Protein–RNA interactions for Protein: Q01082

SPTBN1, Spectrin beta chain, non-erythrocytic 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 2,364 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPTBN1Q01082 KLK1-201ENST00000301420 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
SPTBN1Q01082 ZNF746-201ENST00000340622 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
SPTBN1Q01082 CELA2B-201ENST00000375910 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
SPTBN1Q01082 HLA-DQB2-229ENST00000411527 1059 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
SPTBN1Q01082 PENK-202ENST00000451791 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
SPTBN1Q01082 CCDC153-204ENST00000503566 1295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
SPTBN1Q01082 AC008438.1-201ENST00000507521 549 ntTSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
SPTBN1Q01082 AP001360.1-202ENST00000526934 479 ntTSL 3 BASIC13.94□□□□□ -0.18
SPTBN1Q01082 OVOL1-AS1-202ENST00000532454 494 ntTSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
SPTBN1Q01082 RPL28-208ENST00000559463 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
SPTBN1Q01082 AHSA2-202ENST00000394457 6574 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
SPTBN1Q01082 LINC00595-204ENST00000434974 2692 ntTSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
SPTBN1Q01082 MTHFD2L-203ENST00000395759 2354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
SPTBN1Q01082 IL18BP-204ENST00000393703 1788 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC13.94□□□□□ -0.18
SPTBN1Q01082 FAM109A-204ENST00000548163 2317 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
SPTBN1Q01082 INPP5J-213ENST00000620191 2306 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
SPTBN1Q01082 C14orf180-202ENST00000410013 2009 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
SPTBN1Q01082 NR4A2-204ENST00000409572 2878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
SPTBN1Q01082 TJP1-201ENST00000346128 7950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
SPTBN1Q01082 FAM129C-202ENST00000335393 2508 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
SPTBN1Q01082 UNC119B-201ENST00000344651 4404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
SPTBN1Q01082 C12orf65-202ENST00000366329 1901 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
SPTBN1Q01082 PRR5-218ENST00000624862 1900 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
SPTBN1Q01082 RAB15-203ENST00000533601 3515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
SPTBN1Q01082 PCDHA13-202ENST00000409494 4884 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
SPTBN1Q01082 GPT-202ENST00000394955 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
SPTBN1Q01082 CRMP1-202ENST00000397890 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
SPTBN1Q01082 DNM1-216ENST00000634267 2909 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
SPTBN1Q01082 PCDHA13-201ENST00000289272 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
SPTBN1Q01082 ZBP1-202ENST00000395822 2073 ntTSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
SPTBN1Q01082 DNM1P51-202ENST00000558801 8752 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
SPTBN1Q01082 ABCB9-207ENST00000442833 2587 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
SPTBN1Q01082 NGDN-202ENST00000408901 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
SPTBN1Q01082 LINC01273-201ENST00000411453 685 ntTSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
SPTBN1Q01082 AC106760.1-201ENST00000508690 800 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
SPTBN1Q01082 AC134698.3-201ENST00000523880 214 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
SPTBN1Q01082 C1RL-212ENST00000545337 813 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
SPTBN1Q01082 MRPL34-203ENST00000595444 863 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.94□□□□□ -0.18
SPTBN1Q01082 C17orf50-202ENST00000604830 477 ntTSL 3 BASIC13.94□□□□□ -0.18
SPTBN1Q01082 METTL26-214ENST00000614890 801 ntTSL 3 BASIC13.94□□□□□ -0.18
SPTBN1Q01082 AL096828.3-201ENST00000615354 462 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
SPTBN1Q01082 PDE6G-204ENST00000573076 1505 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
SPTBN1Q01082 SSC5D-202ENST00000587166 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
SPTBN1Q01082 EML3-212ENST00000494176 2901 ntTSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
SPTBN1Q01082 EML3-216ENST00000529309 2909 ntTSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
SPTBN1Q01082 NOS1AP-206ENST00000530878 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
SPTBN1Q01082 QRFP-202ENST00000623824 1658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.93□□□□□ -0.18
SPTBN1Q01082 MAGI3-201ENST00000307546 6430 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
