Protein–RNA interactions for Protein: Q08945

SSRP1, FACT complex subunit SSRP1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 709 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSRP1Q08945 CASK-202ENST00000378158 3848 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
SSRP1Q08945 HECTD1-201ENST00000399332 9134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
SSRP1Q08945 LSMEM2-201ENST00000316436 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SSRP1Q08945 C19orf68-203ENST00000614654 3588 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
SSRP1Q08945 AP4B1-204ENST00000369569 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SSRP1Q08945 ALKBH6-201ENST00000252984 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SSRP1Q08945 C16orf92-201ENST00000300575 895 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SSRP1Q08945 NUDT4P1-201ENST00000322209 1206 ntAPPRIS P1 BASIC18.4■□□□□ 0.54
SSRP1Q08945 STK40-202ENST00000373129 3846 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SSRP1Q08945 TMEM120A-203ENST00000439537 1161 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SSRP1Q08945 SERBP1P3-201ENST00000459980 809 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
SSRP1Q08945 SNX21-206ENST00000462307 1043 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SSRP1Q08945 AC002116.1-201ENST00000473572 1130 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
SSRP1Q08945 AL160313.1-201ENST00000502101 1039 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SSRP1Q08945 AC027369.6-201ENST00000525520 931 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
SSRP1Q08945 TMEM120B-206ENST00000540377 962 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
SSRP1Q08945 AC087741.1-203ENST00000576824 820 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
SSRP1Q08945 AC010326.2-201ENST00000602124 1020 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
SSRP1Q08945 TEX28P1-201ENST00000613479 1221 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
SSRP1Q08945 TEX28P2-201ENST00000617764 1221 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
SSRP1Q08945 AL033527.5-202ENST00000641632 1098 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
SSRP1Q08945 TBP-202ENST00000392092 1903 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SSRP1Q08945 TMUB2-212ENST00000589785 1918 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
SSRP1Q08945 COL17A1-202ENST00000369733 5488 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
SSRP1Q08945 CALCB-202ENST00000523376 2258 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
SSRP1Q08945 GRN-214ENST00000589265 1632 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
SSRP1Q08945 KLHL42-201ENST00000381271 6703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SSRP1Q08945 CARD11-203ENST00000396946 4366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SSRP1Q08945 AC131160.1-201ENST00000639401 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
SSRP1Q08945 CYP2R1-207ENST00000532378 1746 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
SSRP1Q08945 SMAD6-201ENST00000288840 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SSRP1Q08945 ZNF114-204ENST00000595607 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SSRP1Q08945 RCAN3-202ENST00000374395 6802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SSRP1Q08945 SLC35C2-202ENST00000317734 2175 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
SSRP1Q08945 HDHD3-202ENST00000374180 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
SSRP1Q08945 CDIP1-206ENST00000563507 1463 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.54
SSRP1Q08945 AL158154.2-201ENST00000585776 2208 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.54
SSRP1Q08945 PPIL6-207ENST00000521072 4128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
SSRP1Q08945 FBLIM1-206ENST00000441801 1543 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
SSRP1Q08945 BBS5-201ENST00000295240 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
SSRP1Q08945 B3GLCT-201ENST00000343307 4254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
SSRP1Q08945 PCDHGC5-202ENST00000610789 2763 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
SSRP1Q08945 TYSND1-201ENST00000287078 3644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
SSRP1Q08945 AC105250.1-201ENST00000509378 2057 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
SSRP1Q08945 TMEM161A-206ENST00000587583 1654 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
SSRP1Q08945 CLPP-201ENST00000245816 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
SSRP1Q08945 PDCD2L-201ENST00000246535 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
SSRP1Q08945 ACRV1-201ENST00000315608 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
SSRP1Q08945 LINC00313-201ENST00000332440 579 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
SSRP1Q08945 HLA-DRB6-201ENST00000411500 1235 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
SSRP1Q08945 RNASE10-202ENST00000430083 1172 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
SSRP1Q08945 AC124057.1-201ENST00000433035 404 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
SSRP1Q08945 ADAM15-208ENST00000447332 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
SSRP1Q08945 AC007364.1-201ENST00000449714 1022 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
SSRP1Q08945 IGFBP2-204ENST00000456764 846 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
SSRP1Q08945 CNOT8-210ENST00000519404 945 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
SSRP1Q08945 CNOT8-214ENST00000520671 923 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
SSRP1Q08945 CNOT8-218ENST00000521583 1151 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
SSRP1Q08945 AC008750.1-201ENST00000532473 492 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
SSRP1Q08945 FSTL3-202ENST00000588773 746 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
SSRP1Q08945 AC010336.3-201ENST00000597156 667 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
SSRP1Q08945 ARHGAP9-203ENST00000424809 2569 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
SSRP1Q08945 SPATA20-202ENST00000356488 2634 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
SSRP1Q08945 DNAJC10-210ENST00000616986 5783 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
SSRP1Q08945 AC009242.1-201ENST00000634300 2706 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
SSRP1Q08945 ABCB7-201ENST00000253577 2377 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
SSRP1Q08945 KCNJ14-201ENST00000342291 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
SSRP1Q08945 C21orf33-202ENST00000348499 1506 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
SSRP1Q08945 IDH3B-201ENST00000380843 1545 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
SSRP1Q08945 IDH3G-204ENST00000427365 1526 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
SSRP1Q08945 MAP3K8-201ENST00000263056 3096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SSRP1Q08945 TMEM53-204ENST00000372243 1579 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
SSRP1Q08945 RAP1GAP2-209ENST00000637138 3175 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
SSRP1Q08945 FGF4-201ENST00000168712 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SSRP1Q08945 CELF3-201ENST00000290583 3246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SSRP1Q08945 TSPOAP1-202ENST00000343736 5947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SSRP1Q08945 GFRA2-208ENST00000524240 4921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SSRP1Q08945 MBP-202ENST00000355994 2772 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
SSRP1Q08945 UNC5C-203ENST00000506749 2220 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SSRP1Q08945 LARP6-201ENST00000299213 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SSRP1Q08945 RUNDC3B-202ENST00000338056 4099 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
SSRP1Q08945 AP1M2-207ENST00000590923 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SSRP1Q08945 DHX36-202ENST00000329463 2985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SSRP1Q08945 NEFL-203ENST00000619417 1879 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
SSRP1Q08945 GCK-203ENST00000395796 2539 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SSRP1Q08945 S100A14-204ENST00000368702 1218 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
SSRP1Q08945 TREML5P-201ENST00000421694 576 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
SSRP1Q08945 S100A14-206ENST00000476873 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SSRP1Q08945 AC093904.3-201ENST00000492300 368 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
SSRP1Q08945 AL162231.3-201ENST00000556278 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
SSRP1Q08945 STXBP2-222ENST00000612033 1188 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
SSRP1Q08945 TBC1D17-202ENST00000535102 2025 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
SSRP1Q08945 SYBU-209ENST00000446070 2919 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SSRP1Q08945 BABAM1-201ENST00000359435 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SSRP1Q08945 DBN1-202ENST00000309007 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SSRP1Q08945 GPC1-201ENST00000264039 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SSRP1Q08945 PDE6G-204ENST00000573076 1505 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SSRP1Q08945 ISLR-201ENST00000249842 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SSRP1Q08945 DEPDC5-203ENST00000400242 2395 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SSRP1Q08945 FKBP8-201ENST00000222308 1710 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.6 ms