Protein–RNA interactions for Protein: Q05952

TNP2, Nuclear transition protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 138 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNP2Q05952 PMS1-213ENST00000441310 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
TNP2Q05952 HM13-202ENST00000340852 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
TNP2Q05952 RPS9-207ENST00000441429 1600 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
TNP2Q05952 LINC01660-203ENST00000618517 1859 ntTSL 2 BASIC10.76□□□□□ -0.69
TNP2Q05952 RRM2B-201ENST00000251810 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
TNP2Q05952 PGRMC2-207ENST00000520121 3785 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
TNP2Q05952 KLF10-201ENST00000285407 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
TNP2Q05952 SPRYD7-202ENST00000378195 3086 ntTSL 2 BASIC10.76□□□□□ -0.69
TNP2Q05952 BRI3BP-201ENST00000341446 6648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
TNP2Q05952 PDXDC1-204ENST00000455313 2183 ntTSL 2 BASIC10.76□□□□□ -0.69
TNP2Q05952 AL603756.1-201ENST00000606511 2163 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
TNP2Q05952 DMRT2-202ENST00000302441 1495 ntTSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
TNP2Q05952 MRPS21-201ENST00000581066 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
TNP2Q05952 CHAD-201ENST00000258969 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
TNP2Q05952 RNF34-202ENST00000392464 1722 ntTSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
TNP2Q05952 CSF1-204ENST00000369802 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
TNP2Q05952 TMTC4-203ENST00000376234 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
TNP2Q05952 SYTL3-202ENST00000360448 2504 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
TNP2Q05952 RPAIN-203ENST00000381209 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
TNP2Q05952 H2BFWT-201ENST00000217926 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
TNP2Q05952 EEF1B2-201ENST00000236957 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
TNP2Q05952 NMU-201ENST00000264218 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
TNP2Q05952 LYPLA2-201ENST00000374501 1117 ntTSL 2 BASIC10.76□□□□□ -0.69
TNP2Q05952 ING1-204ENST00000375775 1074 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
TNP2Q05952 CLCN6-207ENST00000376497 814 ntTSL 3 BASIC10.76□□□□□ -0.69
TNP2Q05952 KRTAP10-1-201ENST00000400375 1215 ntAPPRIS P1 BASIC10.76□□□□□ -0.69
TNP2Q05952 LINC01715-201ENST00000420776 624 ntTSL 2 BASIC10.76□□□□□ -0.69
TNP2Q05952 APOBEC3H-204ENST00000442487 988 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC10.76□□□□□ -0.69
TNP2Q05952 MYCLP2-201ENST00000449268 967 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
TNP2Q05952 DWORF-201ENST00000489090 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
TNP2Q05952 MEF2C-AS1-208ENST00000512585 741 ntTSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
TNP2Q05952 SERF1B-208ENST00000515588 792 ntTSL 2 BASIC10.76□□□□□ -0.69
TNP2Q05952 AC084033.1-201ENST00000550830 633 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
TNP2Q05952 NDRG4-247ENST00000568640 1281 ntTSL 2 BASIC10.76□□□□□ -0.69
TNP2Q05952 AC009139.2-201ENST00000569032 566 ntTSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
TNP2Q05952 TXNL4A-212ENST00000592957 546 ntTSL 3 BASIC10.76□□□□□ -0.69
TNP2Q05952 AL049840.6-202ENST00000603373 279 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
TNP2Q05952 HOTAIRM1_1.1-201ENST00000622675 125 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
TNP2Q05952 AL353684.1-201ENST00000622677 1120 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
TNP2Q05952 AC068057.2-201ENST00000624047 895 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
TNP2Q05952 TAMM41-212ENST00000630288 607 ntTSL 2 BASIC10.76□□□□□ -0.69
TNP2Q05952 ZNF286A-204ENST00000464847 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
TNP2Q05952 CHST10-201ENST00000264249 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
TNP2Q05952 FMNL1-201ENST00000328118 2330 ntTSL 2 BASIC10.76□□□□□ -0.69
TNP2Q05952 FAM122C-202ENST00000370785 1344 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
TNP2Q05952 RPS20P22-202ENST00000488192 1318 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
TNP2Q05952 TRAPPC3-210ENST00000617904 1305 ntTSL 2 BASIC10.76□□□□□ -0.69
TNP2Q05952 EIF4H-201ENST00000265753 2679 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC10.76□□□□□ -0.69
TNP2Q05952 AC063923.1-201ENST00000478982 1619 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
TNP2Q05952 ARL13B-203ENST00000394222 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
