Protein–RNA interactions for Protein: Q00987

MDM2, E3 ubiquitin-protein ligase Mdm2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 491 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MDM2Q00987 KRT8P44-201ENST00000441609 1350 ntBASIC18.27■□□□□ 0.51
MDM2Q00987 AP002360.1-202ENST00000530460 2462 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
MDM2Q00987 IL11RA-215ENST00000602473 1388 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
MDM2Q00987 SBNO2-204ENST00000587024 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
MDM2Q00987 AMT-233ENST00000636522 1620 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
MDM2Q00987 MFSD5-202ENST00000534842 2038 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
MDM2Q00987 GABRB3-202ENST00000311550 5781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
MDM2Q00987 LINC00221-202ENST00000619530 1499 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
MDM2Q00987 METTL21A-203ENST00000411432 4805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
MDM2Q00987 AC022532.1-201ENST00000624563 1728 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
MDM2Q00987 SHANK1-201ENST00000293441 6643 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
MDM2Q00987 MAPT-215ENST00000574436 1326 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
MDM2Q00987 TIPRL-202ENST00000367833 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
MDM2Q00987 MIR137HG-202ENST00000424528 2639 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
MDM2Q00987 ACP2-201ENST00000256997 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
MDM2Q00987 AC013268.4-201ENST00000637413 2228 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
MDM2Q00987 OTX1-201ENST00000282549 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
MDM2Q00987 OTX1-202ENST00000366671 2861 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
MDM2Q00987 WWOX-201ENST00000355860 710 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
MDM2Q00987 SDHB-201ENST00000375499 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
MDM2Q00987 SELENOM-202ENST00000402395 1054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
MDM2Q00987 HIST1H2BPS3-201ENST00000419683 341 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
MDM2Q00987 SAPCD1-209ENST00000425424 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
MDM2Q00987 RASL12-203ENST00000434605 982 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
MDM2Q00987 HMGB2-203ENST00000446922 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
MDM2Q00987 C19orf24-202ENST00000469144 668 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
MDM2Q00987 SLC30A5-203ENST00000502979 681 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
MDM2Q00987 C11orf98-201ENST00000524958 654 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
MDM2Q00987 C6orf132-201ENST00000341865 6210 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
MDM2Q00987 CLPTM1L-216ENST00000630539 2032 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
MDM2Q00987 EXOC3L1-201ENST00000314586 2510 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
MDM2Q00987 RBCK1-201ENST00000353660 2511 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
MDM2Q00987 FAM184A-214ENST00000621231 4048 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
MDM2Q00987 FBXL5-201ENST00000341285 3385 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
MDM2Q00987 AC098591.1-201ENST00000381811 1613 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
MDM2Q00987 AC091100.1-201ENST00000558424 2354 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
MDM2Q00987 ZNF114-204ENST00000595607 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
MDM2Q00987 CCDC144A-202ENST00000340621 2214 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
MDM2Q00987 BTBD7P1-201ENST00000447253 1453 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
MDM2Q00987 UGDH-202ENST00000501493 2826 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
MDM2Q00987 SOX14-201ENST00000306087 2055 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
MDM2Q00987 PHB-201ENST00000300408 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
MDM2Q00987 TBC1D2B-201ENST00000300584 6067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
MDM2Q00987 CACFD1-207ENST00000542192 2754 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
MDM2Q00987 CBL-204ENST00000634840 4813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
MDM2Q00987 SNED1-202ENST00000342631 1930 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
MDM2Q00987 ATP6V1B2-201ENST00000276390 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
MDM2Q00987 RGS20-201ENST00000276500 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
MDM2Q00987 HIST1H2AC-202ENST00000377791 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
MDM2Q00987 CARNS1-201ENST00000307823 3942 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
MDM2Q00987 MAPT-205ENST00000351559 5811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
MDM2Q00987 TCF25-202ENST00000263347 2377 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
MDM2Q00987 CHID1-215ENST00000528581 1431 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
MDM2Q00987 AC073439.1-201ENST00000624121 1774 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
MDM2Q00987 CXorf38-201ENST00000327877 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
MDM2Q00987 MPP2-208ENST00000520305 2111 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
MDM2Q00987 ZSWIM8-213ENST00000603114 5919 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
MDM2Q00987 POLR1D-207ENST00000621089 1606 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
MDM2Q00987 PRM2-201ENST00000241808 680 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
MDM2Q00987 TRIM74-202ENST00000395244 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
MDM2Q00987 PRM2-202ENST00000435245 723 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
MDM2Q00987 TRIM73-204ENST00000447409 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
MDM2Q00987 SPDYE18-201ENST00000510091 1050 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
MDM2Q00987 FUZ-207ENST00000526575 482 ntTSL 4 BASIC18.25■□□□□ 0.51
MDM2Q00987 XRCC3-210ENST00000554974 575 ntTSL 4 BASIC18.25■□□□□ 0.51
MDM2Q00987 AC022167.4-201ENST00000570290 498 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
MDM2Q00987 AC073389.1-201ENST00000595595 795 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
MDM2Q00987 SLC35A1-202ENST00000369556 1720 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
MDM2Q00987 TRPV4-204ENST00000536838 2514 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
MDM2Q00987 KLK15-201ENST00000326856 1389 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
MDM2Q00987 CCDC144B-202ENST00000445752 2197 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
MDM2Q00987 CDIP1-206ENST00000563507 1463 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
MDM2Q00987 PRAL-201ENST00000624952 3286 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
MDM2Q00987 DGKZ-202ENST00000343674 3816 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
MDM2Q00987 CAPZB-204ENST00000375144 1568 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
MDM2Q00987 GGT6-204ENST00000574154 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
MDM2Q00987 CDK11B-209ENST00000629312 2496 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
MDM2Q00987 PPP3CA-203ENST00000394854 4685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
MDM2Q00987 PMS1-212ENST00000432292 3234 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
MDM2Q00987 AC009053.1-201ENST00000566802 2320 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
MDM2Q00987 AMZ2P1-202ENST00000430983 3425 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
MDM2Q00987 KLK8-211ENST00000600767 1324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
MDM2Q00987 ZBTB5-201ENST00000307750 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
MDM2Q00987 TMPRSS13-203ENST00000524993 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
MDM2Q00987 RIMS3-201ENST00000372683 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
MDM2Q00987 PLSCR4-204ENST00000446574 1442 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
MDM2Q00987 GLS2-201ENST00000311966 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
MDM2Q00987 KAZN-201ENST00000361144 3838 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
MDM2Q00987 AC005064.1-201ENST00000422488 2725 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
MDM2Q00987 LIPE-AS1-201ENST00000457234 1501 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
MDM2Q00987 AL589702.1-201ENST00000641229 1509 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
MDM2Q00987 GUCD1-204ENST00000407471 3482 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
MDM2Q00987 NCALD-217ENST00000521599 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
MDM2Q00987 SQSTM1-213ENST00000510187 1714 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
MDM2Q00987 POU4F2-201ENST00000281321 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
MDM2Q00987 FOXO3-202ENST00000406360 7341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
MDM2Q00987 GTF2H2C-201ENST00000380729 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
MDM2Q00987 KIAA1755-206ENST00000496900 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
MDM2Q00987 RAB23-202ENST00000468148 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
MDM2Q00987 ULK4-203ENST00000420927 1904 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.8 ms