Protein–RNA interactions for Protein: P48742

LHX1, LIM/homeobox protein Lhx1, humanhuman

Predictions only

Length 406 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LHX1P48742 FAM156B-202ENST00000509613 1701 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
LHX1P48742 DMTN-209ENST00000517600 1569 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
LHX1P48742 KIAA1147-202ENST00000536163 7296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
LHX1P48742 CU639417.3-201ENST00000624240 1404 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
LHX1P48742 CALCB-202ENST00000523376 2258 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
LHX1P48742 NSL1-201ENST00000366976 722 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
LHX1P48742 ADIRF-201ENST00000372013 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
LHX1P48742 ROR2-202ENST00000375715 2993 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
LHX1P48742 TMEM239-202ENST00000380585 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
LHX1P48742 MAGEC1-202ENST00000406005 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
LHX1P48742 AP006294.1-201ENST00000415407 339 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
LHX1P48742 NME2P1-201ENST00000426182 414 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
LHX1P48742 KRT18P43-201ENST00000469825 1281 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
LHX1P48742 C5orf66-202ENST00000507641 547 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
LHX1P48742 ZSCAN2-213ENST00000541040 965 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
LHX1P48742 AL110118.2-203ENST00000557574 554 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.74■□□□□ 0.27
LHX1P48742 LITAF-218ENST00000576036 603 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.74■□□□□ 0.27
LHX1P48742 DAB2IP-205ENST00000408936 6784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
LHX1P48742 ZCCHC3-201ENST00000500893 3354 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
LHX1P48742 RFC5-204ENST00000454402 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
LHX1P48742 GPAT2-201ENST00000359548 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
LHX1P48742 MYB-205ENST00000367814 3302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
LHX1P48742 FAM174A-201ENST00000312637 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
LHX1P48742 SLC2A4-204ENST00000571308 1768 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
LHX1P48742 CRK-202ENST00000398970 3675 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
LHX1P48742 WASF1-206ENST00000392588 3122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
LHX1P48742 NFATC4-222ENST00000555590 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
LHX1P48742 CYP2AB1P-202ENST00000454440 1456 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
LHX1P48742 TOM1-206ENST00000425375 2252 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
LHX1P48742 PRKD2-216ENST00000601806 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
LHX1P48742 AC063926.2-201ENST00000623766 1308 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
LHX1P48742 C14orf93-207ENST00000397382 1986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
LHX1P48742 FKBP1C-201ENST00000370659 1579 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
LHX1P48742 ZNF18-204ENST00000580306 2330 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
LHX1P48742 SH3RF1-201ENST00000284637 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
LHX1P48742 RPL18A-201ENST00000222247 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
LHX1P48742 EEF1B2-201ENST00000236957 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
LHX1P48742 LST1-202ENST00000303757 604 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
LHX1P48742 AL133267.1-201ENST00000398220 340 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
LHX1P48742 LINC01067-201ENST00000432575 664 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
LHX1P48742 FAM86LP-201ENST00000478302 853 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
LHX1P48742 AJ271736.1-201ENST00000483543 773 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
LHX1P48742 ELK1P1-201ENST00000485699 580 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
LHX1P48742 EVX1-AS-202ENST00000519050 576 ntTSL 4 BASIC16.73■□□□□ 0.27
LHX1P48742 AC008378.1-201ENST00000521251 496 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
LHX1P48742 RBM7-207ENST00000544582 692 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
LHX1P48742 SLC8B1-206ENST00000549069 1058 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
LHX1P48742 NFATC3-222ENST00000575270 3824 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
LHX1P48742 SHBG-212ENST00000575314 1146 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
LHX1P48742 AC027575.2-201ENST00000585258 1295 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
LHX1P48742 MIR8072-201ENST00000614241 80 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
LHX1P48742 AL031056.2-201ENST00000637957 1217 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
LHX1P48742 TK2-207ENST00000544898 3441 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
LHX1P48742 HMOX2-205ENST00000458134 1797 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
LHX1P48742 CISH-201ENST00000348721 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
LHX1P48742 ADAMTS13-206ENST00000371929 4934 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
LHX1P48742 DOC2GP-204ENST00000639052 2548 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
LHX1P48742 TMEM19-201ENST00000266673 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
LHX1P48742 KLK15-201ENST00000326856 1389 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
LHX1P48742 PARD3-206ENST00000374776 3389 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
LHX1P48742 DZIP1L-204ENST00000469243 2107 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
LHX1P48742 AL355493.2-201ENST00000568270 1395 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
LHX1P48742 TERT-202ENST00000334602 3210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
LHX1P48742 TNKS-211ENST00000520408 1964 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
LHX1P48742 CRAMP1-202ENST00000397412 7772 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
LHX1P48742 SLC44A1-203ENST00000374724 3088 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
LHX1P48742 CD300A-205ENST00000577511 1459 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
LHX1P48742 MYEOV-203ENST00000535407 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
LHX1P48742 BNC1-201ENST00000345382 4610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
LHX1P48742 BTD-207ENST00000449107 1820 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
LHX1P48742 SH2B1-203ENST00000359285 3033 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
LHX1P48742 NELFA-203ENST00000411638 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
LHX1P48742 TMED1-201ENST00000214869 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
LHX1P48742 CYB5R2-204ENST00000524790 1338 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
LHX1P48742 NAP1L4-201ENST00000380542 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
LHX1P48742 SLC39A8-201ENST00000356736 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
LHX1P48742 NUS1-201ENST00000368494 4676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
LHX1P48742 TK1-203ENST00000588734 1681 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
LHX1P48742 PNKD-202ENST00000258362 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
LHX1P48742 TPD52L2-201ENST00000217121 2362 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
LHX1P48742 SIX5-204ENST00000622857 1401 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
LHX1P48742 TBP-207ENST00000616883 1750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
LHX1P48742 EPHA10-203ENST00000427468 3167 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
LHX1P48742 DYNC1LI2-203ENST00000443351 1502 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
LHX1P48742 AL121723.1-201ENST00000445194 1519 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
LHX1P48742 ADORA1-203ENST00000367235 2219 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
LHX1P48742 DNAJA3-202ENST00000355296 2591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
LHX1P48742 PITPNA-202ENST00000539476 3612 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
LHX1P48742 EDN3-205ENST00000395654 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
LHX1P48742 VEZF1-202ENST00000581208 2321 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
LHX1P48742 CNTLN-202ENST00000380647 5576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
LHX1P48742 FOXR1-201ENST00000317011 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
LHX1P48742 SPATC1L-202ENST00000330205 1182 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
LHX1P48742 LCE3A-201ENST00000335674 270 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
LHX1P48742 DBNDD2-208ENST00000372723 1118 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
LHX1P48742 C10orf35-201ENST00000373279 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
LHX1P48742 RALGDS-205ENST00000393160 3801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
LHX1P48742 MIOX-203ENST00000395733 1021 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
LHX1P48742 TMEM210-201ENST00000413619 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
LHX1P48742 AC098850.1-201ENST00000419919 790 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67.9 ms