Protein–RNA interactions for Protein: Q07325

CXCL9, C-X-C motif chemokine 9, humanhuman

Predictions only

Length 125 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CXCL9Q07325 SYBU-231ENST00000533065 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
CXCL9Q07325 DMPK-204ENST00000447742 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CXCL9Q07325 NRP1-203ENST00000374821 1988 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CXCL9Q07325 NOV-201ENST00000259526 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CXCL9Q07325 GTF2H4-201ENST00000259895 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CXCL9Q07325 VPS51-201ENST00000279281 2714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CXCL9Q07325 METTL21A-203ENST00000411432 4805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
CXCL9Q07325 CLDN11-201ENST00000064724 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CXCL9Q07325 PSEN2-203ENST00000422240 1947 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
CXCL9Q07325 BAIAP2-219ENST00000575245 2229 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
CXCL9Q07325 ABLIM2-203ENST00000361737 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
CXCL9Q07325 VEGFA-205ENST00000372067 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CXCL9Q07325 CPXM2-204ENST00000615851 2512 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
CXCL9Q07325 FAM53A-201ENST00000308132 2802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
CXCL9Q07325 KLHDC7B-201ENST00000395676 2991 ntAPPRIS P1 BASIC18.7■□□□□ 0.58
CXCL9Q07325 SEPHS2-201ENST00000478753 2551 ntAPPRIS P1 BASIC18.7■□□□□ 0.58
CXCL9Q07325 HIPK1-207ENST00000369561 3777 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
CXCL9Q07325 DGKI-203ENST00000446122 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
CXCL9Q07325 SPAG11A-203ENST00000351436 534 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CXCL9Q07325 SPAG11B-204ENST00000361111 534 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CXCL9Q07325 TMEM254-204ENST00000372277 366 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
CXCL9Q07325 MAP4K2-202ENST00000377350 2931 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CXCL9Q07325 IGHV3-53-201ENST00000390627 571 ntAPPRIS P1 BASIC18.7■□□□□ 0.58
CXCL9Q07325 HLA-DQB2-229ENST00000411527 1059 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
CXCL9Q07325 AC079178.1-201ENST00000420915 656 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
CXCL9Q07325 PACS2-202ENST00000430725 2944 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CXCL9Q07325 DLGAP4-AS1-202ENST00000433238 593 ntTSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
CXCL9Q07325 PTPA-217ENST00000434095 870 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
CXCL9Q07325 VGLL4-214ENST00000451674 938 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CXCL9Q07325 AC004522.2-201ENST00000456499 680 ntTSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
CXCL9Q07325 DERL3-208ENST00000476077 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CXCL9Q07325 SERPINA13P-202ENST00000478994 924 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
CXCL9Q07325 TMEM198B-204ENST00000484016 896 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
CXCL9Q07325 RN7SL720P-201ENST00000488178 304 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
CXCL9Q07325 PRPS2-205ENST00000489404 763 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
CXCL9Q07325 ANO1-AS1-201ENST00000524987 646 ntTSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
CXCL9Q07325 AC067930.5-201ENST00000531730 1173 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
CXCL9Q07325 PPP1R32-205ENST00000538185 1107 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
CXCL9Q07325 MAP1LC3B2-202ENST00000556529 660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
CXCL9Q07325 NARFL-218ENST00000568545 2486 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
CXCL9Q07325 TXNDC17-202ENST00000570330 459 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
CXCL9Q07325 AC025048.1-201ENST00000592317 542 ntTSL 4 BASIC18.7■□□□□ 0.58
CXCL9Q07325 CU633904.3-201ENST00000624042 1029 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
CXCL9Q07325 AC128714.1-201ENST00000637035 887 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
CXCL9Q07325 PRSS30P-206ENST00000641773 873 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
CXCL9Q07325 FAM111A-204ENST00000528737 6189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
CXCL9Q07325 BRIX1-201ENST00000336767 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CXCL9Q07325 C20orf202-201ENST00000400633 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CXCL9Q07325 PAK4-201ENST00000321944 2555 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CXCL9Q07325 GALNT9-201ENST00000328957 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CXCL9Q07325 MTA2-204ENST00000527204 2265 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
