Protein–RNA interactions for Protein: Q02809

PLOD1, Procollagen-lysine,2-oxoglutarate 5-dioxygenase 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 727 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLOD1Q02809 GGT6-204ENST00000574154 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PLOD1Q02809 SALL3-206ENST00000616649 2958 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PLOD1Q02809 HAUS3-204ENST00000506763 3166 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PLOD1Q02809 TMEM263-201ENST00000280756 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PLOD1Q02809 RPS23-201ENST00000296674 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PLOD1Q02809 KCND3-202ENST00000315987 2716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PLOD1Q02809 CIAPIN1-209ENST00000567518 2016 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PLOD1Q02809 MCM3AP-AS1-202ENST00000420074 1947 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PLOD1Q02809 TMEM222-210ENST00000608611 1511 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PLOD1Q02809 RNLS-201ENST00000331772 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PLOD1Q02809 BEX4-202ENST00000372695 1328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PLOD1Q02809 TEAD3-204ENST00000639578 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PLOD1Q02809 SIX6-201ENST00000327720 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PLOD1Q02809 DMTN-202ENST00000358242 2772 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PLOD1Q02809 ARNT2-204ENST00000527771 2458 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PLOD1Q02809 CDKN1A-203ENST00000405375 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PLOD1Q02809 CDIP1-209ENST00000567695 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PLOD1Q02809 SEPT5-204ENST00000406395 1974 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PLOD1Q02809 SHH-201ENST00000297261 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PLOD1Q02809 ACSL3-202ENST00000392066 3147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PLOD1Q02809 MYCBPAP-203ENST00000436259 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PLOD1Q02809 LINC00599-203ENST00000519461 2922 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PLOD1Q02809 SATB2-205ENST00000443023 6194 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PLOD1Q02809 CREB3L3-201ENST00000078445 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PLOD1Q02809 ITSN1-204ENST00000381285 6107 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PLOD1Q02809 DAP-201ENST00000230895 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PLOD1Q02809 CA4-201ENST00000300900 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PLOD1Q02809 NKX2-6-201ENST00000325017 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PLOD1Q02809 CCDC84-201ENST00000334418 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PLOD1Q02809 PRORY-201ENST00000382764 878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PLOD1Q02809 MRPL28-202ENST00000389675 865 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PLOD1Q02809 CAPG-205ENST00000409921 1195 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PLOD1Q02809 PABPN1L-201ENST00000411789 873 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PLOD1Q02809 FAM58DP-201ENST00000428076 619 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
PLOD1Q02809 AC092691.1-201ENST00000484092 554 ntTSL 4 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PLOD1Q02809 HLA-J-203ENST00000494367 1087 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
PLOD1Q02809 AGGF1-204ENST00000506806 1142 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PLOD1Q02809 FAM86HP-203ENST00000511564 521 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PLOD1Q02809 VASH2-211ENST00000517399 1068 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PLOD1Q02809 AC243965.1-201ENST00000557595 781 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PLOD1Q02809 COX5A-203ENST00000564811 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PLOD1Q02809 COLCA2-206ENST00000638573 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PLOD1Q02809 GRIN3A-201ENST00000361820 7770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PLOD1Q02809 DCBLD1-202ENST00000338728 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PLOD1Q02809 OSGIN1-203ENST00000393306 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PLOD1Q02809 IRGQ-201ENST00000422989 9685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PLOD1Q02809 TONSL-203ENST00000613741 1713 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PLOD1Q02809 ECE1-204ENST00000415912 5099 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PLOD1Q02809 C12orf65-201ENST00000253233 2073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PLOD1Q02809 NECAP2-201ENST00000337132 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PLOD1Q02809 Z99756.1-201ENST00000458463 1951 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PLOD1Q02809 WDR20-202ENST00000322340 3060 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PLOD1Q02809 PLA2G2D-202ENST00000617227 1856 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PLOD1Q02809 EIF1B-AS1-206ENST00000631175 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PLOD1Q02809 CXCL14-202ENST00000512158 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PLOD1Q02809 ZSCAN18-208ENST00000595944 1768 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PLOD1Q02809 KCNG3-202ENST00000394973 3656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PLOD1Q02809 NFE2-201ENST00000312156 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PLOD1Q02809 SLC39A6-202ENST00000440549 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PLOD1Q02809 ANO1-201ENST00000316296 2118 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PLOD1Q02809 TBC1D3D-201ENST00000616101 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PLOD1Q02809 TBC1D3K-201ENST00000620247 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PLOD1Q02809 ALPL-204ENST00000374840 2589 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PLOD1Q02809 PSD4-201ENST00000245796 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PLOD1Q02809 SLC5A7-202ENST00000409059 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PLOD1Q02809 NOX4-207ENST00000525196 1555 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PLOD1Q02809 CASC2-203ENST00000435944 3270 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PLOD1Q02809 UBE2I-201ENST00000325437 2832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PLOD1Q02809 FSD2-202ENST00000541889 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PLOD1Q02809 PLD3-201ENST00000356508 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PLOD1Q02809 EIF2B3-210ENST00000620860 1923 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PLOD1Q02809 SLC29A1-203ENST00000371724 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PLOD1Q02809 AP000487.1-202ENST00000500185 2602 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PLOD1Q02809 SLC6A9-204ENST00000372307 2162 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PLOD1Q02809 CD300LG-204ENST00000539718 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PLOD1Q02809 ANXA11-203ENST00000422982 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PLOD1Q02809 MIR600HG-201ENST00000449175 5984 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
PLOD1Q02809 APH1A-204ENST00000414276 1718 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PLOD1Q02809 C19orf68-203ENST00000614654 3588 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PLOD1Q02809 USP4-201ENST00000265560 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PLOD1Q02809 AL353705.2-201ENST00000428243 662 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
PLOD1Q02809 AL669831.5-201ENST00000434264 844 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PLOD1Q02809 ZNF576-206ENST00000533118 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PLOD1Q02809 DAD1-205ENST00000543337 501 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PLOD1Q02809 MAX-210ENST00000555419 765 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PLOD1Q02809 NDUFAB1-205ENST00000570319 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PLOD1Q02809 AC018529.1-201ENST00000613063 361 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
PLOD1Q02809 PDCD6-214ENST00000628729 1073 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PLOD1Q02809 AK4-202ENST00000395334 6998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PLOD1Q02809 PDXK-202ENST00000327574 2583 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PLOD1Q02809 USH1C-202ENST00000318024 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PLOD1Q02809 MEIS3-210ENST00000561096 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PLOD1Q02809 PARVB-210ENST00000619710 1530 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PLOD1Q02809 SARM1-208ENST00000585482 10309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PLOD1Q02809 SNX31-201ENST00000311812 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PLOD1Q02809 CHFR-204ENST00000443047 2990 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PLOD1Q02809 ANOS1-201ENST00000262648 6314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PLOD1Q02809 WDR97-201ENST00000323662 6916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PLOD1Q02809 FASTKD5-201ENST00000380266 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PLOD1Q02809 AGPS-201ENST00000264167 7764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42 ms