Protein–RNA interactions for Protein: Q08554

DSC1, Desmocollin-1, humanhuman

Predictions only

Length 894 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DSC1Q08554 AC244669.2-201ENST00000612320 853 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
DSC1Q08554 SLC2A14-202ENST00000396589 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
DSC1Q08554 YAP1-209ENST00000537274 5350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
DSC1Q08554 C7orf49-201ENST00000393114 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
DSC1Q08554 RTN4IP1-201ENST00000369063 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
DSC1Q08554 RHNO1-202ENST00000461997 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
DSC1Q08554 RNASEH1-201ENST00000315212 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
DSC1Q08554 CNGA4-201ENST00000379936 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
DSC1Q08554 FAM118B-210ENST00000627851 1862 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
DSC1Q08554 SULT1A2-204ENST00000533150 1991 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
DSC1Q08554 UBQLN1-201ENST00000257468 2299 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
DSC1Q08554 ST6GALNAC6-216ENST00000622357 2396 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
DSC1Q08554 TLE3-212ENST00000558201 2766 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.26
DSC1Q08554 STAT5A-207ENST00000546010 3086 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
DSC1Q08554 C12orf73-207ENST00000549478 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
DSC1Q08554 TEKT4-201ENST00000295201 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
DSC1Q08554 PTDSS1-202ENST00000517309 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
DSC1Q08554 TAF15-205ENST00000603777 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
DSC1Q08554 NFATC1-208ENST00000586434 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
DSC1Q08554 CYP4F2-202ENST00000221700 2407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
DSC1Q08554 CEP72-201ENST00000264935 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
DSC1Q08554 COL4A1-204ENST00000543140 2547 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
DSC1Q08554 LRRC59-201ENST00000225972 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
DSC1Q08554 NCOA5-201ENST00000290231 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
DSC1Q08554 SLC1A6-208ENST00000598504 2987 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
DSC1Q08554 GABRA5-202ENST00000355395 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
DSC1Q08554 MPP3-201ENST00000398389 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
DSC1Q08554 RALYL-208ENST00000522455 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
DSC1Q08554 ARID1A-201ENST00000324856 8577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
DSC1Q08554 AL138799.1-201ENST00000448213 1675 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
DSC1Q08554 MFGE8-215ENST00000566497 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
DSC1Q08554 MIIP-201ENST00000235332 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
DSC1Q08554 ZFYVE28-210ENST00000515169 1590 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
DSC1Q08554 CD209-207ENST00000593660 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
DSC1Q08554 SS18L1-202ENST00000370848 1238 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
DSC1Q08554 IGLV2-23-201ENST00000390306 502 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
DSC1Q08554 PGGT1BP2-201ENST00000398621 1028 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
DSC1Q08554 AL157935.1-209ENST00000415141 1105 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
DSC1Q08554 LYPLAL1-AS1-201ENST00000441331 724 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
DSC1Q08554 AC113608.2-201ENST00000448379 487 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
DSC1Q08554 TMEM225B-203ENST00000453227 1041 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
DSC1Q08554 AC022494.1-201ENST00000466044 728 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
DSC1Q08554 STAG3L5P-205ENST00000473757 1255 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
DSC1Q08554 AP001582.1-201ENST00000525856 295 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
DSC1Q08554 AP006621.2-201ENST00000533938 284 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
DSC1Q08554 AC008011.2-201ENST00000538113 792 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
DSC1Q08554 AP001453.3-201ENST00000545800 853 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
DSC1Q08554 DPF3-210ENST00000556509 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
DSC1Q08554 LINC02299-201ENST00000556669 430 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
DSC1Q08554 C19orf38-203ENST00000592854 1060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
DSC1Q08554 ANXA2R-202ENST00000616064 1265 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
DSC1Q08554 SYNE2-228ENST00000639659 1290 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
DSC1Q08554 ZNF48-205ENST00000613509 3339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
DSC1Q08554 APOLD1-202ENST00000356591 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
DSC1Q08554 CHIA-201ENST00000343320 1624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
DSC1Q08554 TOM1-206ENST00000425375 2252 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
DSC1Q08554 LBHD1-201ENST00000354588 1320 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
DSC1Q08554 STXBP1-216ENST00000636962 2918 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
DSC1Q08554 AC079328.2-201ENST00000561241 3354 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
DSC1Q08554 COX6B2-201ENST00000326529 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
DSC1Q08554 F11R-202ENST00000368026 4835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
DSC1Q08554 GEM-202ENST00000396194 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
DSC1Q08554 PPP3CA-201ENST00000323055 4519 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
DSC1Q08554 EWSR1-206ENST00000397938 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
DSC1Q08554 TBC1D30-203ENST00000539867 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
DSC1Q08554 RHOT1-201ENST00000333942 3133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
DSC1Q08554 SEC13-201ENST00000337354 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
DSC1Q08554 B9D1-209ENST00000477478 1353 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
DSC1Q08554 CCDC90B-203ENST00000525503 1919 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
DSC1Q08554 GPR61-206ENST00000616874 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
DSC1Q08554 FBXL7-202ENST00000504595 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
DSC1Q08554 TCF4-201ENST00000354452 3482 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
DSC1Q08554 CBS-202ENST00000359624 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
DSC1Q08554 CBSL-203ENST00000618024 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
DSC1Q08554 NR2C1-203ENST00000393101 1822 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
DSC1Q08554 STKLD1-201ENST00000371957 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
DSC1Q08554 NSFL1C-206ENST00000476071 2800 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
DSC1Q08554 FAM86MP-201ENST00000340703 885 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
DSC1Q08554 ARHGEF26-AS1-201ENST00000467912 628 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
DSC1Q08554 AC090825.1-203ENST00000558188 582 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
DSC1Q08554 CX3CL1-203ENST00000564948 563 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
DSC1Q08554 AC010641.1-201ENST00000591757 529 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
DSC1Q08554 AP005019.2-201ENST00000615104 511 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
DSC1Q08554 MFF-204ENST00000353339 2186 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
DSC1Q08554 MLPH-204ENST00000410032 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
DSC1Q08554 AC136759.1-201ENST00000534201 2163 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
DSC1Q08554 SUZ12-201ENST00000322652 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
DSC1Q08554 PIGT-201ENST00000279035 1880 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
DSC1Q08554 DYNC1I1-212ENST00000630942 2249 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
DSC1Q08554 H2AFV-201ENST00000222690 3804 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
DSC1Q08554 ZBTB5-201ENST00000307750 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
DSC1Q08554 RGR-201ENST00000358110 1349 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
DSC1Q08554 TUBB1P2-201ENST00000422712 1306 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
DSC1Q08554 TUBB1P1-201ENST00000503144 1300 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
DSC1Q08554 BMPER-201ENST00000297161 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
DSC1Q08554 AL731569.1-201ENST00000428940 3058 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
DSC1Q08554 AMMECR1-201ENST00000262844 5504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
DSC1Q08554 TSNARE1-201ENST00000307180 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
DSC1Q08554 P2RY4-201ENST00000374519 1595 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
DSC1Q08554 ACAP1-201ENST00000158762 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.3 ms