Protein–RNA interactions for Protein: O60809

PRAMEF10, PRAME family member 10, humanhuman

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Length 474 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRAMEF10O60809 TLE2-203ENST00000443826 2238 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PRAMEF10O60809 AL445931.1-201ENST00000412181 2112 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PRAMEF10O60809 KIAA1211-203ENST00000504228 4628 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PRAMEF10O60809 ATRNL1-201ENST00000355044 8479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PRAMEF10O60809 MMP15-201ENST00000219271 4250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PRAMEF10O60809 TPM1-201ENST00000267996 1670 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PRAMEF10O60809 NSUN5-202ENST00000310326 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PRAMEF10O60809 NSMF-205ENST00000371474 3571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PRAMEF10O60809 NSMF-208ENST00000437259 3577 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PRAMEF10O60809 TMEM101-201ENST00000206380 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PRAMEF10O60809 AL592424.1-201ENST00000563624 1536 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
PRAMEF10O60809 ANKK1-201ENST00000303941 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PRAMEF10O60809 PCDHA6-203ENST00000529310 5374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PRAMEF10O60809 KHK-202ENST00000260599 2411 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PRAMEF10O60809 SIK3-201ENST00000375300 6213 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PRAMEF10O60809 MYCBPAP-203ENST00000436259 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PRAMEF10O60809 CD164L2-203ENST00000374030 993 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PRAMEF10O60809 IDH3B-202ENST00000380851 1230 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PRAMEF10O60809 IGHV3-7-201ENST00000390598 430 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PRAMEF10O60809 RBM39-205ENST00000397370 612 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PRAMEF10O60809 AC007388.1-210ENST00000415640 458 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PRAMEF10O60809 RN7SL618P-201ENST00000477850 296 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
PRAMEF10O60809 TMEM5-AS1-201ENST00000546214 563 ntTSL 4 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PRAMEF10O60809 MRPL52-211ENST00000555536 451 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PRAMEF10O60809 AC024267.1-201ENST00000582320 895 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
PRAMEF10O60809 AL031056.2-201ENST00000637957 1217 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PRAMEF10O60809 MAN1C1-203ENST00000374332 4641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PRAMEF10O60809 MAN1C1-208ENST00000611903 4647 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PRAMEF10O60809 CHST3-201ENST00000373115 6970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PRAMEF10O60809 AL596087.1-201ENST00000400979 1969 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
PRAMEF10O60809 BBS5-201ENST00000295240 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PRAMEF10O60809 DIABLO-208ENST00000464942 2569 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PRAMEF10O60809 GTF2H2C-201ENST00000380729 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PRAMEF10O60809 TBC1D10A-203ENST00000403362 1833 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PRAMEF10O60809 ADAM6-201ENST00000606026 1843 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PRAMEF10O60809 MAPKAP1-206ENST00000373511 3252 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PRAMEF10O60809 ZSWIM8-201ENST00000398706 6062 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
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PRAMEF10O60809 APH1A-204ENST00000414276 1718 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PRAMEF10O60809 AC069281.2-201ENST00000485071 4401 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PRAMEF10O60809 JPH4-202ENST00000397118 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PRAMEF10O60809 MARCH2-208ENST00000602117 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PRAMEF10O60809 TPD52L2-204ENST00000351424 2302 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PRAMEF10O60809 ACOT7-204ENST00000377855 1614 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PRAMEF10O60809 ZCCHC18-203ENST00000537356 2907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
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PRAMEF10O60809 RBPJ-205ENST00000355476 5990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PRAMEF10O60809 CDH15-201ENST00000289746 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PRAMEF10O60809 AADAT-208ENST00000515480 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PRAMEF10O60809 LCMT2-202ENST00000567039 1545 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PRAMEF10O60809 NTNG1-202ENST00000370065 1485 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PRAMEF10O60809 PRRT3-202ENST00000411976 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PRAMEF10O60809 LSS-205ENST00000457828 4390 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PRAMEF10O60809 TUBB4A-201ENST00000264071 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PRAMEF10O60809 BORCS8-MEF2B-203ENST00000514819 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PRAMEF10O60809 AC105917.1-201ENST00000506637 2539 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
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PRAMEF10O60809 PRDM8-201ENST00000339711 4095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PRAMEF10O60809 VIPR1-204ENST00000438259 2427 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
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PRAMEF10O60809 UCKL1-201ENST00000354216 1837 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PRAMEF10O60809 GNB4-201ENST00000232564 6434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
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PRAMEF10O60809 IFITM2-204ENST00000533141 588 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PRAMEF10O60809 CSF1R-209ENST00000543093 921 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PRAMEF10O60809 AC091544.3-201ENST00000556424 531 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
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PRAMEF10O60809 AL136982.4-201ENST00000437689 1740 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
PRAMEF10O60809 PTPN11-201ENST00000351677 6101 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PRAMEF10O60809 NTRK2-205ENST00000376208 8178 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PRAMEF10O60809 LINC00554-201ENST00000564841 3011 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
PRAMEF10O60809 MIR155HG-201ENST00000456917 1600 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PRAMEF10O60809 SCART1-206ENST00000640237 4351 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PRAMEF10O60809 AC097376.2-201ENST00000608661 2510 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PRAMEF10O60809 PSMF1-201ENST00000246015 2042 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PRAMEF10O60809 AC104407.1-201ENST00000511017 1568 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PRAMEF10O60809 CD34-202ENST00000356522 2874 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PRAMEF10O60809 AHDC1-201ENST00000247087 6334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PRAMEF10O60809 FBLIM1-206ENST00000441801 1543 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PRAMEF10O60809 EIF2B3-210ENST00000620860 1923 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PRAMEF10O60809 ITGA3-202ENST00000320031 4888 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PRAMEF10O60809 BTBD7P1-201ENST00000447253 1453 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
PRAMEF10O60809 NEO1-206ENST00000558964 4441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PRAMEF10O60809 HHATL-205ENST00000441594 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PRAMEF10O60809 CARD10-201ENST00000251973 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PRAMEF10O60809 C15orf52-202ENST00000397536 4717 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
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