000613079 8360 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.37□□□□□ -0.11
SLC10A1Q14973 PNO1-201ENST00000263657 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
SLC10A1Q14973 CYP4B1-203ENST00000371923 2110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
SLC10A1Q14973 AUNIP-201ENST00000374298 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
SLC10A1Q14973 POLR3D-202ENST00000397802 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
SLC10A1Q14973 IDH3G-203ENST00000370093 1662 ntTSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
SLC10A1Q14973 G6PD-203ENST00000393564 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
SLC10A1Q14973 IDH3B-201ENST00000380843 1545 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
SLC10A1Q14973 DZANK1-202ENST00000329494 1389 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
SLC10A1Q14973 ZNF346-202ENST00000503039 2774 ntTSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
SLC10A1Q14973 NEIL2-204ENST00000455213 2323 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
SLC10A1Q14973 WDR6-202ENST00000415265 1883 ntTSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
SLC10A1Q14973 TACR2-203ENST00000619173 1713 ntTSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
SLC10A1Q14973 PPAN-P2RY11-202ENST00000428358 2661 ntTSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
SLC10A1Q14973 AC092850.2-201ENST00000623821 2697 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
SLC10A1Q14973 POLG2-201ENST00000539111 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
SLC10A1Q14973 TAF1B-201ENST00000263663 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
SLC10A1Q14973 MGEA5-203ENST00000370094 3314 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
SLC10A1Q14973 UBE3A-227ENST00000638011 8742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
SLC10A1Q14973 GLUD1-201ENST00000277865 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
SLC10A1Q14973 SS18L2-201ENST00000011691 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
SLC10A1Q14973 THOC7-201ENST00000295899 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
SLC10A1Q14973 VHLL-201ENST00000339922 676 ntAPPRIS P1 BASIC14.36□□□□□ -0.11
SLC10A1Q14973 HOPX-203ENST00000381255 1164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
SLC10A1Q14973 AL161638.1-201ENST00000420354 481 ntTSL 3 BASIC14.36□□□□□ -0.11
SLC10A1Q14973 AC020915.1-202ENST00000427361 922 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
SLC10A1Q14973 ZMYND10-AS1-201ENST00000440013 250 ntTSL 3 BASIC14.36□□□□□ -0.11
SLC10A1Q14973 AC244107.1-201ENST00000442033 332 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
SLC10A1Q14973 RPSAP31-202ENST00000445165 716 ntTSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
SLC10A1Q14973 PRSS48-202ENST00000455694 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
SLC10A1Q14973 HHEX-203ENST00000492654 808 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
SLC10A1Q14973 AP000721.1-201ENST00000535431 559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
SLC10A1Q14973 HOPX-210ENST00000553379 1001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
SLC10A1Q14973 HOPX-212ENST00000555760 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.36□□□□□ -0.11
SLC10A1Q14973 AC005520.2-201ENST00000556194 573 ntTSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
SLC10A1Q14973 HOPX-213ENST00000556376 1064 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.36□□□□□ -0.11
SLC10A1Q14973 LINC01703-202ENST00000602806 595 ntTSL 3 BASIC14.36□□□□□ -0.11
SLC10A1Q14973 LINC01115-203ENST00000606068 577 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
SLC10A1Q14973 PDCD6-212ENST00000614778 1050 ntTSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
SLC10A1Q14973 TMEM127-201ENST00000258439 6266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
SLC10A1Q14973 WDR45B-201ENST00000392325 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
SLC10A1Q14973 PRSS54-204ENST00000567164 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
SLC10A1Q14973 ABCB10-201ENST00000344517 3857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
SLC10A1Q14973 ZDHHC13-202ENST00000446113 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.2 ms