Protein–RNA interactions for Protein: P48995

TRPC1, Short transient receptor potential channel 1, humanhuman

Predictions only

Length 793 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRPC1P48995 SLC17A5-201ENST00000355773 3455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TRPC1P48995 FBXL5-201ENST00000341285 3385 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TRPC1P48995 VGLL4-211ENST00000430365 1377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TRPC1P48995 TNS2-201ENST00000314250 5010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TRPC1P48995 KCP-208ENST00000620378 4515 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TRPC1P48995 MEGF11-203ENST00000409699 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TRPC1P48995 LUC7L3-202ENST00000393227 2284 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TRPC1P48995 SLC6A2-204ENST00000561820 2268 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TRPC1P48995 C7orf43-207ENST00000457641 2005 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TRPC1P48995 MAGEA12-202ENST00000393869 1761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TRPC1P48995 TNFSF8-203ENST00000618336 1523 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TRPC1P48995 GINS2-201ENST00000253462 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TRPC1P48995 CD82-202ENST00000342935 967 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TRPC1P48995 CCNL2-202ENST00000408918 1186 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TRPC1P48995 AL354836.1-201ENST00000414042 681 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TRPC1P48995 APCDD1L-AS1-201ENST00000420279 555 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TRPC1P48995 MDH2-205ENST00000461263 648 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TRPC1P48995 USP30-AS1-201ENST00000478808 656 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TRPC1P48995 AC019257.1-202ENST00000521498 445 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TRPC1P48995 CYB561D1-208ENST00000528785 1271 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TRPC1P48995 AC109635.5-201ENST00000533593 962 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
TRPC1P48995 BORCS8-206ENST00000585679 801 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TRPC1P48995 AC243773.2-203ENST00000612281 640 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TRPC1P48995 CDC42EP4-209ENST00000630622 240 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TRPC1P48995 AC134684.3-201ENST00000641758 218 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
TRPC1P48995 EPB41L3-206ENST00000544123 3972 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TRPC1P48995 AP4B1-204ENST00000369569 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TRPC1P48995 AC096667.1-201ENST00000640078 3465 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TRPC1P48995 FAM53C-202ENST00000434981 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TRPC1P48995 SLC7A4-201ENST00000382932 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TRPC1P48995 AC009053.1-201ENST00000566802 2320 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TRPC1P48995 IL17RA-204ENST00000612619 8506 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TRPC1P48995 SEMA5B-201ENST00000195173 4523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TRPC1P48995 TMEM220-202ENST00000455996 1402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TRPC1P48995 GGT6-204ENST00000574154 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TRPC1P48995 AP1M1-202ENST00000429941 1578 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TRPC1P48995 FUBP1-203ENST00000370768 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TRPC1P48995 FAM131A-207ENST00000450976 1335 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TRPC1P48995 SLC22A5-203ENST00000435065 1746 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TRPC1P48995 TMEM139-205ENST00000410004 2114 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TRPC1P48995 C14orf79-205ENST00000549240 2503 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TRPC1P48995 TK2-203ENST00000451102 3738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TRPC1P48995 SLC6A8-204ENST00000430077 1892 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TRPC1P48995 CICP4-201ENST00000447359 2812 ntBASIC15.39■□□□□ 0.06
TRPC1P48995 CCDC144B-202ENST00000445752 2197 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TRPC1P48995 MGEA5-201ENST00000357797 3263 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TRPC1P48995 TPD52L2-205ENST00000352482 2339 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TRPC1P48995 TPD52L2-210ENST00000615907 2310 ntTSL 4 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TRPC1P48995 CLDN6-201ENST00000328796 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TRPC1P48995 SNED1-202ENST00000342631 1930 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TRPC1P48995 NDOR1-202ENST00000371521 2497 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TRPC1P48995 ARFGAP1-212ENST00000519604 3191 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TRPC1P48995 ATP11B-201ENST00000323116 7325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TRPC1P48995 PIP4K2C-207ENST00000550465 1532 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TRPC1P48995 RALGPS2-204ENST00000367635 5834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TRPC1P48995 TGFB1-201ENST00000221930 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TRPC1P48995 ACP2-201ENST00000256997 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TRPC1P48995 KCNT1-206ENST00000486577 3760 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TRPC1P48995 MBD1-212ENST00000585672 2532 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TRPC1P48995 CT62-201ENST00000449977 1825 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TRPC1P48995 SPACA4-201ENST00000321762 972 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TRPC1P48995 C22orf39-201ENST00000333059 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TRPC1P48995 KCNIP2-208ENST00000370046 923 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TRPC1P48995 PNRC2-202ENST00000374468 814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TRPC1P48995 PARK7-203ENST00000377491 977 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TRPC1P48995 CHMP3-203ENST00000409225 1099 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TRPC1P48995 COA5-202ENST00000409997 557 ntTSL 4 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TRPC1P48995 AC004967.1-201ENST00000453589 447 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
TRPC1P48995 AC074386.1-202ENST00000463561 864 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
TRPC1P48995 MRPL20-203ENST00000482352 1049 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TRPC1P48995 REEP2-206ENST00000506158 1021 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TRPC1P48995 HOXC-AS3-202ENST00000513165 533 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TRPC1P48995 IL18BP-211ENST00000531053 853 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TRPC1P48995 ACYP2-209ENST00000607452 831 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TRPC1P48995 TVP23A-210ENST00000612195 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TRPC1P48995 FHDC1-202ENST00000511601 6583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TRPC1P48995 TMEM30A-201ENST00000230461 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TRPC1P48995 EDIL3-201ENST00000296591 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TRPC1P48995 SLC22A6-203ENST00000421062 1560 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TRPC1P48995 RER1-209ENST00000605895 3044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TRPC1P48995 C2orf48-201ENST00000381786 1897 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TRPC1P48995 ZKSCAN2-201ENST00000328086 7523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TRPC1P48995 TMEM209-202ENST00000462753 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TRPC1P48995 AC073347.1-201ENST00000421633 2643 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
TRPC1P48995 USP25-201ENST00000285679 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TRPC1P48995 IQCE-204ENST00000404984 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TRPC1P48995 NTRK3-203ENST00000357724 2980 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TRPC1P48995 PITPNM2-201ENST00000280562 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TRPC1P48995 SYT5-201ENST00000354308 3792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TRPC1P48995 DHX36-201ENST00000308361 3487 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TRPC1P48995 NPY5R-203ENST00000515560 3183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TRPC1P48995 IL6ST-209ENST00000502326 3007 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TRPC1P48995 ZNF398-203ENST00000483892 2121 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TRPC1P48995 HIST1H2AC-202ENST00000377791 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TRPC1P48995 WDR70-202ENST00000504564 1526 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TRPC1P48995 WDR45-234ENST00000634838 1545 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TRPC1P48995 ICAM4-203ENST00000393717 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TRPC1P48995 MARVELD3-204ENST00000565261 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TRPC1P48995 FOXI2-201ENST00000388920 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TRPC1P48995 PPM1J-202ENST00000464951 2474 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.6 ms