Protein–RNA interactions for Protein: P51532

SMARCA4, Transcription activator BRG1, humanhuman

Predictions only

Length 1,647 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMARCA4P51532 SYVN1-201ENST00000294256 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
SMARCA4P51532 FAM92B-201ENST00000539556 1898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
SMARCA4P51532 RCL1-204ENST00000381750 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
SMARCA4P51532 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
SMARCA4P51532 KLC4-204ENST00000453940 1945 ntTSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
SMARCA4P51532 PHF20L1-201ENST00000220847 3297 ntTSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
SMARCA4P51532 LRP3-201ENST00000253193 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
SMARCA4P51532 TMEM14B-202ENST00000379542 975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
SMARCA4P51532 AC007952.2-201ENST00000399091 1176 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
SMARCA4P51532 AL627389.1-201ENST00000413508 1182 ntBASIC27.65■■■□□ 2.02
SMARCA4P51532 AC108134.4-201ENST00000570700 302 ntTSL 3 BASIC27.65■■■□□ 2.02
SMARCA4P51532 TMEM205-216ENST00000593256 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
SMARCA4P51532 C20orf141-202ENST00000603872 580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
SMARCA4P51532 HDDC2-204ENST00000608295 879 ntTSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
SMARCA4P51532 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
SMARCA4P51532 AC104667.2-202ENST00000452801 1301 ntTSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
SMARCA4P51532 RASL10B-201ENST00000603017 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
SMARCA4P51532 LINC02405-201ENST00000512624 1361 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
SMARCA4P51532 CTNNBL1-209ENST00000621317 1990 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
SMARCA4P51532 PRPF39-201ENST00000355765 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
SMARCA4P51532 AC004899.1-201ENST00000424687 1714 ntBASIC27.65■■■□□ 2.02
SMARCA4P51532 HSD17B6-205ENST00000554643 1751 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.02
SMARCA4P51532 LY6K-205ENST00000522591 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.02
SMARCA4P51532 POU4F2-201ENST00000281321 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
SMARCA4P51532 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
SMARCA4P51532 C1orf43-202ENST00000362076 1551 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
SMARCA4P51532 GSTT2B-201ENST00000290765 1099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
SMARCA4P51532 AGTRAP-206ENST00000452018 809 ntTSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.02
SMARCA4P51532 AC011603.1-201ENST00000553174 717 ntTSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.02
SMARCA4P51532 EID1-202ENST00000560490 584 ntTSL 3 BASIC27.64■■■□□ 2.02
SMARCA4P51532 FBXL12-204ENST00000586469 544 ntTSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.02
SMARCA4P51532 DYRK1B-208ENST00000601972 772 ntTSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.02
SMARCA4P51532 SLC37A2-203ENST00000403796 2910 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.02
SMARCA4P51532 RNASE1-202ENST00000397967 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
SMARCA4P51532 P2RY6-202ENST00000393590 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
SMARCA4P51532 RNF128-201ENST00000255499 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
SMARCA4P51532 CDH22-203ENST00000537909 3902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.02
SMARCA4P51532 CHTOP-203ENST00000368690 2165 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
SMARCA4P51532 ASAH1-254ENST00000637636 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.01
SMARCA4P51532 EVX1-202ENST00000496902 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
SMARCA4P51532 SLC38A5-213ENST00000620913 1993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.01
SMARCA4P51532 TMBIM1-201ENST00000258412 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
SMARCA4P51532 CAPZB-201ENST00000264202 858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
SMARCA4P51532 C2orf15-202ENST00000409684 1058 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.63■■■□□ 2.01
SMARCA4P51532 ISCA2P1-201ENST00000425548 448 ntBASIC27.63■■■□□ 2.01
SMARCA4P51532 ANGPTL8-204ENST00000616433 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
SMARCA4P51532 AL162426.1-201ENST00000624141 743 ntBASIC27.63■■■□□ 2.01
SMARCA4P51532 KIFC3-201ENST00000379655 3427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
