Protein–RNA interactions for Protein: P60509

ERVPABLB-1, Endogenous retrovirus group PABLB member 1 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 514 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVPABLB-1P60509 DNASE2-201ENST00000222219 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ERVPABLB-1P60509 TMEM220-202ENST00000455996 1402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ERVPABLB-1P60509 HAUS3-204ENST00000506763 3166 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ERVPABLB-1P60509 MGME1-202ENST00000377709 1936 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ERVPABLB-1P60509 LSP1-204ENST00000406638 2640 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ERVPABLB-1P60509 SLC9A7P1-201ENST00000554295 3311 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
ERVPABLB-1P60509 KLHDC8A-201ENST00000367155 2928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ERVPABLB-1P60509 SYDE1-204ENST00000600440 3058 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ERVPABLB-1P60509 SRRM2-201ENST00000301740 9353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ERVPABLB-1P60509 PCTP-201ENST00000268896 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ERVPABLB-1P60509 FAM151A-201ENST00000302250 2005 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ERVPABLB-1P60509 CHSY3-201ENST00000305031 3850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ERVPABLB-1P60509 ELF2-201ENST00000358635 3036 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ERVPABLB-1P60509 C10orf107-201ENST00000330194 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ERVPABLB-1P60509 MYZAP-202ENST00000380565 2181 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ERVPABLB-1P60509 PHB-201ENST00000300408 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ERVPABLB-1P60509 CES1-202ENST00000361503 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ERVPABLB-1P60509 ZFP1-209ENST00000570010 1457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ERVPABLB-1P60509 AC104640.1-201ENST00000562617 2109 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
ERVPABLB-1P60509 CRAT-201ENST00000318080 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ERVPABLB-1P60509 RASA4B-202ENST00000465829 2931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ERVPABLB-1P60509 STAT3-201ENST00000264657 5047 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ERVPABLB-1P60509 SNAP47-213ENST00000617596 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ERVPABLB-1P60509 CTHRC1-201ENST00000330295 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ERVPABLB-1P60509 DDT-201ENST00000350608 671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ERVPABLB-1P60509 NAA10-201ENST00000370009 837 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ERVPABLB-1P60509 NAA10-203ENST00000370015 1002 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ERVPABLB-1P60509 AC087499.6-201ENST00000411576 835 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
ERVPABLB-1P60509 ELFN1-AS1-202ENST00000453348 637 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ERVPABLB-1P60509 AC082651.1-201ENST00000478468 832 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ERVPABLB-1P60509 MRNIP-212ENST00000520698 902 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ERVPABLB-1P60509 CSF1R-209ENST00000543093 921 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ERVPABLB-1P60509 AC013565.3-201ENST00000565547 450 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ERVPABLB-1P60509 AC022167.4-201ENST00000570290 498 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ERVPABLB-1P60509 HEXIM2-206ENST00000591576 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ERVPABLB-1P60509 AL365330.1-201ENST00000607459 531 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
ERVPABLB-1P60509 AC017083.2-201ENST00000608069 979 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
ERVPABLB-1P60509 MIR6799-201ENST00000620297 69 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
ERVPABLB-1P60509 AC092811.2-201ENST00000632561 559 ntTSL 4 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ERVPABLB-1P60509 ADAMTS13-206ENST00000371929 4934 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ERVPABLB-1P60509 SLC43A1-204ENST00000528450 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ERVPABLB-1P60509 C14orf79-205ENST00000549240 2503 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ERVPABLB-1P60509 GP5-201ENST00000401815 3534 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ERVPABLB-1P60509 CRK-202ENST00000398970 3675 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ERVPABLB-1P60509 ATP2C1-224ENST00000533801 3690 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ERVPABLB-1P60509 C4orf50-202ENST00000531445 6860 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ERVPABLB-1P60509 CCDC136-212ENST00000487361 2268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ERVPABLB-1P60509 VIPR1-204ENST00000438259 2427 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ERVPABLB-1P60509 CPEB2-204ENST00000382401 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ERVPABLB-1P60509 ACP2-201ENST00000256997 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ERVPABLB-1P60509 SERAC1-201ENST00000367101 1907 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ERVPABLB-1P60509 KDM6A-202ENST00000382899 5789 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ERVPABLB-1P60509 MSI2-204ENST00000442934 1624 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ERVPABLB-1P60509 PRR19-204ENST00000598490 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ERVPABLB-1P60509 BTBD7P1-201ENST00000447253 1453 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
