Protein–RNA interactions for Protein: P11230

CHRNB1, Acetylcholine receptor subunit beta, humanhuman

Predictions only

Length 501 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNB1P11230 AC005252.2-201ENST00000624630 1141 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
CHRNB1P11230 AC247036.4-201ENST00000632099 353 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CHRNB1P11230 GCLC-213ENST00000616923 3694 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CHRNB1P11230 IKBIP-201ENST00000299157 3189 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CHRNB1P11230 ATP6V0E2-AS1-201ENST00000461019 2973 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CHRNB1P11230 PGR-209ENST00000617858 2816 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CHRNB1P11230 TBC1D4-202ENST00000377636 6364 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CHRNB1P11230 LRRN4-201ENST00000378858 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CHRNB1P11230 THOC5-202ENST00000397871 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CHRNB1P11230 ERLEC1-201ENST00000185150 2433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CHRNB1P11230 TTC8-202ENST00000345383 2329 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CHRNB1P11230 TRIM33-201ENST00000358465 8339 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CHRNB1P11230 MFSD2A-201ENST00000372809 2173 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CHRNB1P11230 PIGT-207ENST00000543458 2037 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CHRNB1P11230 STAC-201ENST00000273183 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CHRNB1P11230 SBSN-201ENST00000452271 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CHRNB1P11230 AGBL5-202ENST00000360131 3177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CHRNB1P11230 PLEKHG6-203ENST00000396988 2963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CHRNB1P11230 BSG-204ENST00000545507 1795 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CHRNB1P11230 IDH3G-203ENST00000370093 1662 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CHRNB1P11230 RIBC2-202ENST00000614167 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CHRNB1P11230 PSMD2-201ENST00000310118 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CHRNB1P11230 THEM4-201ENST00000368814 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CHRNB1P11230 AIFM3-201ENST00000399163 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CHRNB1P11230 AC012531.2-201ENST00000512206 1389 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CHRNB1P11230 MCHR2-202ENST00000369212 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CHRNB1P11230 COMT-205ENST00000406520 1339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CHRNB1P11230 RPL18A-201ENST00000222247 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CHRNB1P11230 MRPL58-201ENST00000301585 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CHRNB1P11230 SPDYE7P-201ENST00000355920 1064 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CHRNB1P11230 STMN1-201ENST00000357865 1137 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CHRNB1P11230 RBM8A-201ENST00000369307 796 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CHRNB1P11230 SELENOM-202ENST00000402395 1054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CHRNB1P11230 AC096536.1-201ENST00000443284 440 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CHRNB1P11230 TMEM147-AS1-201ENST00000444728 487 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CHRNB1P11230 RPL13AP20-201ENST00000459725 609 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
CHRNB1P11230 AC106760.1-201ENST00000508690 800 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
CHRNB1P11230 AC021491.2-201ENST00000513017 607 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CHRNB1P11230 ZNF767P-206ENST00000513792 565 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
CHRNB1P11230 SNHG9-201ENST00000531523 275 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CHRNB1P11230 AC009542.2-202ENST00000619004 1067 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
CHRNB1P11230 AC244517.4-201ENST00000624549 580 ntTSL 4 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CHRNB1P11230 GRIN2C-202ENST00000347612 2929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CHRNB1P11230 FAM227B-201ENST00000299338 2008 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CHRNB1P11230 C8orf49-201ENST00000525043 1968 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
CHRNB1P11230 CHRNA7-207ENST00000635884 1975 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CHRNB1P11230 CD19-201ENST00000324662 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CHRNB1P11230 TSEN2-207ENST00000454502 1909 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CHRNB1P11230 UBALD1-205ENST00000590891 2641 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
CHRNB1P11230 CALHM2-202ENST00000369788 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CHRNB1P11230 TRAPPC8-210ENST00000582513 3205 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CHRNB1P11230 PPP1R21-202ENST00000294952 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CHRNB1P11230 U2AF2-201ENST00000308924 1698 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CHRNB1P11230 HNF1A-215ENST00000615446 2344 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CHRNB1P11230 MEGF9-201ENST00000373930 6298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CHRNB1P11230 MYH14-202ENST00000376970 6787 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CHRNB1P11230 HMBS-209ENST00000537841 1559 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CHRNB1P11230 ETV7-207ENST00000620358 1599 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CHRNB1P11230 SLC41A3-203ENST00000360370 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CHRNB1P11230 RGS3-210ENST00000462143 2759 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CHRNB1P11230 ZBTB45P2-201ENST00000452245 1531 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
CHRNB1P11230 PODXL-202ENST00000378555 2105 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CHRNB1P11230 ANKRD24-202ENST00000318934 3906 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CHRNB1P11230 NRXN1-209ENST00000405581 5078 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CHRNB1P11230 VIPR1-217ENST00000543411 2681 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CHRNB1P11230 RMND1-205ENST00000622845 1484 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CHRNB1P11230 SLCO5A1-206ENST00000530307 2630 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CHRNB1P11230 GBA2-202ENST00000378094 3757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CHRNB1P11230 SLC25A2-201ENST00000239451 1417 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CHRNB1P11230 SLC22A16-202ENST00000368919 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CHRNB1P11230 NPL-204ENST00000367554 3027 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CHRNB1P11230 TBCEL-205ENST00000529397 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CHRNB1P11230 DIO3OS-208ENST00000556120 2473 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CHRNB1P11230 GALNT9-201ENST00000328957 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CHRNB1P11230 PLA2G2D-202ENST00000617227 1856 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CHRNB1P11230 SGPP1-201ENST00000247225 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CHRNB1P11230 NAT8-201ENST00000272425 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CHRNB1P11230 NDUFC1-203ENST00000394228 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CHRNB1P11230 MASP2-202ENST00000400898 726 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CHRNB1P11230 NCBP2-203ENST00000422610 676 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CHRNB1P11230 AC018685.1-201ENST00000457813 368 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CHRNB1P11230 RCAN1-212ENST00000492600 935 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CHRNB1P11230 SLED1-202ENST00000512051 380 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
CHRNB1P11230 AP002748.3-205ENST00000525142 567 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CHRNB1P11230 AP002748.3-203ENST00000533502 581 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CHRNB1P11230 KRT90P-201ENST00000549264 1064 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
CHRNB1P11230 AC090502.1-201ENST00000549905 748 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CHRNB1P11230 AC090502.1-204ENST00000551210 469 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CHRNB1P11230 AL583722.2-201ENST00000557223 663 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CHRNB1P11230 DUX4L45-201ENST00000566406 1057 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
CHRNB1P11230 AC243960.2-201ENST00000600996 747 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
CHRNB1P11230 METTL26-214ENST00000614890 801 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CHRNB1P11230 RHOXF1P1-202ENST00000635473 501 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
CHRNB1P11230 TMTC2-201ENST00000321196 5681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CHRNB1P11230 NFIX-210ENST00000588228 1692 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CHRNB1P11230 ANAPC2-201ENST00000323927 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CHRNB1P11230 LSP1-204ENST00000406638 2640 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CHRNB1P11230 GATA4-206ENST00000528712 2614 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CHRNB1P11230 ALPI-201ENST00000295463 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CHRNB1P11230 MPV17L-201ENST00000287594 5820 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.4 ms