Protein–RNA interactions for Protein: P01920

HLA-DQB1, HLA class II histocompatibility antigen, DQ beta 1 chain, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HLA-DQB1P01920 AC091076.1-201ENST00000610741 619 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
HLA-DQB1P01920 Metazoa_SRP.33-201ENST00000613468 285 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
HLA-DQB1P01920 ESRP2-202ENST00000473183 3793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
HLA-DQB1P01920 AMT-202ENST00000395338 1831 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
HLA-DQB1P01920 YTHDF2-201ENST00000373812 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
HLA-DQB1P01920 GRM7-203ENST00000389336 2901 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
HLA-DQB1P01920 KCMF1-201ENST00000409785 7568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
HLA-DQB1P01920 MKRN3-201ENST00000314520 2337 ntAPPRIS P1 BASIC13.75□□□□□ -0.21
HLA-DQB1P01920 RASAL2-AS1-202ENST00000421505 2329 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
HLA-DQB1P01920 ZSCAN32-215ENST00000618425 2788 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
HLA-DQB1P01920 GCFC2-201ENST00000321027 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
HLA-DQB1P01920 LINC02395-201ENST00000546821 3157 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
HLA-DQB1P01920 AC006504.4-201ENST00000592118 1568 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
HLA-DQB1P01920 CAMKK2-203ENST00000347034 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
HLA-DQB1P01920 ARHGAP39-201ENST00000276826 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
HLA-DQB1P01920 WDR77-201ENST00000235090 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
HLA-DQB1P01920 GMPPA-204ENST00000373908 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
HLA-DQB1P01920 NDUFV1-202ENST00000415352 1512 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
HLA-DQB1P01920 AC012569.1-201ENST00000591191 1524 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
HLA-DQB1P01920 BBS2-201ENST00000245157 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
HLA-DQB1P01920 SV2A-201ENST00000369145 2903 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
HLA-DQB1P01920 ITPKB-201ENST00000272117 5822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
HLA-DQB1P01920 BTN1A1-201ENST00000244513 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
HLA-DQB1P01920 KHK-201ENST00000260598 2397 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
HLA-DQB1P01920 SCAMP4-202ENST00000409472 2394 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
HLA-DQB1P01920 CICP17-201ENST00000418553 2377 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
HLA-DQB1P01920 HSD17B7P2-202ENST00000494540 1401 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
HLA-DQB1P01920 ANKRD50-202ENST00000515641 4212 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
HLA-DQB1P01920 MAMSTR-201ENST00000318083 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
HLA-DQB1P01920 EIF4A1-201ENST00000293831 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
HLA-DQB1P01920 GOLGA2P10-204ENST00000618004 1349 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
HLA-DQB1P01920 MCL1-202ENST00000369026 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
HLA-DQB1P01920 ABCG1-203ENST00000361802 3034 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
HLA-DQB1P01920 RAB2A-201ENST00000262646 3848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
HLA-DQB1P01920 UBXN10-AS1-201ENST00000442226 510 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
HLA-DQB1P01920 AC093724.1-201ENST00000448659 1027 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
HLA-DQB1P01920 RAB42-202ENST00000465518 857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
HLA-DQB1P01920 AC106771.1-201ENST00000502209 372 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
HLA-DQB1P01920 MTRF1LP2-201ENST00000506027 1122 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
HLA-DQB1P01920 MCRIP1-211ENST00000576679 751 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
HLA-DQB1P01920 AL355877.3-201ENST00000622820 899 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
HLA-DQB1P01920 AL513523.2-201ENST00000633218 660 ntTSL 3 BASIC13.74□□□□□ -0.21
HLA-DQB1P01920 OR4C6-202ENST00000641251 1058 ntAPPRIS P1 BASIC13.74□□□□□ -0.21
HLA-DQB1P01920 FGD5-AS1-202ENST00000424349 3792 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
HLA-DQB1P01920 ARPC4-TTLL3-201ENST00000397256 2466 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
HLA-DQB1P01920 IMPDH1-201ENST00000338791 2881 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
HLA-DQB1P01920 IMPDH1-217ENST00000626419 2862 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
HLA-DQB1P01920 ANO10-213ENST00000451430 2019 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
HLA-DQB1P01920 CNOT10-201ENST00000328834 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
