Protein–RNA interactions for Protein: Q13449

LSAMP, Limbic system-associated membrane protein, humanhuman

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Length 338 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LSAMPQ13449 IGLL1-201ENST00000249053 716 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
LSAMPQ13449 TBPL1-203ENST00000367871 808 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
LSAMPQ13449 IGHGP-201ENST00000390555 1178 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
LSAMPQ13449 DDT-202ENST00000398344 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
LSAMPQ13449 DDT-203ENST00000403754 569 ntTSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
LSAMPQ13449 PAX3-208ENST00000409828 1254 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
LSAMPQ13449 DDT-206ENST00000430101 573 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
LSAMPQ13449 AC099329.3-201ENST00000431549 602 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.54□□□□□ -0.08
LSAMPQ13449 SAPCD2P2-201ENST00000431719 1174 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
LSAMPQ13449 LBX1-AS1-203ENST00000454527 740 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
LSAMPQ13449 MOK-234ENST00000524370 1165 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
LSAMPQ13449 IFI27L1-206ENST00000554562 571 ntTSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
LSAMPQ13449 STK25P1-201ENST00000585406 838 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
LSAMPQ13449 POMC-204ENST00000405623 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
LSAMPQ13449 ACY1-206ENST00000476351 1409 ntTSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
LSAMPQ13449 TEAD2-203ENST00000539846 1444 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
LSAMPQ13449 TMEM222-210ENST00000608611 1511 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
LSAMPQ13449 AC126335.2-201ENST00000623362 4637 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
LSAMPQ13449 KIAA0391-202ENST00000321130 1589 ntTSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
LSAMPQ13449 AL512625.3-203ENST00000445604 1602 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
LSAMPQ13449 ZCCHC17-202ENST00000373714 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
LSAMPQ13449 ISPD-201ENST00000399310 1709 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
LSAMPQ13449 GPAA1P2-202ENST00000606848 1787 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
LSAMPQ13449 CUL7-203ENST00000535468 5504 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
LSAMPQ13449 VAC14-AS1-201ENST00000398177 2145 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
LSAMPQ13449 DUS4L-201ENST00000265720 2220 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
LSAMPQ13449 ILDR1-202ENST00000344209 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
LSAMPQ13449 SLC35C2-203ENST00000372227 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
LSAMPQ13449 VPS26A-201ENST00000263559 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
LSAMPQ13449 EGR2-202ENST00000411732 2824 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
LSAMPQ13449 MAP3K12-203ENST00000547035 2944 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
LSAMPQ13449 CATSPERE-201ENST00000366531 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
LSAMPQ13449 SLC16A9-202ENST00000395348 4178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
LSAMPQ13449 AXL-201ENST00000301178 4737 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
LSAMPQ13449 UBXN2B-201ENST00000399598 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
LSAMPQ13449 TBC1D24-207ENST00000627285 4382 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
LSAMPQ13449 RASA3-201ENST00000334062 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
LSAMPQ13449 GLUL-203ENST00000339526 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
LSAMPQ13449 TNK1-207ENST00000576812 3023 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
LSAMPQ13449 CARHSP1-217ENST00000611932 2833 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.53□□□□□ -0.08
LSAMPQ13449 ANKRD20A19P-202ENST00000442969 2796 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
LSAMPQ13449 DTD2-201ENST00000310850 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
LSAMPQ13449 TBL3-208ENST00000615855 2472 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
LSAMPQ13449 EXO5-201ENST00000296380 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
LSAMPQ13449 CDK20-202ENST00000336654 2176 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
LSAMPQ13449 ZPBP2-202ENST00000377940 2177 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
LSAMPQ13449 MCM7-202ENST00000343023 1968 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
LSAMPQ13449 CDCA3-207ENST00000538862 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