SPTBN1Q01082 CLDN9-201ENST00000445369 2050 ntAPPRIS P1 BASIC13.93□□□□□ -0.18
SPTBN1Q01082 PARD3B-206ENST00000462231 2968 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
SPTBN1Q01082 GALNT11-205ENST00000430044 2727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
SPTBN1Q01082 SP140L-204ENST00000444636 1781 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
SPTBN1Q01082 FHL2-205ENST00000393353 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
SPTBN1Q01082 STRN3-202ENST00000357479 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
SPTBN1Q01082 TREM2-203ENST00000373122 1012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
SPTBN1Q01082 UFM1-202ENST00000379649 846 ntTSL 4 BASIC13.93□□□□□ -0.18
SPTBN1Q01082 AC069218.1-201ENST00000435269 762 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
SPTBN1Q01082 IQSEC3P1-201ENST00000538799 536 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
SPTBN1Q01082 MIR4321-201ENST00000592276 80 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
SPTBN1Q01082 COL16A1-203ENST00000373672 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
SPTBN1Q01082 RNF165-204ENST00000587853 2011 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
SPTBN1Q01082 GGNBP2-212ENST00000613102 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
SPTBN1Q01082 ZFP41-201ENST00000330701 4797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
SPTBN1Q01082 AC027796.3-201ENST00000572919 4753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
SPTBN1Q01082 ZSCAN10-202ENST00000538082 2350 ntTSL 4 BASIC13.93□□□□□ -0.18
SPTBN1Q01082 TMEM140-201ENST00000275767 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
SPTBN1Q01082 SLC2A4-204ENST00000571308 1768 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
SPTBN1Q01082 COMMD5-203ENST00000450361 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
SPTBN1Q01082 SH3RF1-201ENST00000284637 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
SPTBN1Q01082 GTF3C4-201ENST00000372146 9043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
SPTBN1Q01082 MAGEA4-205ENST00000393920 1721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
SPTBN1Q01082 WDR45-239ENST00000634944 1745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
SPTBN1Q01082 PNPO-201ENST00000225573 2256 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
SPTBN1Q01082 ZSCAN30-212ENST00000639929 1305 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
SPTBN1Q01082 MICAL3-206ENST00000441493 9445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
SPTBN1Q01082 RASIP1-201ENST00000222145 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
SPTBN1Q01082 RAB38-201ENST00000243662 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
SPTBN1Q01082 CYTL1-201ENST00000307746 1003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
SPTBN1Q01082 MIR1202-201ENST00000408529 83 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
SPTBN1Q01082 AL627389.1-201ENST00000413508 1182 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
SPTBN1Q01082 AC092614.1-201ENST00000419640 909 ntTSL 3 BASIC13.93□□□□□ -0.18
SPTBN1Q01082 LINC01762-204ENST00000434879 436 ntTSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
SPTBN1Q01082 ZNF385A-213ENST00000551771 1111 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
SPTBN1Q01082 FGFR3P5-201ENST00000564496 886 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
SPTBN1Q01082 AC009486.1-201ENST00000569860 813 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
SPTBN1Q01082 AC079336.7-201ENST00000623428 1078 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
SPTBN1Q01082 GRN-214ENST00000589265 1632 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
SPTBN1Q01082 SGO1-201ENST00000263753 2338 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
SPTBN1Q01082 FDPS-202ENST00000368356 1431 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
SPTBN1Q01082 TCAP-201ENST00000309889 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
SPTBN1Q01082 COQ6-201ENST00000334571 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
SPTBN1Q01082 JPH4-202ENST00000397118 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
SPTBN1Q01082 CSRNP1-201ENST00000273153 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
SPTBN1Q01082 BAG3-201ENST00000369085 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
SPTBN1Q01082 TNFRSF11A-206ENST00000617039 3756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
SPTBN1Q01082 CPT2-210ENST00000637252 2739 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
SPTBN1Q01082 GCLM-201ENST00000370238 4857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
SPTBN1Q01082 WDTC1-202ENST00000361771 4275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
SPTBN1Q01082 RIMS4-201ENST00000372851 5203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
SPTBN1Q01082 PITPNM2-209ENST00000546049 1793 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49 ms