HLA-DQB1P01920 TRIM41-201ENST00000315073 3637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
HLA-DQB1P01920 DAB2IP-205ENST00000408936 6784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
HLA-DQB1P01920 CHN2-201ENST00000222792 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
HLA-DQB1P01920 NLGN4X-203ENST00000381093 5865 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
HLA-DQB1P01920 STRA6-205ENST00000432245 1889 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
HLA-DQB1P01920 WAC-AS1-202ENST00000528337 2608 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
HLA-DQB1P01920 MBD1-203ENST00000339998 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
HLA-DQB1P01920 TCAF1P1-201ENST00000414990 2232 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
HLA-DQB1P01920 LRRFIP1P1-201ENST00000498774 2246 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
HLA-DQB1P01920 LINC01138-206ENST00000622328 2212 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
HLA-DQB1P01920 ADAMTS18-201ENST00000282849 5913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
HLA-DQB1P01920 CYP51A1P2-201ENST00000419457 1499 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
HLA-DQB1P01920 DDX49-201ENST00000247003 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
HLA-DQB1P01920 ELAVL3-201ENST00000359227 4729 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC13.73□□□□□ -0.21
HLA-DQB1P01920 TRMT1-201ENST00000221504 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
HLA-DQB1P01920 MBD1-209ENST00000398495 2178 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
HLA-DQB1P01920 SLC30A5-209ENST00000621204 3999 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
HLA-DQB1P01920 YME1L1-202ENST00000375972 2517 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
HLA-DQB1P01920 FURIN-207ENST00000618099 4345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
HLA-DQB1P01920 PLEKHN1-202ENST00000379409 2455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
HLA-DQB1P01920 CICP20-201ENST00000443330 2801 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
HLA-DQB1P01920 MPHOSPH10-205ENST00000498451 2068 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
HLA-DQB1P01920 CDYL2-203ENST00000562812 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
HLA-DQB1P01920 CDYL2-204ENST00000563890 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
HLA-DQB1P01920 CDYL2-205ENST00000566173 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
HLA-DQB1P01920 DPEP1-202ENST00000393092 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
HLA-DQB1P01920 IRF8-203ENST00000563180 1394 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
HLA-DQB1P01920 PAN3-AS1-201ENST00000563843 1351 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
HLA-DQB1P01920 DLX4-201ENST00000240306 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
HLA-DQB1P01920 ATP6V1H-202ENST00000359530 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
HLA-DQB1P01920 FGD2-201ENST00000274963 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
HLA-DQB1P01920 CFLAR-214ENST00000443227 1679 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
HLA-DQB1P01920 NEDD4L-202ENST00000356462 3335 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
HLA-DQB1P01920 LINC02415-201ENST00000508505 1315 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
HLA-DQB1P01920 BICD1-205ENST00000550207 1328 ntTSL 3 BASIC13.73□□□□□ -0.21
HLA-DQB1P01920 AC134407.2-201ENST00000625089 1978 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
HLA-DQB1P01920 TMEM30A-201ENST00000230461 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
HLA-DQB1P01920 CEP76-201ENST00000262127 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
HLA-DQB1P01920 TAGLN2-202ENST00000368096 1603 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
HLA-DQB1P01920 MRPL52-202ENST00000355151 1118 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
HLA-DQB1P01920 PHPT1-202ENST00000371661 985 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
HLA-DQB1P01920 MRPL52-203ENST00000397496 1111 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
HLA-DQB1P01920 CRELD2-202ENST00000403427 1242 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
HLA-DQB1P01920 AL022314.1-201ENST00000414203 464 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
HLA-DQB1P01920 AL136988.1-201ENST00000414640 1029 ntTSL 3 BASIC13.73□□□□□ -0.21
HLA-DQB1P01920 SEC61G-203ENST00000415949 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
HLA-DQB1P01920 FOSL1P1-201ENST00000511041 816 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
HLA-DQB1P01920 MSRA-206ENST00000521209 814 ntTSL 3 BASIC13.73□□□□□ -0.21
HLA-DQB1P01920 EFCAB11-211ENST00000556609 568 ntTSL 3 BASIC13.73□□□□□ -0.21
HLA-DQB1P01920 RMI2-205ENST00000576027 818 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
HLA-DQB1P01920 TMEM97-205ENST00000583381 578 ntTSL 4 BASIC13.73□□□□□ -0.21
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