Protein–RNA interactions for Protein: Q07864

POLE, DNA polymerase epsilon catalytic subunit A, humanhuman

Predictions only

Length 2,286 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLEQ07864 AC005695.3-201ENST00000614522 232 ntBASIC14.06□□□□□ -0.16
POLEQ07864 RDM1-220ENST00000616596 1032 ntTSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
POLEQ07864 RDM1-228ENST00000620284 1177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
POLEQ07864 IL32-201ENST00000008180 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.06□□□□□ -0.16
POLEQ07864 AL662844.4-201ENST00000606367 2838 ntBASIC14.06□□□□□ -0.16
POLEQ07864 CFLAR-214ENST00000443227 1679 ntTSL 2 BASIC14.06□□□□□ -0.16
POLEQ07864 PHF23-202ENST00000454255 1662 ntTSL 2 BASIC14.06□□□□□ -0.16
POLEQ07864 NPY4R-202ENST00000612632 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
POLEQ07864 NPY4R2-202ENST00000613306 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
POLEQ07864 FLYWCH1-203ENST00000416288 4963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
POLEQ07864 CTNND2-214ENST00000511377 4336 ntTSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
POLEQ07864 AC026471.1-201ENST00000564629 3026 ntBASIC14.06□□□□□ -0.16
POLEQ07864 ZBTB32-201ENST00000262630 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
POLEQ07864 RCAN3-210ENST00000618490 2386 ntTSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
POLEQ07864 PFKP-202ENST00000381075 2769 ntTSL 2 BASIC14.06□□□□□ -0.16
POLEQ07864 ENO3-206ENST00000519584 1322 ntTSL 2 BASIC14.06□□□□□ -0.16
POLEQ07864 ZSCAN30-212ENST00000639929 1305 ntTSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
POLEQ07864 DMRTA1-201ENST00000325870 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
POLEQ07864 DPP9-AS1-201ENST00000381796 3071 ntTSL 2 BASIC14.06□□□□□ -0.16
POLEQ07864 AC092171.3-201ENST00000610122 2651 ntBASIC14.06□□□□□ -0.16
POLEQ07864 LRRC58-201ENST00000295628 7903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
POLEQ07864 CROCC2-201ENST00000443866 5382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
POLEQ07864 NAIF1-201ENST00000373078 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
POLEQ07864 MAP7-207ENST00000616617 4326 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
POLEQ07864 DAG1-222ENST00000545947 5829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
POLEQ07864 SCARB1-203ENST00000415380 2731 ntTSL 2 BASIC14.06□□□□□ -0.16
POLEQ07864 PCDH1-203ENST00000394536 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
POLEQ07864 GGT7-201ENST00000336431 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
POLEQ07864 TPM1-201ENST00000267996 1670 ntTSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
POLEQ07864 EHMT1-236ENST00000637161 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
POLEQ07864 SPEG-201ENST00000312358 10782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
POLEQ07864 ACSM2A-203ENST00000417235 1835 ntTSL 2 BASIC14.06□□□□□ -0.16
POLEQ07864 PRAG1-201ENST00000615670 4903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
POLEQ07864 CNTNAP3-201ENST00000297668 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
POLEQ07864 ACSM2B-211ENST00000567001 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
POLEQ07864 RPL18A-201ENST00000222247 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
POLEQ07864 LINC01694-201ENST00000424569 821 ntTSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
POLEQ07864 AC097717.1-202ENST00000457577 740 ntTSL 3 BASIC14.06□□□□□ -0.16
POLEQ07864 BTNL8-205ENST00000505126 1294 ntTSL 2 BASIC14.06□□□□□ -0.16
POLEQ07864 AC006487.1-201ENST00000514506 1221 ntTSL 2 BASIC14.06□□□□□ -0.16
POLEQ07864 LYSMD2-204ENST00000560491 1026 ntTSL 3 BASIC14.06□□□□□ -0.16
POLEQ07864 AC000095.1-201ENST00000603208 874 ntBASIC14.06□□□□□ -0.16
POLEQ07864 AC093326.2-201ENST00000640770 729 ntTSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
POLEQ07864 PRDM5-212ENST00000515109 2259 ntTSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
POLEQ07864 CAPRIN1-207ENST00000529307 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.06□□□□□ -0.16
POLEQ07864 SLC25A2-201ENST00000239451 1417 ntAPPRIS P1 BASIC14.06□□□□□ -0.16
POLEQ07864 WSCD1-208ENST00000573634 1573 ntTSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
POLEQ07864 TEX264-205ENST00000416589 1313 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
POLEQ07864 TSPAN12-202ENST00000415871 1495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
