Protein–RNA interactions for Protein: Q13951

CBFB, Core-binding factor subunit beta, humanhuman

Predictions only

Length 182 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CBFBQ13951 GPAT2-204ENST00000453542 2466 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
CBFBQ13951 BRF1-201ENST00000327359 2292 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
CBFBQ13951 ERICH5-201ENST00000318528 1761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
CBFBQ13951 PRMT1-217ENST00000532489 1686 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
CBFBQ13951 BCS1L-212ENST00000439945 1483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
CBFBQ13951 SERPINF2-203ENST00000450523 1462 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
CBFBQ13951 CABP2-201ENST00000294288 925 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
CBFBQ13951 LCE1A-201ENST00000335123 422 ntAPPRIS P1 BASIC14.66□□□□□ -0.06
CBFBQ13951 FAM24B-201ENST00000368896 704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
CBFBQ13951 AL513327.2-201ENST00000432703 490 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
CBFBQ13951 FAM172A-207ENST00000509739 1031 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
CBFBQ13951 DAD1-205ENST00000543337 501 ntTSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
CBFBQ13951 CMTM3-205ENST00000562707 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
CBFBQ13951 MRPL34-202ENST00000594999 555 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
CBFBQ13951 ALKBH7-203ENST00000599849 556 ntTSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
CBFBQ13951 AC027612.4-201ENST00000605371 583 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
CBFBQ13951 LAMTOR5-208ENST00000614544 846 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
CBFBQ13951 MIR6080-201ENST00000617359 66 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
CBFBQ13951 LINC00628-201ENST00000628516 1289 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
CBFBQ13951 PCDHA4-203ENST00000530339 5251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
CBFBQ13951 AC021683.3-202ENST00000592572 4440 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
CBFBQ13951 ZFAND6-201ENST00000261749 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
CBFBQ13951 TXNDC2-204ENST00000536353 1703 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
CBFBQ13951 AC005906.2-217ENST00000639573 1711 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
CBFBQ13951 JRK-203ENST00000571961 2687 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
CBFBQ13951 OSBPL3-201ENST00000313367 6760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
CBFBQ13951 CNPY4-201ENST00000262932 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
CBFBQ13951 ZBTB45P2-201ENST00000452245 1531 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
CBFBQ13951 HDAC5-202ENST00000336057 5040 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
CBFBQ13951 SCLT1-208ENST00000506368 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CBFBQ13951 H2AFY-202ENST00000312469 1859 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
CBFBQ13951 LILRB5-202ENST00000345866 1864 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
CBFBQ13951 CARD10-201ENST00000251973 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CBFBQ13951 PEPD-202ENST00000397032 1754 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
CBFBQ13951 NAPA-AS1-201ENST00000593284 1753 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
CBFBQ13951 LOXL3-203ENST00000409249 2431 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
CBFBQ13951 RASGRP2-201ENST00000354024 2310 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CBFBQ13951 LONRF3-203ENST00000422289 2898 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
CBFBQ13951 SLC35E2B-203ENST00000611123 5948 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
CBFBQ13951 CD1E-212ENST00000368167 1458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CBFBQ13951 SLC3A2-208ENST00000536981 1486 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
CBFBQ13951 FAM8A1-201ENST00000259963 4677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CBFBQ13951 GK2-201ENST00000358842 1942 ntAPPRIS P1 BASIC14.65□□□□□ -0.06
CBFBQ13951 RSPO1-203ENST00000612451 2463 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CBFBQ13951 RPL21-203ENST00000319826 806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
CBFBQ13951 PRSS55-201ENST00000328655 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CBFBQ13951 IZUMO4-201ENST00000395296 869 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
CBFBQ13951 CEP19-201ENST00000399942 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
CBFBQ13951 SNHG11-207ENST00000434729 1058 ntTSL 4 BASIC14.65□□□□□ -0.06
CBFBQ13951 PSMB5-204ENST00000460922 729 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
CBFBQ13951 AC129926.1-201ENST00000581944 614 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
CBFBQ13951 RAB34-224ENST00000636513 888 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
CBFBQ13951 FEN1-201ENST00000305885 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CBFBQ13951 LFNG-205ENST00000402506 2268 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
CBFBQ13951 PIK3R6-203ENST00000614407 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CBFBQ13951 AC141586.1-201ENST00000399702 2748 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CBFBQ13951 MYCBPAP-201ENST00000323776 3186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CBFBQ13951 ADCY7-203ENST00000537579 2090 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
CBFBQ13951 HYAL1-201ENST00000266031 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CBFBQ13951 DNAJC5-201ENST00000360864 5213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CBFBQ13951 AC092384.3-202ENST00000564646 2873 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
CBFBQ13951 AC012485.3-201ENST00000637634 2424 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
CBFBQ13951 PIP4K2C-207ENST00000550465 1532 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
CBFBQ13951 YARS-201ENST00000373477 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CBFBQ13951 CAAP1-201ENST00000333916 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CBFBQ13951 ITSN1-212ENST00000399367 5722 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CBFBQ13951 CACFD1-201ENST00000291722 2688 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
CBFBQ13951 MAP4K1-208ENST00000589130 2654 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
CBFBQ13951 PTOV1-219ENST00000601638 1413 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
CBFBQ13951 AC105202.1-204ENST00000502167 1781 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CBFBQ13951 SLC43A2-204ENST00000571650 3261 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CBFBQ13951 GHDC-207ENST00000587427 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.07
CBFBQ13951 CKAP4-201ENST00000378026 3093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CBFBQ13951 RGS7-203ENST00000366564 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CBFBQ13951 ARHGEF1-204ENST00000378152 2986 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CBFBQ13951 CRK-202ENST00000398970 3675 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CBFBQ13951 COLEC11-209ENST00000418971 1595 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CBFBQ13951 TFPI2-201ENST00000222543 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CBFBQ13951 PIPOX-201ENST00000323372 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CBFBQ13951 TAF1D-203ENST00000448108 2082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CBFBQ13951 ZNF382-202ENST00000423582 2657 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CBFBQ13951 RNF34-202ENST00000392464 1722 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CBFBQ13951 AL136982.4-201ENST00000437689 1740 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
CBFBQ13951 NTRK3-202ENST00000355254 2938 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CBFBQ13951 MECR-201ENST00000263702 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CBFBQ13951 AL035456.1-201ENST00000456064 1369 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
CBFBQ13951 ATP6V0E2-212ENST00000611515 2565 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CBFBQ13951 MCF2L-232ENST00000535094 3752 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CBFBQ13951 MRPL57-201ENST00000309594 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CBFBQ13951 PAGE5-201ENST00000289619 741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CBFBQ13951 HSD17B8-203ENST00000374662 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CBFBQ13951 AC007388.1-210ENST00000415640 458 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CBFBQ13951 TSEN15P1-201ENST00000423257 515 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
CBFBQ13951 SSNA1-204ENST00000464553 723 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CBFBQ13951 AC069503.2-201ENST00000546333 576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CBFBQ13951 AC243965.1-201ENST00000557595 781 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CBFBQ13951 AC105021.1-202ENST00000570572 669 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
CBFBQ13951 AC007967.4-201ENST00000614700 386 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
CBFBQ13951 AL157832.3-201ENST00000635764 1005 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CBFBQ13951 SLC17A3-202ENST00000360657 1750 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.4 ms