Protein–RNA interactions for Protein: P19075

TSPAN8, Tetraspanin-8, humanhuman

Predictions only

Length 237 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSPAN8P19075 RPN1-207ENST00000497289 2137 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TSPAN8P19075 NFATC4-213ENST00000554591 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TSPAN8P19075 RBPJ-205ENST00000355476 5990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TSPAN8P19075 CBLC-202ENST00000341505 1441 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TSPAN8P19075 AL691432.1-201ENST00000596308 1422 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
TSPAN8P19075 HID1-202ENST00000425042 3271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TSPAN8P19075 ILF3-AS1-201ENST00000591501 1983 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
TSPAN8P19075 ARAP2-201ENST00000303965 7514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TSPAN8P19075 DUSP22-202ENST00000419235 3098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TSPAN8P19075 ZNF212-201ENST00000335870 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TSPAN8P19075 MBD1-205ENST00000353909 2820 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TSPAN8P19075 PCDHA10-201ENST00000307360 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TSPAN8P19075 HMGA1-202ENST00000347617 1773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TSPAN8P19075 CYP4F22-201ENST00000269703 2641 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TSPAN8P19075 ARL15-201ENST00000502271 3248 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TSPAN8P19075 TBC1D10A-203ENST00000403362 1833 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TSPAN8P19075 MRPS16-201ENST00000372940 866 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TSPAN8P19075 ALKBH6-202ENST00000378875 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TSPAN8P19075 C6orf47-AS1-203ENST00000422049 673 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TSPAN8P19075 TTC28-AS1-213ENST00000434221 972 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TSPAN8P19075 PRSS21-202ENST00000450020 1106 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TSPAN8P19075 AKR1A1-204ENST00000471651 1018 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TSPAN8P19075 OR10S1-201ENST00000531945 1121 ntAPPRIS P2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TSPAN8P19075 AC131009.1-201ENST00000539078 426 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TSPAN8P19075 PAM16-215ENST00000577031 548 ntTSL 4 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TSPAN8P19075 OR10S1-202ENST00000641123 1121 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TSPAN8P19075 HARS2-206ENST00000508522 1562 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TSPAN8P19075 VWA2-202ENST00000392982 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TSPAN8P19075 BRD2-202ENST00000374831 4807 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TSPAN8P19075 CLN3-216ENST00000565316 1318 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TSPAN8P19075 CD14-202ENST00000401743 1648 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TSPAN8P19075 NR1H3-235ENST00000616973 1919 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TSPAN8P19075 TSC22D3-201ENST00000315660 2213 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TSPAN8P19075 GRB2-201ENST00000316615 3181 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TSPAN8P19075 ITGB2-207ENST00000397854 2592 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TSPAN8P19075 EIF2B3-201ENST00000360403 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TSPAN8P19075 AZI2-205ENST00000420543 1366 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TSPAN8P19075 ADD2-208ENST00000430656 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TSPAN8P19075 NPHP3-AS1-201ENST00000489343 2957 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TSPAN8P19075 AL136982.4-201ENST00000437689 1740 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
TSPAN8P19075 LRRC57-202ENST00000397130 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TSPAN8P19075 NR2E3-203ENST00000621098 2064 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TSPAN8P19075 RNF167-211ENST00000575111 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TSPAN8P19075 MECR-202ENST00000373791 2416 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TSPAN8P19075 DLGAP1-214ENST00000539435 2402 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TSPAN8P19075 SIN3B-201ENST00000248054 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TSPAN8P19075 TCP10-202ENST00000397829 2141 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TSPAN8P19075 ZNF497-201ENST00000311044 3468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TSPAN8P19075 LYPLA1-214ENST00000618741 2526 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TSPAN8P19075 ZBTB45P2-201ENST00000452245 1531 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
TSPAN8P19075 STEAP3-202ENST00000393107 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TSPAN8P19075 ATP6AP2-226ENST00000637526 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TSPAN8P19075 LPAR1-203ENST00000374431 3637 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TSPAN8P19075 SLC44A3-206ENST00000527077 1943 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TSPAN8P19075 MAP2K7-201ENST00000397979 3361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TSPAN8P19075 TPBG-202ENST00000535040 3392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TSPAN8P19075 REXO1L1P-202ENST00000608646 1974 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
TSPAN8P19075 UBAP1-201ENST00000297661 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TSPAN8P19075 MAP4K1-210ENST00000591517 2700 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TSPAN8P19075 NKG7-201ENST00000221978 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TSPAN8P19075 LTC4S-201ENST00000292596 666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TSPAN8P19075 DPY30-201ENST00000295066 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TSPAN8P19075 CRYBA2-201ENST00000295728 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TSPAN8P19075 TPM2-201ENST00000329305 1018 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TSPAN8P19075 DPY30-202ENST00000342166 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TSPAN8P19075 HNRNPA1P28-201ENST00000424481 961 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
TSPAN8P19075 AC139887.2-202ENST00000507446 534 ntTSL 4 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TSPAN8P19075 AC010226.1-202ENST00000508517 539 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TSPAN8P19075 RNA5SP410-201ENST00000516285 106 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
TSPAN8P19075 REPIN1-217ENST00000518514 478 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TSPAN8P19075 DYNLL1-204ENST00000548214 616 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TSPAN8P19075 AC024592.3-202ENST00000586349 506 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TSPAN8P19075 AC006116.8-201ENST00000587004 987 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TSPAN8P19075 AC010618.3-201ENST00000596643 775 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TSPAN8P19075 NKG7-205ENST00000600427 520 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TSPAN8P19075 CKMT1B-215ENST00000627381 1074 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TSPAN8P19075 AC092902.6-201ENST00000641783 218 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
TSPAN8P19075 KCTD15-201ENST00000284006 4918 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TSPAN8P19075 ENDOV-204ENST00000518137 2815 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TSPAN8P19075 RASGEF1C-206ENST00000522500 2055 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TSPAN8P19075 MKS1-204ENST00000537529 2083 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TSPAN8P19075 AIFM2-201ENST00000307864 3243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TSPAN8P19075 NOS1AP-205ENST00000493151 5559 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TSPAN8P19075 C18orf15-201ENST00000623680 2534 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
TSPAN8P19075 EIF5A-206ENST00000571955 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TSPAN8P19075 SLC17A3-202ENST00000360657 1750 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TSPAN8P19075 RASGRF1-203ENST00000558480 6237 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TSPAN8P19075 CBLN4-201ENST00000064571 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TSPAN8P19075 P4HA2-201ENST00000166534 2230 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TSPAN8P19075 MPL-202ENST00000413998 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TSPAN8P19075 MTFMT-201ENST00000220058 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TSPAN8P19075 KCP-208ENST00000620378 4515 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
TSPAN8P19075 FRMPD4-201ENST00000380682 8465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
TSPAN8P19075 RBFOX1-205ENST00000436368 1530 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
TSPAN8P19075 DUSP6-202ENST00000308385 1959 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
TSPAN8P19075 TUBB3-206ENST00000554444 1978 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
TSPAN8P19075 NTRK3-203ENST00000357724 2980 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
TSPAN8P19075 TIRAP-203ENST00000392680 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
TSPAN8P19075 KRT27-201ENST00000301656 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
TSPAN8P19075 MAPKAPK5-207ENST00000551404 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.8 ms