CXCL9Q07325 GTPBP3-222ENST00000600625 2493 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CXCL9Q07325 LINC00658-202ENST00000420529 1542 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CXCL9Q07325 SPAST-203ENST00000615843 5212 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CXCL9Q07325 PTHLH-201ENST00000201015 1872 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.69■□□□□ 0.58
CXCL9Q07325 PIGT-201ENST00000279035 1880 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
CXCL9Q07325 SFTPB-202ENST00000409383 1867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CXCL9Q07325 BATF2-202ENST00000435842 1949 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CXCL9Q07325 EMILIN3-201ENST00000332312 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CXCL9Q07325 AHNAK-201ENST00000257247 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CXCL9Q07325 KRTAP21-2-201ENST00000333892 440 ntAPPRIS P1 BASIC18.69■□□□□ 0.58
CXCL9Q07325 CXorf40A-201ENST00000359293 974 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
CXCL9Q07325 SNX21-203ENST00000372541 771 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
CXCL9Q07325 DBI-203ENST00000393103 599 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CXCL9Q07325 CRYAA-202ENST00000398132 826 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
CXCL9Q07325 CD8A-204ENST00000409781 597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
CXCL9Q07325 DHDDS-206ENST00000427245 868 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
CXCL9Q07325 AC099552.1-201ENST00000431083 744 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
CXCL9Q07325 AC010745.3-201ENST00000439745 415 ntTSL 3 BASIC18.69■□□□□ 0.58
CXCL9Q07325 LINC00642-202ENST00000442515 670 ntTSL 3 BASIC18.69■□□□□ 0.58
CXCL9Q07325 RPL35A-205ENST00000448864 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CXCL9Q07325 AC092944.1-202ENST00000487238 483 ntTSL 4 BASIC18.69■□□□□ 0.58
CXCL9Q07325 AC007342.4-201ENST00000566383 584 ntTSL 4 BASIC18.69■□□□□ 0.58
CXCL9Q07325 MIR4313-201ENST00000580760 101 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
CXCL9Q07325 AC129926.1-201ENST00000581944 614 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
CXCL9Q07325 KLK11-210ENST00000600362 759 ntTSL 3 BASIC18.69■□□□□ 0.58
CXCL9Q07325 DIO1-215ENST00000610607 796 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
CXCL9Q07325 AC138649.2-201ENST00000615886 705 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
CXCL9Q07325 ENPP7P14-201ENST00000621765 1040 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
CXCL9Q07325 GPR39-203ENST00000622084 900 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
CXCL9Q07325 FP236240.1-204ENST00000624932 712 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
CXCL9Q07325 NKIRAS1-203ENST00000415901 1644 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
CXCL9Q07325 BET1L-203ENST00000382762 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CXCL9Q07325 TEF-201ENST00000266304 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CXCL9Q07325 LTK-204ENST00000561619 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CXCL9Q07325 ZSWIM5-201ENST00000359600 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CXCL9Q07325 C19orf54-203ENST00000470681 2521 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
CXCL9Q07325 TMED1-201ENST00000214869 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CXCL9Q07325 WIF1-201ENST00000286574 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CXCL9Q07325 SIGLEC6-205ENST00000425629 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
CXCL9Q07325 MAGEA2-204ENST00000611674 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
CXCL9Q07325 OPA3-202ENST00000323060 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CXCL9Q07325 GOLGA6L2-201ENST00000312015 1379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
CXCL9Q07325 CEP83-AS1-201ENST00000623122 2482 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
CXCL9Q07325 SLC9A6-208ENST00000636206 4711 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
CXCL9Q07325 ENC1-201ENST00000302351 5520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
CXCL9Q07325 NINL-201ENST00000278886 4969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
CXCL9Q07325 CLU-215ENST00000523500 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
CXCL9Q07325 SACS-AS1-201ENST00000443092 2234 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
CXCL9Q07325 MAPKAP1-205ENST00000373503 3045 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.2 ms