SMARCA4P51532 SLC7A2-205ENST00000522656 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
SMARCA4P51532 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
SMARCA4P51532 FBXL5-202ENST00000412094 2837 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
SMARCA4P51532 FETUB-207ENST00000450521 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
SMARCA4P51532 AC084364.1-201ENST00000551967 1556 ntBASIC27.63■■■□□ 2.01
SMARCA4P51532 HDAC10-222ENST00000626012 2607 ntTSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
SMARCA4P51532 ALOX12-AS1-201ENST00000399540 1730 ntTSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
SMARCA4P51532 CAMK2G-205ENST00000372765 1822 ntTSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
SMARCA4P51532 TCL1B-201ENST00000340722 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
SMARCA4P51532 IGHV3-13-201ENST00000390602 430 ntAPPRIS P1 BASIC27.63■■■□□ 2.01
SMARCA4P51532 AL353770.1-201ENST00000614915 403 ntBASIC27.63■■■□□ 2.01
SMARCA4P51532 CNNM3-202ENST00000377060 3308 ntTSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
SMARCA4P51532 GUCA1A-203ENST00000394237 2233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
SMARCA4P51532 AC069224.1-201ENST00000566372 1715 ntBASIC27.62■■■□□ 2.01
SMARCA4P51532 AC055811.4-201ENST00000624039 1754 ntBASIC27.62■■■□□ 2.01
SMARCA4P51532 TNXB-204ENST00000479795 2742 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
SMARCA4P51532 RPA3-201ENST00000223129 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
SMARCA4P51532 WT1-203ENST00000379079 2466 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
SMARCA4P51532 MBD3L5-201ENST00000329753 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
SMARCA4P51532 KRTAP19-7-201ENST00000334849 440 ntAPPRIS P1 BASIC27.62■■■□□ 2.01
SMARCA4P51532 BUD31-202ENST00000403633 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
SMARCA4P51532 MIR663AHG-201ENST00000427348 1213 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
SMARCA4P51532 C9orf116-205ENST00000429260 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
SMARCA4P51532 FKBP2-203ENST00000449942 613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
SMARCA4P51532 AC012618.1-201ENST00000461223 412 ntBASIC27.62■■■□□ 2.01
SMARCA4P51532 GLYCTK-204ENST00000471180 992 ntTSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
SMARCA4P51532 AC005865.1-202ENST00000543036 641 ntTSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
SMARCA4P51532 AL031665.1-201ENST00000619766 572 ntTSL 4 BASIC27.62■■■□□ 2.01
SMARCA4P51532 KRCC1-201ENST00000347055 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
SMARCA4P51532 PHYH-203ENST00000396920 1829 ntTSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
SMARCA4P51532 C16orf89-203ENST00000474471 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
SMARCA4P51532 DNM1-202ENST00000372923 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
SMARCA4P51532 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
SMARCA4P51532 NOV-201ENST00000259526 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
SMARCA4P51532 RHD-203ENST00000357542 1387 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
SMARCA4P51532 MFSD14A-201ENST00000370152 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
SMARCA4P51532 TRIM27-201ENST00000377194 2686 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
SMARCA4P51532 AC131097.2-203ENST00000401641 507 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
SMARCA4P51532 AL590617.2-201ENST00000432673 917 ntTSL 3 BASIC27.61■■■□□ 2.01
SMARCA4P51532 GHRLOS-201ENST00000439539 1708 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
SMARCA4P51532 MESTP3-201ENST00000503460 968 ntBASIC27.61■■■□□ 2.01
SMARCA4P51532 AC104561.3-201ENST00000518590 715 ntTSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
SMARCA4P51532 FAM86B1-218ENST00000534520 808 ntTSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
SMARCA4P51532 AP000593.2-201ENST00000542775 1433 ntBASIC27.61■■■□□ 2.01
SMARCA4P51532 MIR4683-201ENST00000579659 81 ntBASIC27.61■■■□□ 2.01
SMARCA4P51532 MIR4754-201ENST00000582477 89 ntBASIC27.61■■■□□ 2.01
SMARCA4P51532 SRD5A3-AS1-211ENST00000599135 737 ntTSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
SMARCA4P51532 LINC01517-203ENST00000616194 908 ntTSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
SMARCA4P51532 MREG-205ENST00000620139 2618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
SMARCA4P51532 HRASLS5-206ENST00000540857 3032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
SMARCA4P51532 FLJ38576-201ENST00000623820 2459 ntBASIC27.61■■■□□ 2.01
SMARCA4P51532 ZDHHC13-202ENST00000446113 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.3 ms