POLEQ07864 AL034550.2-201ENST00000620523 1771 ntTSL 2 BASIC14.05□□□□□ -0.16
POLEQ07864 NSFL1C-206ENST00000476071 2800 ntTSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
POLEQ07864 GATA4-201ENST00000335135 3414 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
POLEQ07864 GOLGA6L2-204ENST00000567107 3030 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
POLEQ07864 IDH3G-203ENST00000370093 1662 ntTSL 2 BASIC14.05□□□□□ -0.16
POLEQ07864 PTCH1-201ENST00000331920 8057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
POLEQ07864 AL121723.1-201ENST00000445194 1519 ntBASIC14.05□□□□□ -0.16
POLEQ07864 FBXO8-202ENST00000503293 1546 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
POLEQ07864 CTNNAL1-201ENST00000325551 2490 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
POLEQ07864 LSR-212ENST00000602122 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.05□□□□□ -0.16
POLEQ07864 EDA-204ENST00000374553 5272 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
POLEQ07864 ANKRD23-203ENST00000418232 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
POLEQ07864 PIGT-207ENST00000543458 2037 ntTSL 2 BASIC14.05□□□□□ -0.16
POLEQ07864 PGBD5-202ENST00000525115 1569 ntTSL 2 BASIC14.05□□□□□ -0.16
POLEQ07864 AL607033.1-201ENST00000623900 1599 ntBASIC14.05□□□□□ -0.16
POLEQ07864 P2RY6-202ENST00000393590 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
POLEQ07864 RPS3-201ENST00000278572 907 ntTSL 3 BASIC14.05□□□□□ -0.16
POLEQ07864 ACKR1-201ENST00000368121 1240 ntBASIC14.05□□□□□ -0.16
POLEQ07864 KRTAP1-4-201ENST00000377747 408 ntAPPRIS P1 BASIC14.05□□□□□ -0.16
POLEQ07864 MASP2-202ENST00000400898 726 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
POLEQ07864 NCBP2-203ENST00000422610 676 ntTSL 2 BASIC14.05□□□□□ -0.16
POLEQ07864 ELP6-209ENST00000446787 894 ntTSL 3 BASIC14.05□□□□□ -0.16
POLEQ07864 AC126768.2-201ENST00000511693 718 ntTSL 3 BASIC14.05□□□□□ -0.16
POLEQ07864 TAPBPL-205ENST00000544021 772 ntTSL 3 BASIC14.05□□□□□ -0.16
POLEQ07864 KSR1-207ENST00000578981 748 ntTSL 4 BASIC14.05□□□□□ -0.16
POLEQ07864 KLK3-211ENST00000597483 810 ntTSL 2 BASIC14.05□□□□□ -0.16
POLEQ07864 TMEM14B-220ENST00000612333 888 ntTSL 3 BASIC14.05□□□□□ -0.16
POLEQ07864 APOBEC3H-206ENST00000613677 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
POLEQ07864 DCAF4-201ENST00000353777 1940 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
POLEQ07864 TLE2-204ENST00000455444 2253 ntTSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
POLEQ07864 IPMK-201ENST00000373935 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
POLEQ07864 CD1E-213ENST00000444681 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
POLEQ07864 COL5A3-201ENST00000264828 6174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
POLEQ07864 CRB2-201ENST00000359999 3659 ntTSL 2 BASIC14.05□□□□□ -0.16
POLEQ07864 SNAI2-201ENST00000020945 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
POLEQ07864 SCAF8-201ENST00000367178 5057 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.05□□□□□ -0.16
POLEQ07864 WDR70-202ENST00000504564 1526 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
POLEQ07864 NFIX-214ENST00000592199 1509 ntTSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
POLEQ07864 LRRC14-205ENST00000529022 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
POLEQ07864 ZIC5-201ENST00000267294 4639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
POLEQ07864 SH2B1-202ENST00000337120 6043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
POLEQ07864 ST7L-207ENST00000369669 1743 ntTSL 2 BASIC14.05□□□□□ -0.16
POLEQ07864 SH2D3C-203ENST00000373277 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
POLEQ07864 SHANK1-201ENST00000293441 6643 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
POLEQ07864 RBBP7-204ENST00000404022 1904 ntTSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
POLEQ07864 SNAP23-201ENST00000249647 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
POLEQ07864 AC009292.1-201ENST00000502156 1986 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
POLEQ07864 REXO1L1P-202ENST00000608646 1974 ntBASIC14.05□□□□□ -0.16
POLEQ07864 SYBU-201ENST00000276646 2870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
POLEQ07864 ADAM11-203ENST00000535346 2529 ntTSL 2 BASIC14.05□□□□□ -0.16
POLEQ07864 EPHX2-202ENST00000517536 1600 ntTSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38 ms