Protein–RNA interactions for Protein: P56159

GFRA1, GDNF family receptor alpha-1, humanhuman

Predictions only

Length 465 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GFRA1P56159 TMEM261P1-201ENST00000604899 340 ntBASIC14.17□□□□□ -0.14
GFRA1P56159 AC010735.2-201ENST00000607970 584 ntTSL 4 BASIC14.17□□□□□ -0.14
GFRA1P56159 RPP40-207ENST00000618533 1056 ntTSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
GFRA1P56159 ZIC5-201ENST00000267294 4639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
GFRA1P56159 SLC45A1-202ENST00000471889 2784 ntTSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
GFRA1P56159 C12orf65-201ENST00000253233 2073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
GFRA1P56159 EFNB3-201ENST00000226091 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
GFRA1P56159 RNF32-204ENST00000392743 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
GFRA1P56159 MUTYH-209ENST00000448481 1706 ntTSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
GFRA1P56159 KLK15-201ENST00000326856 1389 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
GFRA1P56159 FAM218A-201ENST00000513876 2175 ntAPPRIS P1 BASIC14.17□□□□□ -0.14
GFRA1P56159 AL139130.1-201ENST00000451362 5586 ntTSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
GFRA1P56159 MLLT6-210ENST00000620609 2714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
GFRA1P56159 PTK7-202ENST00000230419 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
GFRA1P56159 CISH-201ENST00000348721 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
GFRA1P56159 NDUFS2-201ENST00000367993 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
GFRA1P56159 PLAA-205ENST00000520884 2041 ntTSL 2 BASIC14.17□□□□□ -0.14
GFRA1P56159 GPR61-206ENST00000616874 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.17□□□□□ -0.14
GFRA1P56159 MAGEA2-202ENST00000598543 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
GFRA1P56159 UNC5C-203ENST00000506749 2220 ntTSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
GFRA1P56159 CAAP1-201ENST00000333916 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
GFRA1P56159 HMOX2-205ENST00000458134 1797 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
GFRA1P56159 MYEOV-203ENST00000535407 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.16□□□□□ -0.14
GFRA1P56159 ADRB3-201ENST00000345060 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
GFRA1P56159 CU639417.3-201ENST00000624240 1404 ntBASIC14.16□□□□□ -0.14
GFRA1P56159 ZBTB9-201ENST00000395064 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
GFRA1P56159 MAP3K9-201ENST00000381250 4025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
GFRA1P56159 NELFA-203ENST00000411638 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
GFRA1P56159 SRF-201ENST00000265354 4202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
GFRA1P56159 C5orf24-204ENST00000504727 2923 ntTSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
GFRA1P56159 PRKD2-216ENST00000601806 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
GFRA1P56159 PLEKHB1-202ENST00000354190 2380 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
GFRA1P56159 VGLL2-202ENST00000352536 1709 ntTSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
GFRA1P56159 SLC39A8-201ENST00000356736 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
GFRA1P56159 WASF1-206ENST00000392588 3122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
GFRA1P56159 NBPF11-205ENST00000615281 5494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
GFRA1P56159 SGPP1-201ENST00000247225 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
GFRA1P56159 NPRL3-201ENST00000399953 2784 ntTSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
GFRA1P56159 DEPDC7-202ENST00000311388 2012 ntTSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
GFRA1P56159 CTSB-228ENST00000533455 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
GFRA1P56159 EEF1B2-201ENST00000236957 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
GFRA1P56159 FOXR1-201ENST00000317011 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
GFRA1P56159 TMEM239-202ENST00000380585 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
GFRA1P56159 MIOX-203ENST00000395733 1021 ntTSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
GFRA1P56159 GSAP-205ENST00000430584 600 ntTSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
GFRA1P56159 AL845321.1-202ENST00000432011 786 ntTSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
GFRA1P56159 HMGB2-203ENST00000446922 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
GFRA1P56159 KRT18P43-201ENST00000469825 1281 ntBASIC14.16□□□□□ -0.14
GFRA1P56159 LACTB2-203ENST00000522447 1034 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.16□□□□□ -0.14
