Protein–RNA interactions for Protein: P49848

TAF6, Transcription initiation factor TFIID subunit 6, humanhuman

Predictions only

Length 677 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TAF6P49848 NFATC4-222ENST00000555590 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
TAF6P49848 BATF2-201ENST00000301887 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
TAF6P49848 PTPRA-205ENST00000399903 3337 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
TAF6P49848 NTRK2-206ENST00000376213 5560 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
TAF6P49848 KLF10-202ENST00000395884 3659 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
TAF6P49848 HIST1H2AC-203ENST00000602637 1462 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
TAF6P49848 SEMA5B-211ENST00000616742 4933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
TAF6P49848 MUTYH-209ENST00000448481 1706 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
TAF6P49848 CALCB-202ENST00000523376 2258 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
TAF6P49848 SLIT1-204ENST00000371070 4564 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
TAF6P49848 MSC-AS1-208ENST00000522519 1537 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
TAF6P49848 EEF1B2-201ENST00000236957 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
TAF6P49848 FIBP-201ENST00000338369 1261 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
TAF6P49848 LINC01116-202ENST00000339037 838 ntTSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
TAF6P49848 AC098614.1-201ENST00000368528 745 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
TAF6P49848 NGF-201ENST00000369512 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
TAF6P49848 ADIRF-201ENST00000372013 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
TAF6P49848 GRAP-202ENST00000395635 834 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
TAF6P49848 RN7SL399P-201ENST00000471648 279 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
TAF6P49848 C5orf66-202ENST00000507641 547 ntTSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
TAF6P49848 AP003068.1-201ENST00000528887 544 ntTSL 4 BASIC16.88■□□□□ 0.29
TAF6P49848 IL32-215ENST00000529550 772 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
TAF6P49848 RBM7-207ENST00000544582 692 ntTSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
TAF6P49848 SLC8B1-206ENST00000549069 1058 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
TAF6P49848 AC008770.3-202ENST00000591944 567 ntTSL 4 BASIC16.88■□□□□ 0.29
TAF6P49848 IFI27-210ENST00000616764 716 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
TAF6P49848 IFI27-213ENST00000620066 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
TAF6P49848 HOXD3-201ENST00000249440 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
TAF6P49848 CRAMP1-202ENST00000397412 7772 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
TAF6P49848 RGP1-201ENST00000378078 7018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
TAF6P49848 MPPE1-211ENST00000588072 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
TAF6P49848 PLAGL1-211ENST00000625622 3216 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
TAF6P49848 PIPOX-201ENST00000323372 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
TAF6P49848 TNKS1BP1-207ENST00000532437 5952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
TAF6P49848 DHX30-205ENST00000445061 4065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
TAF6P49848 TOR4A-201ENST00000357503 4148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
TAF6P49848 TSEN2-207ENST00000454502 1909 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
TAF6P49848 RERG-209ENST00000546331 1383 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
TAF6P49848 AC007326.5-201ENST00000640084 1382 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
TAF6P49848 CAAP1-201ENST00000333916 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
TAF6P49848 CNTLN-202ENST00000380647 5576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
TAF6P49848 RFC5-204ENST00000454402 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
TAF6P49848 PDCD2-208ENST00000541970 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
TAF6P49848 FDPS-202ENST00000368356 1431 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
TAF6P49848 PRKD2-216ENST00000601806 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
TAF6P49848 POLR3H-202ENST00000355209 4416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
TAF6P49848 CLK3P2-201ENST00000427566 1453 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
TAF6P49848 DZIP1L-204ENST00000469243 2107 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
TAF6P49848 PNLDC1-202ENST00000392167 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
TAF6P49848 TBC1D9B-202ENST00000356834 5173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
TAF6P49848 UNC5C-203ENST00000506749 2220 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
TAF6P49848 RABL2A-203ENST00000393166 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
TAF6P49848 AC098850.1-201ENST00000419919 790 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
TAF6P49848 LINC02356-202ENST00000552663 314 ntTSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
TAF6P49848 SPATA8-AS1-201ENST00000558722 465 ntTSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
TAF6P49848 LITAF-218ENST00000576036 603 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.87■□□□□ 0.29
TAF6P49848 AC079336.2-201ENST00000578408 927 ntTSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
TAF6P49848 AC027575.2-201ENST00000585258 1295 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
TAF6P49848 YIF1B-214ENST00000591784 940 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
TAF6P49848 EIF2B4-205ENST00000445933 1608 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
TAF6P49848 PLAA-205ENST00000520884 2041 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
TAF6P49848 LINC01529-205ENST00000637365 2000 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
TAF6P49848 LINC02199-201ENST00000506655 2702 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
TAF6P49848 RAP1GDS1-203ENST00000380158 2085 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
TAF6P49848 PJA1-201ENST00000361478 2755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
TAF6P49848 ZMYND12-201ENST00000372565 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
TAF6P49848 HMOX2-205ENST00000458134 1797 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
TAF6P49848 FAM76B-201ENST00000358780 3952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
TAF6P49848 PDE4DIP-201ENST00000313431 5676 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
TAF6P49848 TK2-207ENST00000544898 3441 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
TAF6P49848 FRA10AC1-201ENST00000359204 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
TAF6P49848 PIEZO1-201ENST00000301015 8072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
TAF6P49848 EDN3-205ENST00000395654 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
TAF6P49848 RTL6-201ENST00000341255 5495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
TAF6P49848 PITPNA-201ENST00000313486 3912 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
TAF6P49848 DMTN-209ENST00000517600 1569 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
TAF6P49848 WSCD1-208ENST00000573634 1573 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
TAF6P49848 PLEKHB1-202ENST00000354190 2380 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
TAF6P49848 FBXO18-201ENST00000362091 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
TAF6P49848 KDM5C-204ENST00000375401 6031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
TAF6P49848 NEUROD1-201ENST00000295108 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
TAF6P49848 MUTYH-211ENST00000456914 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
TAF6P49848 MAGEA2-202ENST00000598543 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
TAF6P49848 RPL18A-201ENST00000222247 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
TAF6P49848 GOLIM4-201ENST00000309027 2100 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
TAF6P49848 STMN1-201ENST00000357865 1137 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
TAF6P49848 C10orf35-201ENST00000373279 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
TAF6P49848 WDR45-208ENST00000396681 1146 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
TAF6P49848 AP006294.1-201ENST00000415407 339 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
TAF6P49848 AC005034.1-201ENST00000426657 489 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
TAF6P49848 GSAP-205ENST00000430584 600 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
TAF6P49848 AL845321.1-202ENST00000432011 786 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
TAF6P49848 LINC00473-201ENST00000444465 798 ntTSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
TAF6P49848 KRT18P43-201ENST00000469825 1281 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
TAF6P49848 ELK1P1-201ENST00000485699 580 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
TAF6P49848 AC008378.1-201ENST00000521251 496 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
TAF6P49848 AC108134.3-202ENST00000571404 1207 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
TAF6P49848 AL157392.3-207ENST00000601758 744 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
TAF6P49848 NOP53-AS1-201ENST00000602048 540 ntTSL 4 BASIC16.86■□□□□ 0.29
TAF6P49848 MIR8072-201ENST00000614241 80 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.4 ms