TNP2Q05952 RHBDF1P1-201ENST00000427504 1941 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
TNP2Q05952 AL445523.1-201ENST00000451184 1362 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
TNP2Q05952 KRT8P12-202ENST00000472924 1397 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
TNP2Q05952 DNAJA3-201ENST00000262375 2763 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
TNP2Q05952 MARCH2-208ENST00000602117 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
TNP2Q05952 PCBP3-204ENST00000400309 1986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
TNP2Q05952 DEF6-201ENST00000316637 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
TNP2Q05952 AL132996.1-201ENST00000569865 1431 ntTSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
TNP2Q05952 AP001189.5-201ENST00000637683 1413 ntTSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
TNP2Q05952 NFATC4-202ENST00000413692 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
TNP2Q05952 PARVG-205ENST00000422871 3462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
TNP2Q05952 SCNN1A-205ENST00000396966 2336 ntTSL 3 BASIC10.75□□□□□ -0.69
TNP2Q05952 CD1E-212ENST00000368167 1458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
TNP2Q05952 SELENBP1-201ENST00000368868 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
TNP2Q05952 ADGRG3-202ENST00000450388 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.75□□□□□ -0.69
TNP2Q05952 CDC25B-204ENST00000379598 2990 ntTSL 2 BASIC10.75□□□□□ -0.69
TNP2Q05952 JADE2-201ENST00000282605 2748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.75□□□□□ -0.69
TNP2Q05952 CCDC120-202ENST00000496529 2415 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.75□□□□□ -0.69
TNP2Q05952 POMK-203ENST00000614426 1527 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC10.75□□□□□ -0.69
TNP2Q05952 FBLIM1-202ENST00000375766 3695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.75□□□□□ -0.69
TNP2Q05952 JADE3-204ENST00000614628 4934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
TNP2Q05952 ZNF710-201ENST00000268154 4617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.75□□□□□ -0.69
TNP2Q05952 DAPK1-202ENST00000408954 5892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.75□□□□□ -0.69
TNP2Q05952 SPINT1-202ENST00000562057 2456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
TNP2Q05952 OR2C3-203ENST00000617752 2481 ntAPPRIS P1 BASIC10.75□□□□□ -0.69
TNP2Q05952 ZNF786-201ENST00000316286 3144 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
TNP2Q05952 MFSD11-202ENST00000355954 2832 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
TNP2Q05952 VGLL4-202ENST00000413604 1554 ntTSL 2 BASIC10.75□□□□□ -0.69
TNP2Q05952 AL353608.3-201ENST00000603200 2211 ntTSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
TNP2Q05952 NDUFB7-201ENST00000215565 531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
TNP2Q05952 ZNF626-201ENST00000291750 1123 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
TNP2Q05952 SPAG11A-201ENST00000326558 612 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
TNP2Q05952 POLDIP3-202ENST00000339677 783 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
TNP2Q05952 NTMT1-201ENST00000372480 852 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.75□□□□□ -0.69
TNP2Q05952 MFAP2-201ENST00000375534 970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.75□□□□□ -0.69
TNP2Q05952 OR6C4-201ENST00000394256 1046 ntAPPRIS P1 BASIC10.75□□□□□ -0.69
TNP2Q05952 SZT2-AS1-201ENST00000396885 699 ntTSL 3 BASIC10.75□□□□□ -0.69
TNP2Q05952 VMO1-203ENST00000416307 712 ntTSL 2 BASIC10.75□□□□□ -0.69
TNP2Q05952 AL034550.1-201ENST00000442179 986 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
TNP2Q05952 HMGB2-203ENST00000446922 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
TNP2Q05952 AC093724.1-201ENST00000448659 1027 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
TNP2Q05952 AL606760.2-202ENST00000452466 524 ntTSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
TNP2Q05952 OFD1P3Y-201ENST00000453312 783 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
TNP2Q05952 NUTM2A-AS1-212ENST00000458739 733 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
TNP2Q05952 HSPB7-207ENST00000487046 844 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
TNP2Q05952 SUCLG2-AS1-203ENST00000496640 862 ntTSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
TNP2Q05952 CENPK-211ENST00000510693 1040 ntTSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
TNP2Q05952 SDHAP3-202ENST00000515467 728 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
TNP2Q05952 AC069208.1-206ENST00000538905 832 ntTSL 4 BASIC10.75□□□□□ -0.69
TNP2Q05952 RHBDL2-203ENST00000540558 697 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.2 ms