GFRA1P56159 ZSCAN2-213ENST00000541040 965 ntTSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
GFRA1P56159 SLC8B1-206ENST00000549069 1058 ntTSL 2 BASIC14.16□□□□□ -0.14
GFRA1P56159 CR383656.12-201ENST00000549567 513 ntBASIC14.16□□□□□ -0.14
GFRA1P56159 CTBP2P3-201ENST00000585629 1255 ntBASIC14.16□□□□□ -0.14
GFRA1P56159 NOP53-AS1-201ENST00000602048 540 ntTSL 4 BASIC14.16□□□□□ -0.14
GFRA1P56159 IFI27-210ENST00000616764 716 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.16□□□□□ -0.14
GFRA1P56159 NDUFS7-218ENST00000618074 688 ntTSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
GFRA1P56159 IFI27-213ENST00000620066 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
GFRA1P56159 NDUFS7-219ENST00000620479 754 ntTSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
GFRA1P56159 AL031056.2-201ENST00000637957 1217 ntTSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
GFRA1P56159 DDC-202ENST00000380984 1366 ntTSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
GFRA1P56159 C5orf24-202ENST00000394976 5065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
GFRA1P56159 CCDC71L-202ENST00000523505 4232 ntAPPRIS P2 BASIC14.16□□□□□ -0.14
GFRA1P56159 PIPOX-201ENST00000323372 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
GFRA1P56159 C1RL-210ENST00000544702 1569 ntTSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
GFRA1P56159 AGFG1-202ENST00000373671 1669 ntTSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
GFRA1P56159 RFC5-204ENST00000454402 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
GFRA1P56159 MUTYH-211ENST00000456914 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
GFRA1P56159 DNAAF2-202ENST00000406043 2819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
GFRA1P56159 KRT15-201ENST00000254043 5237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
GFRA1P56159 RAB35-201ENST00000229340 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
GFRA1P56159 CPEB2-201ENST00000259997 5612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
GFRA1P56159 C14orf93-207ENST00000397382 1986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
GFRA1P56159 LFNG-204ENST00000402045 2058 ntTSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
GFRA1P56159 CDKN1A-203ENST00000405375 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
GFRA1P56159 TOM1-206ENST00000425375 2252 ntTSL 2 BASIC14.16□□□□□ -0.14
GFRA1P56159 CPXM1-201ENST00000380605 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
GFRA1P56159 KIAA2026-202ENST00000399933 6988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
GFRA1P56159 PHRF1-201ENST00000264555 5523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
GFRA1P56159 TMED1-201ENST00000214869 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
GFRA1P56159 EIF2B4-205ENST00000445933 1608 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
GFRA1P56159 MINK1-202ENST00000355280 4961 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
GFRA1P56159 HTR1B-201ENST00000369947 2021 ntAPPRIS P1 BASIC14.15□□□□□ -0.14
GFRA1P56159 AMN1-201ENST00000281471 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
GFRA1P56159 RRM2B-201ENST00000251810 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
GFRA1P56159 CACNA1G-202ENST00000354983 8138 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
GFRA1P56159 KIAA1147-202ENST00000536163 7296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
GFRA1P56159 PLPPR4-202ENST00000370185 5369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
GFRA1P56159 ARHGAP26-202ENST00000378004 9200 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
GFRA1P56159 ABHD3-201ENST00000289119 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
GFRA1P56159 FKBP1C-201ENST00000370659 1579 ntAPPRIS P1 BASIC14.15□□□□□ -0.14
GFRA1P56159 WSCD1-208ENST00000573634 1573 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
GFRA1P56159 CD300A-205ENST00000577511 1459 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
GFRA1P56159 CD1B-201ENST00000368168 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
GFRA1P56159 RERG-209ENST00000546331 1383 ntTSL 2 BASIC14.15□□□□□ -0.14
GFRA1P56159 AL355493.2-201ENST00000568270 1395 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
GFRA1P56159 SCAND1-201ENST00000305978 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
GFRA1P56159 SPATC1L-202ENST00000330205 1182 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
GFRA1P56159 LCE3A-201ENST00000335674 270 ntAPPRIS P1 BASIC14.15□□□□□ -0.14
GFRA1P56159 NSL1-201ENST00000366976 722 ntTSL 2 BASIC14.15□□□□□ -0.14
GFRA1P56159 SDHB-201ENST00000375499 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33 ms