Protein–RNA interactions for Protein: O95273

CCNDBP1, Cyclin-D1-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 360 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCNDBP1O95273 NLE1-202ENST00000442241 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCNDBP1O95273 UGT8-201ENST00000310836 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCNDBP1O95273 ZNF197-203ENST00000383744 1989 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCNDBP1O95273 PSMD13-212ENST00000532097 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCNDBP1O95273 ANKRD26P3-201ENST00000454044 2748 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
CCNDBP1O95273 C14orf79-205ENST00000549240 2503 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCNDBP1O95273 Z98749.3-201ENST00000400206 1770 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCNDBP1O95273 TSPEAR-202ENST00000397916 2114 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCNDBP1O95273 WDR61-201ENST00000267973 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCNDBP1O95273 MPL-201ENST00000372470 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCNDBP1O95273 TNN-201ENST00000239462 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCNDBP1O95273 AC069224.1-201ENST00000566372 1715 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
CCNDBP1O95273 ADSL-220ENST00000636714 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCNDBP1O95273 RHOBTB2-206ENST00000522948 4959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCNDBP1O95273 PIPOX-201ENST00000323372 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCNDBP1O95273 ZBTB45P2-201ENST00000452245 1531 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
CCNDBP1O95273 CASK-202ENST00000378158 3848 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCNDBP1O95273 SLC43A2-204ENST00000571650 3261 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCNDBP1O95273 MFGE8-215ENST00000566497 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCNDBP1O95273 SLC39A1-203ENST00000368621 2398 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCNDBP1O95273 SLC6A8-201ENST00000253122 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCNDBP1O95273 ATE1-209ENST00000543447 4826 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCNDBP1O95273 AKAP12-201ENST00000253332 6597 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCNDBP1O95273 ADAM22-204ENST00000398204 9334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCNDBP1O95273 ATP6V1B2-201ENST00000276390 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCNDBP1O95273 ATP11A-AS1-201ENST00000446442 2192 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCNDBP1O95273 SUSD4-204ENST00000366878 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCNDBP1O95273 TPD52L2-205ENST00000352482 2339 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCNDBP1O95273 TPD52L2-210ENST00000615907 2310 ntTSL 4 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCNDBP1O95273 ANKHD1-202ENST00000297183 7606 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCNDBP1O95273 PHRF1-203ENST00000416188 5227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCNDBP1O95273 AHCY-201ENST00000217426 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCNDBP1O95273 NBL1-201ENST00000289749 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCNDBP1O95273 ZNF524-201ENST00000301073 1102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCNDBP1O95273 ZUFSP-201ENST00000368573 1225 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCNDBP1O95273 WRB-204ENST00000398753 699 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCNDBP1O95273 SERBP1P3-201ENST00000459980 809 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
CCNDBP1O95273 SATB1-217ENST00000493952 626 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCNDBP1O95273 RPL28-205ENST00000558131 444 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCNDBP1O95273 AC104985.1-201ENST00000587528 507 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCNDBP1O95273 AL158211.3-201ENST00000607385 239 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
CCNDBP1O95273 AC073592.8-201ENST00000624126 511 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
CCNDBP1O95273 DBI-212ENST00000627305 620 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCNDBP1O95273 DYNLL2-201ENST00000579991 6805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCNDBP1O95273 NACAD-202ENST00000490531 4780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCNDBP1O95273 FAM208A-201ENST00000355628 5239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCNDBP1O95273 CCDC8-201ENST00000307522 3213 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCNDBP1O95273 OSBPL6-203ENST00000357080 2217 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCNDBP1O95273 CASR-202ENST00000498619 5009 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCNDBP1O95273 PPP1R26-206ENST00000605660 4502 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCNDBP1O95273 TACR2-203ENST00000619173 1713 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCNDBP1O95273 FAM227B-201ENST00000299338 2008 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCNDBP1O95273 IL11RA-215ENST00000602473 1388 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCNDBP1O95273 ACOXL-201ENST00000340561 2188 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCNDBP1O95273 AVL9-201ENST00000318709 6982 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCNDBP1O95273 ORAOV1-201ENST00000279147 2478 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCNDBP1O95273 GGT6-204ENST00000574154 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCNDBP1O95273 SLC1A7-204ENST00000611397 2499 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCNDBP1O95273 MARCH2-208ENST00000602117 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCNDBP1O95273 DPYSL3-201ENST00000343218 5476 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CCNDBP1O95273 NTRK3-202ENST00000355254 2938 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CCNDBP1O95273 GFOD2-203ENST00000602377 1991 ntTSL 4 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CCNDBP1O95273 SERTAD1-201ENST00000357949 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CCNDBP1O95273 RFPL2-203ENST00000400237 2407 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CCNDBP1O95273 OSGIN2-202ENST00000451899 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CCNDBP1O95273 KIAA0368-201ENST00000259335 7391 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CCNDBP1O95273 FDPS-201ENST00000356657 1478 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CCNDBP1O95273 GNB4-201ENST00000232564 6434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CCNDBP1O95273 ACOT7-204ENST00000377855 1614 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CCNDBP1O95273 SLC17A3-202ENST00000360657 1750 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CCNDBP1O95273 KITLG-202ENST00000347404 1948 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CCNDBP1O95273 AC011477.6-201ENST00000604980 1927 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
CCNDBP1O95273 CNPPD1-202ENST00000409789 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CCNDBP1O95273 TMPRSS4-201ENST00000437212 2074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CCNDBP1O95273 FUS-201ENST00000254108 5119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CCNDBP1O95273 DGAT1-206ENST00000528718 3711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CCNDBP1O95273 XPO1-201ENST00000401558 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CCNDBP1O95273 H2AFY-202ENST00000312469 1859 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CCNDBP1O95273 CRAT-201ENST00000318080 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CCNDBP1O95273 NKAIN2-201ENST00000368416 1106 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CCNDBP1O95273 RIMS3-201ENST00000372683 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CCNDBP1O95273 TAS2R41-201ENST00000408916 924 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CCNDBP1O95273 SPDYE17-201ENST00000412399 783 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
CCNDBP1O95273 YAE1D1-202ENST00000432096 968 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CCNDBP1O95273 ELP6-209ENST00000446787 894 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CCNDBP1O95273 ZIC4-214ENST00000491672 925 ntTSL 4 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CCNDBP1O95273 SQSTM1-213ENST00000510187 1714 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CCNDBP1O95273 UBE2V2-201ENST00000517630 612 ntTSL 4 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CCNDBP1O95273 ZCCHC18-203ENST00000537356 2907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CCNDBP1O95273 AC026803.2-201ENST00000599784 819 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CCNDBP1O95273 AL133215.2-201ENST00000609242 977 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
CCNDBP1O95273 AQP12B-206ENST00000621682 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CCNDBP1O95273 AC073324.2-201ENST00000626532 2941 ntTSL 4 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CCNDBP1O95273 BCL2L11-219ENST00000619294 5132 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CCNDBP1O95273 SLC4A2-214ENST00000485713 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CCNDBP1O95273 TUBGCP2-204ENST00000417178 4029 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CCNDBP1O95273 GDF2-201ENST00000581492 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CCNDBP1O95273 CLCNKB-204ENST00000619181 1544 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CCNDBP1O95273 MECR-201ENST00000263702 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CCNDBP1O95273 FO538757.1-201ENST00000623083 1397 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.8 ms