Protein–RNA interactions for Protein: Q14004

CDK13, Cyclin-dependent kinase 13, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,512 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK13Q14004 CALCA-201ENST00000331587 843 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CDK13Q14004 BEX5-201ENST00000333643 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CDK13Q14004 TMEM107-203ENST00000431792 455 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CDK13Q14004 AC044849.1-201ENST00000519737 1188 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
CDK13Q14004 IFITM3-202ENST00000526811 543 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CDK13Q14004 PPP1R32-205ENST00000538185 1107 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CDK13Q14004 PPY2P-201ENST00000582808 702 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
CDK13Q14004 PPY2P-202ENST00000583761 657 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CDK13Q14004 AL358473.2-201ENST00000610411 556 ntTSL 4 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CDK13Q14004 PRRC2B-210ENST00000638390 1084 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CDK13Q14004 MAP7-203ENST00000438100 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CDK13Q14004 NME7-201ENST00000367811 1642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CDK13Q14004 FAN1-207ENST00000565466 2304 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CDK13Q14004 ALOX12-AS1-201ENST00000399540 1730 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CDK13Q14004 SFTA3-204ENST00000518529 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CDK13Q14004 AC020763.4-201ENST00000623414 4170 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
CDK13Q14004 TP53BP2-201ENST00000343537 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CDK13Q14004 ASPRV1-201ENST00000320256 2177 ntAPPRIS P1 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CDK13Q14004 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CDK13Q14004 BOLA3-201ENST00000295326 444 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CDK13Q14004 SDCCAG3P2-201ENST00000326105 1023 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
CDK13Q14004 PRTFDC1-203ENST00000376378 747 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CDK13Q14004 POM121L10P-201ENST00000436994 1285 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
CDK13Q14004 CSAD-208ENST00000444623 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CDK13Q14004 AC078852.2-201ENST00000504748 527 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CDK13Q14004 AC074194.1-201ENST00000505025 622 ntTSL 4 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CDK13Q14004 CHCHD7-211ENST00000521831 573 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CDK13Q14004 ANAPC15-208ENST00000538393 867 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CDK13Q14004 KLK11-210ENST00000600362 759 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CDK13Q14004 STPG3-204ENST00000611378 1015 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CDK13Q14004 ZSWIM4-201ENST00000254323 4339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CDK13Q14004 FES-207ENST00000444422 2266 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CDK13Q14004 KRTAP10-7-201ENST00000609664 1578 ntAPPRIS P1 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CDK13Q14004 TDRKH-204ENST00000368825 2651 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CDK13Q14004 ZNF815P-201ENST00000421890 1352 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CDK13Q14004 CD300C-201ENST00000330793 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CDK13Q14004 DDX42-202ENST00000389924 3939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CDK13Q14004 PHYH-203ENST00000396920 1829 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CDK13Q14004 EZR-202ENST00000367075 3096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CDK13Q14004 KRT73-201ENST00000305748 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CDK13Q14004 CENPBD1P1-204ENST00000487264 1308 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CDK13Q14004 MPDU1-201ENST00000250124 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CDK13Q14004 ATG10-203ENST00000458350 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CDK13Q14004 RGS10-202ENST00000369103 804 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CDK13Q14004 SYVN1-203ENST00000377190 3052 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CDK13Q14004 C9orf24-203ENST00000379126 496 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CDK13Q14004 CRYAA-202ENST00000398132 826 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CDK13Q14004 MCFD2-204ENST00000409207 1113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CDK13Q14004 AL391280.1-201ENST00000506969 1062 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
CDK13Q14004 AC007406.3-201ENST00000537295 1063 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CDK13Q14004 SDR39U1-212ENST00000555365 976 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CDK13Q14004 PRKCSH-205ENST00000587327 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CDK13Q14004 TMEM14B-220ENST00000612333 888 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CDK13Q14004 FP236240.1-204ENST00000624932 712 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CDK13Q14004 AC004834.1-204ENST00000640670 1055 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CDK13Q14004 MAPK14-204ENST00000468133 1376 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CDK13Q14004 C20orf166-AS1-201ENST00000412495 2302 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CDK13Q14004 BTN3A1-204ENST00000425234 1882 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CDK13Q14004 RSBN1-205ENST00000615321 2418 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CDK13Q14004 ZNF746-202ENST00000458143 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CDK13Q14004 LITAF-201ENST00000339430 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CDK13Q14004 PRSS54-201ENST00000219301 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CDK13Q14004 CTSA-202ENST00000354880 1820 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CDK13Q14004 C14orf93-202ENST00000341470 2221 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CDK13Q14004 EIF3G-201ENST00000253108 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CDK13Q14004 AC016700.1-201ENST00000429424 312 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
CDK13Q14004 AC010745.3-201ENST00000439745 415 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CDK13Q14004 BMS1P17-203ENST00000444357 552 ntTSL 4 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CDK13Q14004 HIST2H2BB-201ENST00000449108 381 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
CDK13Q14004 PFN2-205ENST00000461868 613 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CDK13Q14004 TXNDC17-202ENST00000570330 459 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CDK13Q14004 NKG7-204ENST00000595217 816 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CDK13Q14004 BMS1P22-203ENST00000609679 552 ntTSL 4 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CDK13Q14004 AC138627.1-207ENST00000641560 1006 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
CDK13Q14004 LFNG-204ENST00000402045 2058 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CDK13Q14004 PRMT5-203ENST00000397440 1907 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CDK13Q14004 AR-207ENST00000612010 3896 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CDK13Q14004 PRPF31-203ENST00000419967 2269 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CDK13Q14004 CALR-201ENST00000316448 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CDK13Q14004 C2orf54-202ENST00000388934 1911 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CDK13Q14004 MRPS7-201ENST00000245539 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CDK13Q14004 LRRC59-203ENST00000576448 1531 ntBASIC24■■□□□ 1.43
CDK13Q14004 YIPF7-201ENST00000332990 937 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
CDK13Q14004 FAM24B-202ENST00000368898 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CDK13Q14004 FNTAP2-201ENST00000430308 634 ntBASIC24■■□□□ 1.43
CDK13Q14004 AC106786.1-201ENST00000442777 792 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
CDK13Q14004 VGLL4-214ENST00000451674 938 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CDK13Q14004 AC093879.1-201ENST00000508959 1176 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
CDK13Q14004 TMBIM4-205ENST00000535812 766 ntTSL 4 BASIC24■■□□□ 1.43
CDK13Q14004 TMBIM4-212ENST00000556010 610 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
CDK13Q14004 SLC35G4-201ENST00000588001 1017 ntAPPRIS P1 BASIC24■■□□□ 1.43
CDK13Q14004 Z84492.1-201ENST00000606589 408 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
CDK13Q14004 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CDK13Q14004 VASP-201ENST00000245932 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CDK13Q14004 MAGEA2-204ENST00000611674 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
CDK13Q14004 PANK4-201ENST00000378466 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CDK13Q14004 MAGEA2B-201ENST00000331220 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
CDK13Q14004 ACSL1-208ENST00000507295 2490 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
CDK13Q14004 MLLT1-201ENST00000252674 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CDK13Q14004 SPAG6-202ENST00000376603 2770 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.4 ms