LSAMPQ13449 CYB5D1-203ENST00000571846 1870 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
LSAMPQ13449 CELF2-206ENST00000608830 1892 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
LSAMPQ13449 PPM1F-202ENST00000397495 1778 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
LSAMPQ13449 C11orf16-202ENST00000525780 1685 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
LSAMPQ13449 PRICKLE4-204ENST00000458694 1646 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
LSAMPQ13449 TBC1D3P5-201ENST00000579401 1545 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
LSAMPQ13449 KRT8P39-201ENST00000396270 1433 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
LSAMPQ13449 ZACN-201ENST00000334586 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
LSAMPQ13449 SYN2-205ENST00000620175 3871 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
LSAMPQ13449 NUDT8-201ENST00000301490 809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
LSAMPQ13449 ATP6V0C-201ENST00000330398 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
LSAMPQ13449 SFTPD-201ENST00000372292 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
LSAMPQ13449 RPS9-203ENST00000391752 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
LSAMPQ13449 FAM210CP-201ENST00000445714 574 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
LSAMPQ13449 AC127526.4-201ENST00000527970 983 ntTSL 3 BASIC14.53□□□□□ -0.08
LSAMPQ13449 ISCU-208ENST00000539593 1071 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
LSAMPQ13449 CLN6-204ENST00000564752 900 ntTSL 3 BASIC14.53□□□□□ -0.08
LSAMPQ13449 NAA38-203ENST00000575071 553 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
LSAMPQ13449 AC020911.2-202ENST00000588945 593 ntTSL 3 BASIC14.53□□□□□ -0.08
LSAMPQ13449 GPR32P1-201ENST00000601788 811 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
LSAMPQ13449 GXYLT1P4-201ENST00000613576 1192 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
LSAMPQ13449 CLN6-214ENST00000636314 442 ntTSL 3 BASIC14.53□□□□□ -0.08
LSAMPQ13449 METTL13-202ENST00000362019 3022 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
LSAMPQ13449 RCAN3-202ENST00000374395 6802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
LSAMPQ13449 ACADM-202ENST00000370841 2619 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
LSAMPQ13449 RCBTB2-205ENST00000544492 2622 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
LSAMPQ13449 GRIN3A-201ENST00000361820 7770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
LSAMPQ13449 AKNA-204ENST00000374075 5038 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
LSAMPQ13449 PAF1-201ENST00000221265 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
LSAMPQ13449 INF2-203ENST00000392634 4672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
LSAMPQ13449 WDR59-201ENST00000262144 5898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
LSAMPQ13449 RBP1-203ENST00000483943 1935 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
LSAMPQ13449 RPRD1A-201ENST00000357384 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
LSAMPQ13449 DDX49-201ENST00000247003 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
LSAMPQ13449 COTL1-201ENST00000262428 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
LSAMPQ13449 COMMD6-203ENST00000377615 1793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
LSAMPQ13449 KRT4-204ENST00000551956 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
LSAMPQ13449 PELP1-202ENST00000436683 3524 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.08
LSAMPQ13449 ATP4B-201ENST00000335288 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
LSAMPQ13449 MED25-212ENST00000618715 1467 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
LSAMPQ13449 PDHX-201ENST00000227868 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
LSAMPQ13449 PSMC3IP-202ENST00000393795 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
LSAMPQ13449 NMUR1-201ENST00000305141 3298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
LSAMPQ13449 PITPNM1-216ENST00000534749 4189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
LSAMPQ13449 TTC28-AS1-219ENST00000454741 5064 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
LSAMPQ13449 CEP170B-203ENST00000453495 6813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
LSAMPQ13449 SLC9A3P3-201ENST00000457608 2229 ntBASIC14.52□□□□□ -0.08
LSAMPQ13449 VPS37D-202ENST00000451519 1303 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
LSAMPQ13449 HVCN1-202ENST00000356742 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
LSAMPQ13449 JRK-209ENST00000612905 9124 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.08
LSAMPQ13449 USP10-201ENST00000219473 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
LSAMPQ13449 C20orf196-201ENST00000303142 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
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