Protein–RNA interactions for Protein: Q12792

TWF1, Twinfilin-1, humanhuman

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Length 350 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TWF1Q12792 SHBG-212ENST00000575314 1146 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
TWF1Q12792 AC079336.1-201ENST00000583156 420 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
TWF1Q12792 FAM171B-202ENST00000612606 940 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
TWF1Q12792 RPSAP52-203ENST00000622976 1023 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
TWF1Q12792 CU634019.7-201ENST00000624153 1185 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
TWF1Q12792 FP236241.2-201ENST00000624906 1185 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
TWF1Q12792 LINC00599-203ENST00000519461 2922 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
TWF1Q12792 SGSH-203ENST00000570923 1546 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
TWF1Q12792 TERT-202ENST00000334602 3210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
TWF1Q12792 SEPT8-204ENST00000378699 2289 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
TWF1Q12792 EIF3K-203ENST00000545173 1327 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
TWF1Q12792 PPP1R16B-201ENST00000299824 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
TWF1Q12792 KRT27-201ENST00000301656 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
TWF1Q12792 C1QTNF1-202ENST00000339142 3100 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
TWF1Q12792 CFLAR-205ENST00000342795 1613 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
TWF1Q12792 SLC25A46-201ENST00000355943 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
TWF1Q12792 KLK3-202ENST00000360617 1664 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
TWF1Q12792 AL158154.2-201ENST00000585776 2208 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
TWF1Q12792 EPHA8-201ENST00000166244 4943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
TWF1Q12792 ABHD11-201ENST00000222800 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
TWF1Q12792 PLXDC2-202ENST00000377242 2822 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
TWF1Q12792 AL662844.4-201ENST00000606367 2838 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
TWF1Q12792 TPCN1-201ENST00000335509 5274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
TWF1Q12792 KL-201ENST00000380099 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
TWF1Q12792 ZNF786-201ENST00000316286 3144 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
TWF1Q12792 SOX14-201ENST00000306087 2055 ntAPPRIS P1 BASIC16.62■□□□□ 0.25
TWF1Q12792 STK4-AS1-201ENST00000434401 2065 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
TWF1Q12792 TUBA3E-201ENST00000312988 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
TWF1Q12792 AMT-232ENST00000636199 1546 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
TWF1Q12792 HPN-201ENST00000262626 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
TWF1Q12792 PPAN-P2RY11-202ENST00000428358 2661 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
TWF1Q12792 PRPF31-201ENST00000321030 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
TWF1Q12792 AP000317.2-201ENST00000362077 641 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
TWF1Q12792 EIF1AX-201ENST00000379593 765 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
TWF1Q12792 AC017116.1-201ENST00000445938 708 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
TWF1Q12792 CGB8-201ENST00000448456 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
TWF1Q12792 AC084864.1-201ENST00000496217 305 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
TWF1Q12792 ATXN2-AS-201ENST00000547021 485 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
TWF1Q12792 NAA38-206ENST00000576384 424 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
TWF1Q12792 TUBB6-203ENST00000586653 788 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
TWF1Q12792 GADD45B-204ENST00000587345 765 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
TWF1Q12792 TXNL4A-212ENST00000592957 546 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
TWF1Q12792 BRI3BPP1-201ENST00000594224 787 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
TWF1Q12792 FLT3LG-205ENST00000596435 1034 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
TWF1Q12792 ZNF83-215ENST00000600714 810 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
TWF1Q12792 ABBA01031660.1-201ENST00000635219 756 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
TWF1Q12792 C1RL-210ENST00000544702 1569 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
TWF1Q12792 AL607033.1-201ENST00000623900 1599 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
TWF1Q12792 NR6A1-205ENST00000487099 7031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
TWF1Q12792 MAP4-202ENST00000360240 5142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
TWF1Q12792 ANKRD35-202ENST00000544626 3093 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
TWF1Q12792 SEPT9-202ENST00000423034 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
TWF1Q12792 CCNY-202ENST00000339497 4630 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
TWF1Q12792 MARK2-209ENST00000509502 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
TWF1Q12792 PPM1E-201ENST00000308249 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
TWF1Q12792 ATP6AP2-215ENST00000636409 1962 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
TWF1Q12792 KCNQ2-209ENST00000625514 2925 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
TWF1Q12792 MMP17-206ENST00000535291 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
TWF1Q12792 FAM156B-207ENST00000616419 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
TWF1Q12792 FAM156A-212ENST00000617970 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
TWF1Q12792 IL11RA-202ENST00000441545 1700 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
TWF1Q12792 SIPA1-201ENST00000394224 3628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
TWF1Q12792 CLIC5-202ENST00000339561 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
TWF1Q12792 ATG10-202ENST00000355178 1438 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
TWF1Q12792 UNG-201ENST00000242576 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
TWF1Q12792 ONECUT1-201ENST00000305901 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
TWF1Q12792 CCDC43-202ENST00000457422 2058 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
TWF1Q12792 SNRPD3-201ENST00000215829 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
TWF1Q12792 AKTIP-202ENST00000394657 2426 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
TWF1Q12792 ZDHHC13-202ENST00000446113 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
TWF1Q12792 AC099398.1-201ENST00000567919 2776 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
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TWF1Q12792 AC133785.1-201ENST00000429282 2824 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
TWF1Q12792 ETV7-201ENST00000339796 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
TWF1Q12792 CDPF1-204ENST00000404744 1541 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
TWF1Q12792 SIGLEC6-205ENST00000425629 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
TWF1Q12792 METTL17-202ENST00000382985 1586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
TWF1Q12792 CEACAM16-201ENST00000405314 1583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
TWF1Q12792 XKR7-201ENST00000562532 7844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
TWF1Q12792 RPL18A-201ENST00000222247 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
TWF1Q12792 FGF6-201ENST00000228837 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
TWF1Q12792 NCR1-201ENST00000291890 1155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
TWF1Q12792 SPAG11A-201ENST00000326558 612 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
TWF1Q12792 NCR1-202ENST00000338835 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
TWF1Q12792 NCR1-203ENST00000350790 739 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
TWF1Q12792 S100A16-202ENST00000368704 1146 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
TWF1Q12792 ITIH1-202ENST00000405128 1122 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
TWF1Q12792 ZFAND2B-203ENST00000409206 1159 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
TWF1Q12792 LNCPRESS1-201ENST00000429254 756 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
TWF1Q12792 RPS2P32-201ENST00000439199 892 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
TWF1Q12792 RALY-AS1-203ENST00000440595 660 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
TWF1Q12792 ZFAND2B-212ENST00000444522 1199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
TWF1Q12792 CROCCP4-201ENST00000457096 498 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
TWF1Q12792 AC025183.2-201ENST00000503386 428 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
TWF1Q12792 BRF2-202ENST00000520601 1192 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
TWF1Q12792 TPD52L1-214ENST00000534199 811 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
TWF1Q12792 AC004803.1-204ENST00000543290 512 ntTSL 4 BASIC16.61■□□□□ 0.25
TWF1Q12792 AL390726.5-201ENST00000562942 871 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
TWF1Q12792 SLC38A7-207ENST00000564391 731 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
TWF1Q12792 AGAP1-213ENST00000619456 1057 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.3 ms