Protein–RNA interactions for Protein: Q12923

PTPN13, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 13, humanhuman

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Length 2,485 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPN13Q12923 BX537318.1-201ENST00000608290 1207 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
PTPN13Q12923 NDUFB5-216ENST00000611971 951 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
PTPN13Q12923 HAPLN4-201ENST00000291481 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
PTPN13Q12923 TUBB8-201ENST00000561967 1413 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
PTPN13Q12923 COPS7A-215ENST00000543155 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
PTPN13Q12923 HIPK1-207ENST00000369561 3777 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
PTPN13Q12923 PHGDH-202ENST00000369409 1882 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
PTPN13Q12923 BOC-212ENST00000485230 2173 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
PTPN13Q12923 GPAA1P2-202ENST00000606848 1787 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
PTPN13Q12923 ANKS3-201ENST00000304283 2662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
PTPN13Q12923 KLK6-201ENST00000310157 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
PTPN13Q12923 AL138781.2-201ENST00000617896 1843 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
PTPN13Q12923 BICD1-207ENST00000551848 1962 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
PTPN13Q12923 RPL39L-201ENST00000296277 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
PTPN13Q12923 OR9I1-201ENST00000302610 945 ntAPPRIS P1 BASIC13.57□□□□□ -0.24
PTPN13Q12923 CACNG5-201ENST00000307139 926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
PTPN13Q12923 SMAGP-202ENST00000398453 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
PTPN13Q12923 FOS-204ENST00000554617 796 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
PTPN13Q12923 AF111167.2-202ENST00000558267 599 ntTSL 4 BASIC13.57□□□□□ -0.24
PTPN13Q12923 AL031282.1-201ENST00000577672 409 ntTSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
PTPN13Q12923 IRF3-215ENST00000596822 823 ntTSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
PTPN13Q12923 U82695.1-201ENST00000635752 1889 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
PTPN13Q12923 PRRC2B-210ENST00000638390 1084 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
PTPN13Q12923 LGI4-201ENST00000310123 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
PTPN13Q12923 EML3-217ENST00000531557 2509 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
PTPN13Q12923 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
PTPN13Q12923 ACTA1-202ENST00000366684 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
PTPN13Q12923 OBSL1-203ENST00000373876 5503 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
PTPN13Q12923 KIAA0319L-201ENST00000325722 4789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
PTPN13Q12923 TRMT1-203ENST00000437766 2263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
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PTPN13Q12923 HOXA2-201ENST00000222718 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
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PTPN13Q12923 SNN-201ENST00000329565 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
PTPN13Q12923 MRS2-202ENST00000378353 1740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
PTPN13Q12923 IKZF4-206ENST00000547791 1712 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
PTPN13Q12923 AC245123.1-202ENST00000612422 1719 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
PTPN13Q12923 ZNF280D-205ENST00000559000 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
PTPN13Q12923 THOC5-202ENST00000397871 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
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PTPN13Q12923 PRSS54-204ENST00000567164 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
PTPN13Q12923 PPIE-202ENST00000356511 1079 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
PTPN13Q12923 C1orf53-201ENST00000367393 588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
PTPN13Q12923 FAM27C-201ENST00000377542 616 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
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PTPN13Q12923 AC104333.4-201ENST00000632866 554 ntTSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
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PTPN13Q12923 OPRK1-205ENST00000612786 5196 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
PTPN13Q12923 NDUFS2-201ENST00000367993 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
PTPN13Q12923 MRPS30-202ENST00000507110 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
PTPN13Q12923 TLE4-206ENST00000376552 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
PTPN13Q12923 ALDH1A2-201ENST00000249750 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
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PTPN13Q12923 ZFP90-203ENST00000563169 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
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PTPN13Q12923 TADA3-201ENST00000301964 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
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PTPN13Q12923 MPV17-205ENST00000402310 906 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
PTPN13Q12923 TREX1-202ENST00000444177 1200 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
PTPN13Q12923 TUBB8P8-201ENST00000458717 1058 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
PTPN13Q12923 NME2-204ENST00000503064 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
PTPN13Q12923 MRPS36-204ENST00000512880 1200 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
PTPN13Q12923 ANAPC11-221ENST00000584314 559 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
PTPN13Q12923 RPL17P45-201ENST00000586289 509 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
PTPN13Q12923 AP001029.1-201ENST00000589843 168 ntTSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
PTPN13Q12923 AC009264.1-206ENST00000592183 534 ntTSL 4 BASIC13.56□□□□□ -0.24
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PTPN13Q12923 AGER-206ENST00000375070 1463 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
PTPN13Q12923 AGER-208ENST00000438221 1493 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
PTPN13Q12923 CXXC1P1-201ENST00000483225 1897 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
PTPN13Q12923 CHPF-203ENST00000535926 2634 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
PTPN13Q12923 LINC02537-201ENST00000635943 1367 ntTSL 4 BASIC13.56□□□□□ -0.24
PTPN13Q12923 PPP2R2C-209ENST00000515571 1832 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
PTPN13Q12923 C20orf202-201ENST00000400633 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
PTPN13Q12923 NPR3-204ENST00000434067 2715 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
PTPN13Q12923 DVL2-201ENST00000005340 3018 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
PTPN13Q12923 EGFL6-202ENST00000380602 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
PTPN13Q12923 KCTD12-201ENST00000377474 6225 ntAPPRIS P1 BASIC13.56□□□□□ -0.24
PTPN13Q12923 SNAP47-213ENST00000617596 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
PTPN13Q12923 RIC8B-203ENST00000392839 2440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
PTPN13Q12923 SUMF2-210ENST00000437307 947 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
PTPN13Q12923 SOX9-AS1-207ENST00000446332 443 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
PTPN13Q12923 BUD31-205ENST00000456893 512 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
PTPN13Q12923 DUSP13-205ENST00000464872 684 ntTSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
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