Protein–RNA interactions for Protein: Q13702

RAPSN, 43 kDa receptor-associated protein of the synapse, humanhuman

Predictions only

Length 412 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAPSNQ13702 AF228730.8-201ENST00000642140 221 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
RAPSNQ13702 TERF1-201ENST00000276602 3268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RAPSNQ13702 TIA1-206ENST00000445587 1440 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
RAPSNQ13702 CUL3-202ENST00000344951 6592 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
RAPSNQ13702 NR4A3-202ENST00000338488 2588 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RAPSNQ13702 AC010931.2-202ENST00000514871 2566 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RAPSNQ13702 AC018716.2-201ENST00000528390 2597 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
RAPSNQ13702 SLC9A7-205ENST00000616978 10024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RAPSNQ13702 SLC2A13-201ENST00000280871 7003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RAPSNQ13702 BMP7-201ENST00000395863 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RAPSNQ13702 TUBGCP2-204ENST00000417178 4029 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
RAPSNQ13702 SQSTM1-213ENST00000510187 1714 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
RAPSNQ13702 NIN-203ENST00000382041 6496 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RAPSNQ13702 TRIP10-201ENST00000313244 2153 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RAPSNQ13702 NBPF9-207ENST00000615421 5835 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
RAPSNQ13702 KIFC3-205ENST00000540079 2781 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
RAPSNQ13702 ZFAND6-207ENST00000558494 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RAPSNQ13702 NORAD-201ENST00000565493 5339 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
RAPSNQ13702 SLC34A1-204ENST00000512593 1912 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
RAPSNQ13702 RBM14-201ENST00000310137 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RAPSNQ13702 UNC13A-204ENST00000550896 5200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
RAPSNQ13702 EIF4G1-209ENST00000414031 5569 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RAPSNQ13702 DHFR-201ENST00000439211 3917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RAPSNQ13702 PA2G4-201ENST00000303305 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RAPSNQ13702 IRF5-215ENST00000619830 1652 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RAPSNQ13702 RAD1-208ENST00000628399 1678 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RAPSNQ13702 GATB-209ENST00000512306 1519 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RAPSNQ13702 MBNL1-202ENST00000282488 6458 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RAPSNQ13702 KIF3A-202ENST00000378746 6325 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RAPSNQ13702 NUP58-201ENST00000381718 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RAPSNQ13702 RHOC-201ENST00000285735 2199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RAPSNQ13702 ARMC6-203ENST00000392336 1866 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RAPSNQ13702 TBL2-205ENST00000432538 1573 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RAPSNQ13702 EXD3-203ENST00000465160 1585 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RAPSNQ13702 ALDH3A1-212ENST00000494157 1572 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RAPSNQ13702 NFIC-210ENST00000590282 1558 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RAPSNQ13702 LRRC57-202ENST00000397130 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RAPSNQ13702 SLC4A2-214ENST00000485713 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RAPSNQ13702 CD8B-201ENST00000331469 832 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RAPSNQ13702 SUMO1-201ENST00000392244 831 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RAPSNQ13702 SUMO1-209ENST00000409712 761 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RAPSNQ13702 PLA2G16-203ENST00000415826 1099 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RAPSNQ13702 AL158071.2-201ENST00000423380 815 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RAPSNQ13702 AC007405.3-202ENST00000426475 660 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RAPSNQ13702 IL32-206ENST00000440815 920 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RAPSNQ13702 IL32-207ENST00000444393 892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RAPSNQ13702 AC027369.6-201ENST00000525520 931 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
RAPSNQ13702 IL32-219ENST00000531965 746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RAPSNQ13702 IL32-226ENST00000548476 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RAPSNQ13702 PRR29-209ENST00000582540 967 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RAPSNQ13702 TNFRSF13B-206ENST00000583789 859 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RAPSNQ13702 PLA2G16-206ENST00000639271 957 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RAPSNQ13702 AL139011.1-202ENST00000642063 584 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
RAPSNQ13702 ANKMY1-207ENST00000403283 2874 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RAPSNQ13702 LARP6-201ENST00000299213 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RAPSNQ13702 UROC1-202ENST00000383579 2735 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RAPSNQ13702 ARHGAP9-201ENST00000393791 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RAPSNQ13702 PAK2-201ENST00000327134 6139 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RAPSNQ13702 ATP2A3-205ENST00000397041 4675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RAPSNQ13702 PIPOX-201ENST00000323372 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RAPSNQ13702 KRT73-201ENST00000305748 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RAPSNQ13702 AADAT-201ENST00000337664 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RAPSNQ13702 FADS3-207ENST00000527697 1640 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RAPSNQ13702 TRAPPC3-210ENST00000617904 1305 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RAPSNQ13702 SLC6A13-201ENST00000343164 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RAPSNQ13702 SMC4-204ENST00000462787 5033 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RAPSNQ13702 CCNA1-203ENST00000625767 1699 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RAPSNQ13702 ZNF514-201ENST00000295208 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RAPSNQ13702 MLKL-202ENST00000308807 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RAPSNQ13702 ARSE-206ENST00000545496 2506 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RAPSNQ13702 TAS1R1-201ENST00000333172 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RAPSNQ13702 RPS5-202ENST00000596046 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RAPSNQ13702 FAM53B-202ENST00000337318 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RAPSNQ13702 HYAL2-208ENST00000447092 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RAPSNQ13702 NOTO-201ENST00000398468 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RAPSNQ13702 NPM2-203ENST00000397940 1874 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RAPSNQ13702 BCL2L12-203ENST00000441864 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RAPSNQ13702 PPP1R21-201ENST00000281394 3137 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RAPSNQ13702 NTRK3-203ENST00000357724 2980 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RAPSNQ13702 TMEM139-205ENST00000410004 2114 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RAPSNQ13702 AIFM2-201ENST00000307864 3243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RAPSNQ13702 ARHGAP45-212ENST00000590577 3218 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RAPSNQ13702 MGEA5-201ENST00000357797 3263 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RAPSNQ13702 GUK1-210ENST00000391865 990 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RAPSNQ13702 TAS2R41-201ENST00000408916 924 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RAPSNQ13702 ZC3H12D-202ENST00000409948 753 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RAPSNQ13702 AC008443.3-201ENST00000412295 549 ntTSL 4 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RAPSNQ13702 AC016735.2-201ENST00000438736 569 ntTSL 4 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RAPSNQ13702 PSMB5-204ENST00000460922 729 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RAPSNQ13702 INS-205ENST00000512523 297 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RAPSNQ13702 ERGIC1-212ENST00000523291 586 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RAPSNQ13702 TATDN3-212ENST00000530441 492 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RAPSNQ13702 CHMP4A-204ENST00000530996 967 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RAPSNQ13702 AC012645.4-201ENST00000610691 1061 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
RAPSNQ13702 TMEM265-201ENST00000615541 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RAPSNQ13702 CALHM2-202ENST00000369788 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RAPSNQ13702 SEPT8-205ENST00000378701 1817 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RAPSNQ13702 FBXL12-206ENST00000588922 1843 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RAPSNQ13702 SLC29A2-207ENST00000619145 2380 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RAPSNQ13702 AQP1-201ENST00000311813 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
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