Protein–RNA interactions for Protein: P41229

KDM5C, Lysine-specific demethylase 5C, humanhuman

Predictions only

Length 1,560 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KDM5CP41229 DARS-AS1-209ENST00000594219 1420 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
KDM5CP41229 SEMA3B-213ENST00000618865 2925 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
KDM5CP41229 ASL-201ENST00000304874 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
KDM5CP41229 KPNA2-202ENST00000537025 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
KDM5CP41229 EPHX2-201ENST00000380476 2064 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
KDM5CP41229 SGPP2-201ENST00000321276 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
KDM5CP41229 CA12-203ENST00000422263 2556 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
KDM5CP41229 TUBBP5-203ENST00000508529 1334 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
KDM5CP41229 WDR45-202ENST00000356463 1688 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
KDM5CP41229 SLC25A46-201ENST00000355943 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
KDM5CP41229 FLII-221ENST00000578558 2377 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
KDM5CP41229 ABCG5-201ENST00000260645 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
KDM5CP41229 SMARCC2-202ENST00000347471 3839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
KDM5CP41229 PSMB5-202ENST00000361611 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
KDM5CP41229 PFDN6-202ENST00000374607 598 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
KDM5CP41229 PFDN6-203ENST00000374610 521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
KDM5CP41229 UFM1-202ENST00000379649 846 ntTSL 4 BASIC23.27■■□□□ 1.32
KDM5CP41229 NREP-204ENST00000419114 704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
KDM5CP41229 ARMCX3-AS1-201ENST00000454228 490 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
KDM5CP41229 PRSS30P-204ENST00000489864 650 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
KDM5CP41229 LRWD1-209ENST00000626402 138 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
KDM5CP41229 PFKP-202ENST00000381075 2769 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.31
KDM5CP41229 TBP-202ENST00000392092 1903 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
KDM5CP41229 LIN54-204ENST00000505397 2742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
KDM5CP41229 AHCYL1-202ENST00000369799 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
KDM5CP41229 MAGEA4-205ENST00000393920 1721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
KDM5CP41229 MUTYH-209ENST00000448481 1706 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
KDM5CP41229 MAGEA2-204ENST00000611674 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
KDM5CP41229 STX2-201ENST00000261653 3331 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
KDM5CP41229 ELAC2-203ENST00000426905 2671 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
KDM5CP41229 CNNM3-201ENST00000305510 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
KDM5CP41229 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
KDM5CP41229 ZNF408-201ENST00000311764 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
KDM5CP41229 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
KDM5CP41229 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
KDM5CP41229 TPM1-206ENST00000358278 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
KDM5CP41229 DYDC1-201ENST00000372202 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
KDM5CP41229 LINC01118-202ENST00000409912 1023 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
KDM5CP41229 MLPH-204ENST00000410032 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
KDM5CP41229 EEF1DP6-201ENST00000449232 372 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
KDM5CP41229 AC008267.1-201ENST00000474858 1069 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
KDM5CP41229 AC113383.1-201ENST00000514696 582 ntTSL 4 BASIC23.26■■□□□ 1.31
KDM5CP41229 AC239802.2-201ENST00000532137 554 ntTSL 4 BASIC23.26■■□□□ 1.31
KDM5CP41229 MIF4GD-208ENST00000579297 1419 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
KDM5CP41229 AC105105.3-201ENST00000585470 646 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
KDM5CP41229 FAAP24-204ENST00000590179 784 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
KDM5CP41229 KRTAP10-7-201ENST00000609664 1578 ntAPPRIS P1 BASIC23.26■■□□□ 1.31
KDM5CP41229 AC091544.8-201ENST00000619490 361 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
KDM5CP41229 DNAJC17-212ENST00000627802 428 ntTSL 4 BASIC23.26■■□□□ 1.31
KDM5CP41229 EDDM13-208ENST00000637802 854 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
KDM5CP41229 LTB4R2-202ENST00000528054 3092 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
KDM5CP41229 MGMT-201ENST00000306010 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
KDM5CP41229 FAM192A-201ENST00000309137 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
KDM5CP41229 FDX1-201ENST00000260270 3206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
KDM5CP41229 AIMP2-202ENST00000395236 860 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
KDM5CP41229 AL391832.2-201ENST00000418557 889 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
KDM5CP41229 AC114812.1-204ENST00000449669 728 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
KDM5CP41229 AC092944.1-202ENST00000487238 483 ntTSL 4 BASIC23.25■■□□□ 1.31
KDM5CP41229 AL391280.1-201ENST00000506969 1062 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
KDM5CP41229 TALDO1-203ENST00000528097 1231 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
KDM5CP41229 MRPL48-210ENST00000542303 661 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
KDM5CP41229 AP000808.2-201ENST00000542410 569 ntTSL 4 BASIC23.25■■□□□ 1.31
KDM5CP41229 ONECUT1-201ENST00000305901 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
KDM5CP41229 CCDC43-202ENST00000457422 2058 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
KDM5CP41229 PEX5-206ENST00000434354 2253 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
KDM5CP41229 C5orf30-201ENST00000319933 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
KDM5CP41229 IGLON5-201ENST00000270642 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
KDM5CP41229 GDF2-201ENST00000581492 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
KDM5CP41229 STRN4-202ENST00000391910 3628 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
KDM5CP41229 C16orf89-203ENST00000474471 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
KDM5CP41229 HNF1B-202ENST00000614313 1819 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
KDM5CP41229 HNF1B-203ENST00000617272 1820 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
KDM5CP41229 FAM120AOS-201ENST00000375412 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
KDM5CP41229 CRCP-204ENST00000398684 492 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
KDM5CP41229 PEX13-203ENST00000414712 1014 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
KDM5CP41229 GDAP1-202ENST00000434412 1228 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
KDM5CP41229 MSRA-203ENST00000441698 788 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
KDM5CP41229 C12orf73-211ENST00000553183 660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
KDM5CP41229 RN7SL555P-201ENST00000584742 339 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
KDM5CP41229 AC068790.8-201ENST00000618862 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
KDM5CP41229 TSC22D1-AS1-201ENST00000616360 2845 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
KDM5CP41229 CALCOCO2-211ENST00000508679 1396 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
KDM5CP41229 SAMM50-201ENST00000350028 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
KDM5CP41229 ZC3H12A-201ENST00000373087 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
KDM5CP41229 FAM32A-201ENST00000263384 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
KDM5CP41229 SERPINF2-203ENST00000450523 1462 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
KDM5CP41229 PRSS54-201ENST00000219301 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
KDM5CP41229 GLS-202ENST00000338435 4475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
KDM5CP41229 AC022188.1-201ENST00000620960 1664 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
KDM5CP41229 ATP6AP2-226ENST00000637526 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
KDM5CP41229 NRP1-203ENST00000374821 1988 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
KDM5CP41229 PLCXD2-204ENST00000477665 1721 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
KDM5CP41229 ERCC1-203ENST00000340192 949 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
KDM5CP41229 CD8B-204ENST00000393759 1096 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
KDM5CP41229 CHMP1AP1-201ENST00000445563 662 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
KDM5CP41229 HHIP-AS1-201ENST00000503066 897 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
KDM5CP41229 MCPH1-AS1-203ENST00000525186 869 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
KDM5CP41229 MANEAL-204ENST00000525897 1294 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
KDM5CP41229 AC007342.4-201ENST00000566383 584 ntTSL 4 BASIC23.23■■□□□ 1.31
KDM5CP41229 RN7SL774P-201ENST00000577467 290 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 88.4 ms