ERVPABLB-1P60509 FBXO22-202ENST00000453211 1486 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ERVPABLB-1P60509 STK39-201ENST00000355999 3820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ERVPABLB-1P60509 CASK-202ENST00000378158 3848 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ERVPABLB-1P60509 ABHD18-202ENST00000398965 2177 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ERVPABLB-1P60509 MRPL49-201ENST00000279242 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ERVPABLB-1P60509 SLC22A23-210ENST00000490273 2043 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ERVPABLB-1P60509 ATP6V1B2-201ENST00000276390 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ERVPABLB-1P60509 RNF34-202ENST00000392464 1722 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ERVPABLB-1P60509 ANKRD24-206ENST00000600132 4026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ERVPABLB-1P60509 KCNMA1-201ENST00000286627 6194 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ERVPABLB-1P60509 CDC42BPG-201ENST00000342711 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ERVPABLB-1P60509 EML3-202ENST00000394773 3256 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ERVPABLB-1P60509 WWOX-201ENST00000355860 710 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ERVPABLB-1P60509 AMACR-202ENST00000382068 862 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ERVPABLB-1P60509 AP1S3-202ENST00000396653 589 ntTSL 4 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ERVPABLB-1P60509 PQLC3-202ENST00000402361 696 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ERVPABLB-1P60509 LRP5L-201ENST00000402785 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ERVPABLB-1P60509 DFFBP1-201ENST00000433250 979 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
ERVPABLB-1P60509 MACROD2-AS1-201ENST00000439451 1230 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ERVPABLB-1P60509 AC011495.1-201ENST00000498085 584 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
ERVPABLB-1P60509 PRYP6-201ENST00000514804 343 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
ERVPABLB-1P60509 LINC01605-204ENST00000522718 1093 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ERVPABLB-1P60509 LINC00824-206ENST00000523173 920 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ERVPABLB-1P60509 NUBP2-208ENST00000565987 1049 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ERVPABLB-1P60509 LITAF-210ENST00000571976 548 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ERVPABLB-1P60509 LITAF-214ENST00000574703 486 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ERVPABLB-1P60509 AC008738.7-201ENST00000609744 511 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
ERVPABLB-1P60509 AL162274.1-201ENST00000617191 1098 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
ERVPABLB-1P60509 COL4A3BP-204ENST00000405807 2843 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ERVPABLB-1P60509 AL596257.1-201ENST00000641463 2694 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
ERVPABLB-1P60509 AC126177.1-201ENST00000547829 2218 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
ERVPABLB-1P60509 TRIM33-201ENST00000358465 8339 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ERVPABLB-1P60509 USP27X-201ENST00000621775 2618 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ERVPABLB-1P60509 ATP2A3-206ENST00000397043 3197 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ERVPABLB-1P60509 AP002360.1-202ENST00000530460 2462 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ERVPABLB-1P60509 AFAP1L2-202ENST00000369271 3964 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ERVPABLB-1P60509 STAT1-202ENST00000392322 2716 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ERVPABLB-1P60509 NOTO-201ENST00000398468 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ERVPABLB-1P60509 SUN2-203ENST00000406622 2725 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ERVPABLB-1P60509 C1QTNF6-202ENST00000397110 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ERVPABLB-1P60509 MCF2L2-208ENST00000473233 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ERVPABLB-1P60509 MON2-203ENST00000546600 6130 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
ERVPABLB-1P60509 ELFN1-202ENST00000561626 3742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
ERVPABLB-1P60509 SLCO2B1-205ENST00000525650 2121 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
ERVPABLB-1P60509 EI24-214ENST00000620753 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.7 ms